Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Molekulární epidemiologie hepatitidy B v Cayenne General Hospital, Francouzská Guyana

11. května 2021 aktualizováno: Centre Hospitalier de Cayenne
V Jižní Americe je prevalence HBV proměnlivá, ale vysoká (> 8 %) v povodí Amazonky. V některých oblastech je třetina přenašečů HBsAg také infikována HDV, hlavním faktorem komorbidity. Pre-core mutace jsou spojeny s negativním HBe Ag fenotypem, který je spojen se závažnějším průběhem. Tyto mutace jsou rostoucí a mají vysokou frekvenci. Francouzská Guyana je osídlena populacemi afrického, evropského a asijského původu s řetězci virového přenosu, které nejsou známy, a viry pravděpodobně různého původu s proměnlivou virulencí a potenciálem přenosu.

Přehled studie

Detailní popis

Lidská demografie a migrace hrají zásadní roli ve fylogeografii virových populací. Viry hepatitidy B se vyznačují vysokou genetickou diverzitou, která je důsledkem skutečnosti, že tento virus během svého replikačního cyklu využívá reverzní transkriptázu, která vyvolává chyby a tím i variace. Dosud bylo popsáno tucet genotypů, které se dělí na subgenotypy, které mají odlišnou etnogeografickou distribuci. Genotypy A a D jsou všudypřítomné a představují nejběžnější genotypy v Evropě; genotypy B a C jsou velmi běžné v Asii a Oceánii, genotyp E ve střední Africe a západní Africe, genotypy H a F v Latinské Americe a na Aljašce a genotyp I v jihovýchodní Asii. Populace pocházející z těchto různých kontinentů jsou všechny zastoupeny v Guyaně, a proto je zajímavé pochopit, jaké jsou řetězce přenosu a fylodynamické aspekty epidemie ve Francouzské Guyaně. Kromě toho mají různé genotypy různé klinické důsledky, a to různými způsoby v závislosti na etnické příslušnosti hostitele. V Mexiku se tedy genotypy F a H zdají být spíše benigní u Indiánů, mezi nimiž kolují dlouhou dobu. Na druhé straně genotypy F, A a D mají u Mexičanů kavkazského původu poměrně závažný vývoj, což naznačuje, že imunogenetické faktory hostitele jsou důležitými determinanty patogenní síly virů (Roman a kol. WJG 2014).

Některé pre-core mutace ponechávají viru schopnost replikace. Absence antigenu HBe zbavuje imunitní systém důležitého cíle a virus se tak může dále replikovat. Tyto pre-core mutace jsou spojeny s HBe Ag negativním fenotypem (7 až 30 % pacientů), který je spojen se závažnějším průběhem chronické hepatitidy. Tyto mutace mají rostoucí a vysokou frekvenci (Funk ML a kol. 2001).

Závislost na cracku je ve Francouzské Guyaně velmi rozšířená a zdá se, že je jedním z hnacích motorů epidemie. Dýmky používané ke kouření crack způsobují popáleniny na rtech a při sdílení dýmky by mohly přispět ke zvýšení rizika přenosu (Fischer a kol. 2008). Rizikové sexuální chování je spojeno s užíváním cracku, což naznačuje, že kolem uživatelů cracku mohou existovat specifické řetězce přenosu.

Primární cíl Identifikovat faktory spojené s různými genotypy (věk, pohlaví, země narození, sexuální orientace, podstupování sexuálního rizika, pojem závislosti na IV drogách, crack...) za účelem identifikace specifických řetězců přenosu ve Francouzské Guyaně.

Sekundární cíle

  • Popište molekulární epidemiologii hepatitidy B (AgS a pre-core mutace) ve Francouzské Guyaně
  • Proveďte fylodynamickou studii různých genotypů HBV s cílem rekonstruovat historii epidemie ve Francouzské Guyaně
  • Identifikujte klinické prognostické faktory spojené s různými genotypy a fylogenetickými aspekty, abyste identifikovali viry s největším patogenním potenciálem ve Francouzské Guyaně
  • Popište molekulární epidemiologii hepatitidy D u B-D koinfikovaných ve Francouzské Guyaně

Průřezová, monocentrická, observační studie s biologickým sběrem.

Výzkumný protokol zahrnující lidskou osobu (kategorie 3 – Neintervenční výzkum_ nesouvisející se zdravotním produktem)

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

400

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

  • Jméno: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Telefonní číslo: +594 594 39 53 85
  • E-mail: cicec@ch-cayenne.fr

Studijní místa

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Dospělí pacienti infikovaní hepatitidou B sledováni v nemocničním centru Cayenne (konzultace denního stacionáře pro dospělé, konzultace s oddělením infekčních a tropických nemocí a konzultace medicíny hepatologie B)

Odhadovaná velikost cílové populace: 1000

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Věk ≥ 18 let
  • Osoba s potvrzenou chronickou hepatitidou B
  • Osoba, která nevznese námitky proti své účasti na protokolu
  • Virová nálož HBV > = 500 kopií / ml
  • Osoba, která naplánovala / je ochotna nechat si provést další posouzení HBV současné péče v centru Cayenne Hospital

Kritéria vyloučení:

  • Odmítnutí účasti
  • Věk <18 let
  • Osoba, která je proti své účasti na protokolu
  • Virová nálož HBV <500 kopií/ml
  • Osoba, která neplánovala / nechtěla mít své další posouzení HBV současné péče v centru Cayenne Hospital

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Sekvenování viru hepatitidy B (HBV).
Časové okno: 2 roky

Budou studovány mutace týkající se AgS a pre-core regionů.

Virové nukleové kyseliny budou extrahovány pomocí techniky Qiagen® na stroji Qiacube®. Genotypizace HBV bude provedena sekvenováním nukleotidů segmentu DNA amplifikovaného z genu S HBV (nt 414 až nt 822, referenční sekvence HBV kmen NC003977). Za účelem studia genetické blízkosti mezi kmeny HBV budou vzorky podrobeny sekvenování celého genomu na základě metody Ramachandran et al za použití dvou amplifikačních kroků. Po prvním kole amplifikace celého genomu bude následovat druhé kolo PCR vnořené na 6 překrývajících se fragmentech po 600 bp.

Fylodynamický přístup odhadne aspekty doby evoluce viru. Fylogenetické stromy budou vytvořeny pro ilustraci genetických rozdílů mezi různými typy virů cirkulujících ve Francouzské Guyaně pomocí softwaru Mega.

2 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Sekvenování viru hepatitidy D (VHD).
Časové okno: 2 roky

U pacientů rovněž s infekcí HDV bude genotypizace HDV provedena nukleotidovým sekvenováním a fylogenetickou analýzou amplifikovaných oblastí R0 genomu (nt 889 až nt 1289). Kompletní sekvence budou charakterizovány amplifikací a sekvenováním 4 překrývajících se oblastí pokrývajících celý genom: R0 (nt 889 až nt 1289), R1 (nt 320 až nt 1289), R2 (nt 889 až nt 420) a R3 (nt 200 až 560 nt).

Fylodynamický přístup odhadne aspekty doby evoluce viru. Fylogenetické stromy budou vytvořeny pro ilustraci genetických rozdílů mezi různými typy virů cirkulujících ve Francouzské Guyaně pomocí softwaru Mega.

2 roky
Markery funkce jater
Časové okno: 2 roky
Budou odebrány různé markery jaterních funkcí. Bude rozlišeno a porovnáno několik skupin z hlediska genotypu a podkladů, čímž se otestuje nulová hypotéza o absenci rozdílu mezi genotypy a markery evoluce. Asociace bude posuzována pomocí Chí kvadrát testů pro crosstabulaci kategoriálních proměnných a dalších genotypů (explorativní analýzy).
2 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

11. února 2021

Primární dokončení (Očekávaný)

1. února 2022

Dokončení studie (Očekávaný)

1. února 2022

Termíny zápisu do studia

První předloženo

27. ledna 2021

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

11. května 2021

První zveřejněno (Aktuální)

13. května 2021

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

13. května 2021

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

11. května 2021

Naposledy ověřeno

1. května 2021

Více informací

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Hepatitida B, chronická

3
Předplatit