Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Molekylær epidemiologi af hepatitis B i Cayenne General Hospital, Fransk Guyana

11. maj 2021 opdateret af: Centre Hospitalier de Cayenne
I Sydamerika er forekomsten af ​​HBV variabel, men høj (> 8%) i Amazonas-bassinet. I nogle områder er en tredjedel af HBsAg-bærere også inficeret med HDV, en væsentlig komorbiditetsfaktor. Pre-core mutationerne er forbundet med den negative HBe Ag fænotype, som er forbundet med et mere alvorligt forløb. Disse mutationer er af stigende og høj frekvens. Fransk Guyana er befolket af populationer af afrikansk, europæisk og asiatisk oprindelse med kæder af viral transmission, som ikke er kendt, og vira sandsynligvis af forskellig oprindelse med varierende virulens og transmissionspotentialer.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Menneskelig demografi og migrationer spiller en afgørende rolle i phylogeografien af ​​virale populationer. Hepatitis B-vira er kendetegnet ved en høj genetisk diversitet, som er et resultat af, at denne virus bruger en revers transkriptase under sin replikationscyklus, hvilket inducerer fejl og derfor variation. Et dusin genotyper er indtil videre blevet beskrevet og er underopdelt i sub-genotyper, som har en distinkt etnogografisk fordeling. Genotype A og D er allestedsnærværende og repræsenterer de mest almindelige genotyper i Europa; genotype B og C er meget almindelige i Asien og Oceanien, genotype E i Centralafrika og Vestafrika, genotype H og F i Latinamerika og Alaska, og genotype I i Sydøstasien. Populationerne, der stammer fra disse forskellige kontinenter, er alle repræsenteret i Guyana, og det er derfor interessant at forstå, hvad er transmissionskæderne og de fylodynamiske aspekter af epidemien i Fransk Guyana. Derudover har de forskellige genotyper variable kliniske konsekvenser, og dette på forskellige måder afhængig af værtens etnicitet. I Mexico ser F- og H-genotyperne således ud til at være ret godartede hos indianerne, blandt hvem de har cirkuleret i lang tid. På den anden side er genotyperne F, A og D af temmelig alvorlig udvikling hos mexicanere af kaukasisk oprindelse, hvilket tyder på, at værtens immunogenetiske faktorer er vigtige determinanter for virussenes patogene kraft (Roman og al WJG 2014).

Nogle præ-kerne mutationer efterlader virussen med kapacitet til at replikere. Fraværet af HBe-antigenet fratager immunsystemet et vigtigt mål, og virussen kan derfor fortsætte med at replikere. Disse præ-kerne mutationer er forbundet med den HBe Ag negative fænotype (7 til 30 % af patienterne), som er forbundet med et mere alvorligt forløb af kronisk hepatitis. Disse mutationer er af stigende og høj frekvens (Funk ML, og al 2001).

Afhængighed af crack-kokain er udbredt i Fransk Guyana og ser ud til at være en af ​​årsagerne bag epidemien. De rør, der bruges til at ryge crack forårsager forbrændinger på læberne, og ved deling af røret kan det bidrage til at øge risikoen for overførsel (Fischer og al 2008). Risikofyldt seksuel adfærd er forbundet med brugen af ​​crack-kokain, hvilket tyder på, at der kan være specifikke transmissionskæder omkring crack-brugere.

Primært mål Identificere de faktorer, der er forbundet med forskellige genotyper (alder, køn, fødeland, seksuel orientering, seksuel risikotagning, begrebet IV-stofmisbrug, crack ...) for at identificere specifikke smittekæder i Fransk Guyana.

Sekundære mål

  • Beskriv den molekylære epidemiologi af hepatitis B (AgS og pre-core mutationer) i Fransk Guyana
  • Udfør den fylodynamiske undersøgelse af de forskellige HBV genotyper for at rekonstruere historien om epidemien i Fransk Guyana
  • Identificer de kliniske prognostiske faktorer forbundet med de forskellige genotyper og fylogenetiske aspekter for at identificere vira med det største patogene potentiale i Fransk Guyana
  • Beskriv den molekylære epidemiologi af hepatitis D i B-D co-inficeret i Fransk Guyana

Tværsnit, monocentrisk, observationsstudie med biologisk indsamling.

Forskningsprotokol, der involverer den menneskelige person (Kategori 3 - Ikke-interventionel forskning_ ikke relateret til et sundhedsprodukt)

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

400

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

  • Navn: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Telefonnummer: +594 594 39 53 85
  • E-mail: cicec@ch-cayenne.fr

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Voksne patienter inficeret med hepatitis B fulgtes på Cayenne hospitalscenter (voksne daghospitalkonsultationer, konsultationer med afdelingen for infektions- og tropesygdomme og hepatologisk B-medicinkonsultationer)

Estimeret størrelse af målgruppe: 1000

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Alder ≥ 18 år
  • Person med bekræftet kronisk hepatitis B
  • Person, der ikke gør indsigelse mod deres deltagelse i protokollen
  • HBV viral load> = 500 kopier/ml
  • Person, der har planlagt/er villig til at få deres næste HBV-vurdering af den nuværende behandling taget på Cayenne Hospitalscenter

Ekskluderingskriterier:

  • Afvisning af at deltage
  • Alder <18 år
  • Person, der modsætter sig deres deltagelse i protokollen
  • HBV-virusmængde <500 kopier/ml
  • Person, der ikke har planlagt/været uvillig til at få deres næste HBV-vurdering af den nuværende behandling foretaget på Cayenne Hospitalscenter

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Hepatitis B-virus (HBV) sekventering
Tidsramme: 2 år

De undersøgte mutationer vil være dem, der vedrører AgS og præ-kerneregionerne.

De virale nukleinsyrer vil blive ekstraheret ved hjælp af Qiagen®-teknikken på Qiacube®-maskinen. HBV-genotypebestemmelsen vil blive udført ved at sekventere nukleotiderne i et DNA-segment amplificeret fra HBV S-genet (nt 414 til nt 822, referencesekvens HBV-stamme NC003977). For at studere den genetiske nærhed mellem HBV-stammerne vil prøverne blive udsat for helgenomsekventering baseret på metoden ifølge Ramachandran et al. ved hjælp af to amplifikationstrin. Den første runde af hele genom-amplifikation vil blive efterfulgt af en anden runde af PCR indlejret på 6 overlappende fragmenter på hver 600 bp.

En fylodynamisk tilgang vil estimere aspekterne tid af viral evolution. Der vil blive produceret fylogenetiske træer for at illustrere de genetiske forskelle mellem de forskellige typer vira, der cirkulerer i Fransk Guyana med Mega-software.

2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Hepatitis D-virus (VHD) sekventering
Tidsramme: 2 år

Hos patienter også med HDV-infektion vil HDV-genotypning blive udført ved nukleotidsekventering og fylogenetisk analyse af de amplificerede R0-regioner af genomet (nt 889 til nt 1289). De komplette sekvenser vil blive karakteriseret ved amplifikation og sekventering af 4 overlappende regioner, der dækker hele genomet: R0 (nt 889 til nt 1289), R1 (nt 320 til nt 1289), R2 (nt 889 til nt 420) og R3 (nt 200 til nt 560).

En fylodynamisk tilgang vil estimere aspekterne tid af viral evolution. Der vil blive produceret fylogenetiske træer for at illustrere de genetiske forskelle mellem de forskellige typer vira, der cirkulerer i Fransk Guyana med Mega-software.

2 år
Leverfunktionsmarkører
Tidsramme: 2 år
Der vil blive taget forskellige leverfunktionsmarkører. Adskillige grupper vil blive skelnet og sammenlignet med hensyn til genotype og underklader, hvorved nulhypotesen om fravær af forskel mellem genotyper og evolutionsmarkører testes. Association vil blive vurderet ved hjælp af Chi square tests til krydstabulering af kategoriske variabler og andre genotyper (eksplorative analyser).
2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

11. februar 2021

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. februar 2022

Studieafslutning (Forventet)

1. februar 2022

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

27. januar 2021

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

11. maj 2021

Først opslået (Faktiske)

13. maj 2021

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

13. maj 2021

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

11. maj 2021

Sidst verificeret

1. maj 2021

Mere information

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Hepatitis B, kronisk

Abonner