- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04886102
Epidémiologie Moléculaire de l'Hépatite B au Centre Hospitalier Général de Cayenne, Guyane Française
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
La démographie humaine et les migrations jouent un rôle crucial dans la phylogéographie des populations virales. Les virus de l'hépatite B se caractérisent par une grande diversité génétique qui résulte du fait que ce virus utilise une transcriptase inverse au cours de son cycle réplicatif, ce qui induit des erreurs et donc des variations. Une douzaine de génotypes ont été décrits à ce jour et sont subdivisés en sous-génotypes qui ont une distribution ethnogéographique distincte. Les génotypes A et D sont omniprésents et représentent les génotypes les plus courants en Europe ; les génotypes B et C sont très courants en Asie et en Océanie, le génotype E en Afrique centrale et en Afrique de l'Ouest, les génotypes H et F en Amérique latine et en Alaska et le génotype I en Asie du Sud-Est. Les populations originaires de ces différents continents sont toutes représentées en Guyane et il est donc intéressant de comprendre quelles sont les chaînes de transmission et les aspects phylodynamiques de l'épidémie en Guyane française. De plus, les différents génotypes ont des conséquences cliniques variables, et cela de manière différente selon l'ethnie de l'hôte. Ainsi, au Mexique, les génotypes F et H apparaissent plutôt bénins chez les Amérindiens parmi lesquels ils circulent depuis longtemps. En revanche, les génotypes F, A et D sont d'évolution assez sévère chez les Mexicains d'origine caucasienne, suggérant ainsi que les facteurs immunogénétiques de l'hôte sont des déterminants importants du pouvoir pathogène des virus (Roman et al WJG 2014).
Certaines mutations pré-core laissent au virus la capacité de se répliquer. L'absence de l'antigène HBe prive le système immunitaire d'une cible importante et le virus peut donc continuer à se répliquer. Ces mutations pré-core sont associées au phénotype HBe Ag négatif (7 à 30 % des patients) qui est associé à une évolution plus sévère de l'hépatite chronique. Ces mutations sont de fréquence croissante et élevée (Funk ML, et al 2001).
L'addiction au crack est très répandue en Guyane française et apparaît comme l'un des moteurs de l'épidémie. Les pipes utilisées pour fumer le crack provoquent des brûlures aux lèvres et le partage de la pipe peut contribuer à augmenter le risque de transmission (Fischer et al 2008). Un comportement sexuel à risque est associé à la consommation de crack, ce qui suggère qu'il peut exister des chaînes de transmission spécifiques autour des consommateurs de crack.
Objectif principal Identifier les facteurs associés aux différents génotypes (âge, sexe, pays de naissance, orientation sexuelle, prise de risque sexuel, notion de toxicomanie IV, crack...) afin d'identifier des chaînes de transmission spécifiques en Guyane française.
Objectifs secondaires
- Décrire l'épidémiologie moléculaire de l'hépatite B (AgS et mutations pré-core) en Guyane française
- Réaliser l'étude phylodynamique des différents génotypes du VHB afin de reconstituer l'histoire de l'épidémie en Guyane française
- Identifier les facteurs pronostiques cliniques associés aux différents génotypes et aspects phylogénétiques afin d'identifier les virus à plus fort potentiel pathogène en Guyane française
- Décrire l'épidémiologie moléculaire de l'hépatite D chez les B-D co-infectés en Guyane française
Etude transversale, monocentrique, observationnelle avec prélèvement biologique.
Protocole de recherche impliquant la personne humaine (Catégorie 3 - Recherche non interventionnelle_ non liée à un produit de santé)
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Roxane SCHAUB, MD
- Numéro de téléphone: +594 594 39 55 96
- E-mail: roxane.schaub@ch-cayenne.fr
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: DRISP General Hospital of Cayenne
- Numéro de téléphone: +594 594 39 53 85
- E-mail: cicec@ch-cayenne.fr
Lieux d'étude
-
-
-
Cayenne, Guyane Française, 97306
- Recrutement
- General Hospital of Cayenne
-
Contact:
- Mathieu Nacher, MD, PhD
- Numéro de téléphone: 5024 +594 594 39 50 24
- E-mail: mathieu.nacher@ch-cayenne.fr
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Patients adultes infectés par l'hépatite B suivis au centre hospitalier de Cayenne (consultations d'hôpital de jour adultes, consultations du service des maladies infectieuses et tropicales et consultations de médecine d'hépatologie B)
Taille estimée de la population cible : 1000
La description
Critère d'intégration:
- Âge ≥ 18 ans
- Personne atteinte d'hépatite B chronique confirmée
- Personne qui ne s'oppose pas à sa participation au protocole
- Charge virale VHB > = 500 copies/mL
- Personne ayant prévu/souhaitant faire réaliser son prochain bilan VHB des soins en cours au Centre Hospitalier de Cayenne
Critère d'exclusion:
- Refus de participer
- Âge <18 ans
- Personne s'opposant à sa participation au protocole
- Charge virale VHB <500 copies/mL
- Personne n'ayant pas prévu/n'ayant pas voulu faire réaliser son prochain bilan VHB des soins en cours au Centre Hospitalier de Cayenne
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Séquençage du virus de l'hépatite B (VHB)
Délai: 2 années
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Les mutations étudiées seront celles relatives à AgS et aux régions pré-core. Les acides nucléiques viraux seront extraits par la technique Qiagen® sur la machine Qiacube®. Le génotypage du VHB sera réalisé par séquençage des nucléotides d'un segment d'ADN amplifié à partir du gène S du VHB (nt 414 à nt 822, séquence de référence souche VHB NC003977). Afin d'étudier la proximité génétique entre les souches de VHB, les échantillons seront soumis à un séquençage du génome entier basé sur la méthode de Ramachandran et al en utilisant deux étapes d'amplification. Le premier cycle d'amplification du génome entier sera suivi d'un second cycle de PCR niché sur 6 fragments se chevauchant de 600 pb chacun. Une approche phylodynamique permettra d'estimer les aspects temporels de l'évolution virale. Des arbres phylogénétiques seront réalisés pour illustrer les différences génétiques entre les différents types de virus circulant en Guyane avec le logiciel Mega. |
2 années
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
---|---|---|
Séquençage du virus de l'hépatite D (VHD)
Délai: 2 années
|
Chez les patients également infectés par le VHD, le génotypage du VHD sera effectué par séquençage des nucléotides et analyse phylogénétique des régions R0 amplifiées du génome (nt 889 à nt 1289). Les séquences complètes seront caractérisées par l'amplification et le séquençage de 4 régions chevauchantes couvrant l'ensemble du génome : R0 (nt 889 à nt 1289), R1 (nt 320 à nt 1289), R2 (nt 889 à nt 420) et R3 (nt 200 à 560 NT). Une approche phylodynamique permettra d'estimer les aspects temporels de l'évolution virale. Des arbres phylogénétiques seront réalisés pour illustrer les différences génétiques entre les différents types de virus circulant en Guyane avec le logiciel Mega. |
2 années
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Fonction hépatique Marqueurs
Délai: 2 années
|
Divers marqueurs de la fonction hépatique seront prélevés.
Plusieurs groupes seront distingués et comparés en termes de génotype et de sous-clades, testant ainsi l'hypothèse nulle d'une absence de différence entre génotypes et marqueurs d'évolution.
L'association sera évaluée à l'aide de tests du chi carré pour le croisement de variables catégorielles et d'autres génotypes (analyses exploratoires).
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2 années
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Maladies du système digestif
- Infections par virus à ARN
- Maladies virales
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- Infections transmissibles par le sang
- Maladies transmissibles
- Maladies du foie
- Hépatite, virale, humaine
- Infections à Hépadnaviridae
- Infections par le virus de l'ADN
- Infections à entérovirus
- Infections à Picornaviridae
- Hépatite chronique
- Hépatite B
- Hépatite
- Hépatite A
- Hépatite B chronique
Autres numéros d'identification d'étude
- EMOHCAY
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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