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Epidémiologie Moléculaire de l'Hépatite B au Centre Hospitalier Général de Cayenne, Guyane Française

11 mai 2021 mis à jour par: Centre Hospitalier de Cayenne
En Amérique du Sud, la prévalence du VHB est variable mais élevée (> 8 %) dans le bassin amazonien. Dans certaines régions, un tiers des porteurs de l'HBsAg sont également infectés par le HDV, un facteur de comorbidité majeur. Les mutations pré-core sont associées au phénotype Ag HBe négatif qui est associé à une évolution plus sévère. Ces mutations sont de fréquence croissante et élevée. La Guyane française est peuplée de populations d'origine africaine, européenne et asiatique avec des chaînes de transmission virale inconnues et des virus probablement d'origines différentes avec des virulences et des potentiels de transmission variables.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

La démographie humaine et les migrations jouent un rôle crucial dans la phylogéographie des populations virales. Les virus de l'hépatite B se caractérisent par une grande diversité génétique qui résulte du fait que ce virus utilise une transcriptase inverse au cours de son cycle réplicatif, ce qui induit des erreurs et donc des variations. Une douzaine de génotypes ont été décrits à ce jour et sont subdivisés en sous-génotypes qui ont une distribution ethnogéographique distincte. Les génotypes A et D sont omniprésents et représentent les génotypes les plus courants en Europe ; les génotypes B et C sont très courants en Asie et en Océanie, le génotype E en Afrique centrale et en Afrique de l'Ouest, les génotypes H et F en Amérique latine et en Alaska et le génotype I en Asie du Sud-Est. Les populations originaires de ces différents continents sont toutes représentées en Guyane et il est donc intéressant de comprendre quelles sont les chaînes de transmission et les aspects phylodynamiques de l'épidémie en Guyane française. De plus, les différents génotypes ont des conséquences cliniques variables, et cela de manière différente selon l'ethnie de l'hôte. Ainsi, au Mexique, les génotypes F et H apparaissent plutôt bénins chez les Amérindiens parmi lesquels ils circulent depuis longtemps. En revanche, les génotypes F, A et D sont d'évolution assez sévère chez les Mexicains d'origine caucasienne, suggérant ainsi que les facteurs immunogénétiques de l'hôte sont des déterminants importants du pouvoir pathogène des virus (Roman et al WJG 2014).

Certaines mutations pré-core laissent au virus la capacité de se répliquer. L'absence de l'antigène HBe prive le système immunitaire d'une cible importante et le virus peut donc continuer à se répliquer. Ces mutations pré-core sont associées au phénotype HBe Ag négatif (7 à 30 % des patients) qui est associé à une évolution plus sévère de l'hépatite chronique. Ces mutations sont de fréquence croissante et élevée (Funk ML, et al 2001).

L'addiction au crack est très répandue en Guyane française et apparaît comme l'un des moteurs de l'épidémie. Les pipes utilisées pour fumer le crack provoquent des brûlures aux lèvres et le partage de la pipe peut contribuer à augmenter le risque de transmission (Fischer et al 2008). Un comportement sexuel à risque est associé à la consommation de crack, ce qui suggère qu'il peut exister des chaînes de transmission spécifiques autour des consommateurs de crack.

Objectif principal Identifier les facteurs associés aux différents génotypes (âge, sexe, pays de naissance, orientation sexuelle, prise de risque sexuel, notion de toxicomanie IV, crack...) afin d'identifier des chaînes de transmission spécifiques en Guyane française.

Objectifs secondaires

  • Décrire l'épidémiologie moléculaire de l'hépatite B (AgS et mutations pré-core) en Guyane française
  • Réaliser l'étude phylodynamique des différents génotypes du VHB afin de reconstituer l'histoire de l'épidémie en Guyane française
  • Identifier les facteurs pronostiques cliniques associés aux différents génotypes et aspects phylogénétiques afin d'identifier les virus à plus fort potentiel pathogène en Guyane française
  • Décrire l'épidémiologie moléculaire de l'hépatite D chez les B-D co-infectés en Guyane française

Etude transversale, monocentrique, observationnelle avec prélèvement biologique.

Protocole de recherche impliquant la personne humaine (Catégorie 3 - Recherche non interventionnelle_ non liée à un produit de santé)

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

400

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

  • Nom: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Numéro de téléphone: +594 594 39 53 85
  • E-mail: cicec@ch-cayenne.fr

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients adultes infectés par l'hépatite B suivis au centre hospitalier de Cayenne (consultations d'hôpital de jour adultes, consultations du service des maladies infectieuses et tropicales et consultations de médecine d'hépatologie B)

Taille estimée de la population cible : 1000

La description

Critère d'intégration:

  • Âge ≥ 18 ans
  • Personne atteinte d'hépatite B chronique confirmée
  • Personne qui ne s'oppose pas à sa participation au protocole
  • Charge virale VHB > = 500 copies/mL
  • Personne ayant prévu/souhaitant faire réaliser son prochain bilan VHB des soins en cours au Centre Hospitalier de Cayenne

Critère d'exclusion:

  • Refus de participer
  • Âge <18 ans
  • Personne s'opposant à sa participation au protocole
  • Charge virale VHB <500 copies/mL
  • Personne n'ayant pas prévu/n'ayant pas voulu faire réaliser son prochain bilan VHB des soins en cours au Centre Hospitalier de Cayenne

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Séquençage du virus de l'hépatite B (VHB)
Délai: 2 années

Les mutations étudiées seront celles relatives à AgS et aux régions pré-core.

Les acides nucléiques viraux seront extraits par la technique Qiagen® sur la machine Qiacube®. Le génotypage du VHB sera réalisé par séquençage des nucléotides d'un segment d'ADN amplifié à partir du gène S du VHB (nt 414 à nt 822, séquence de référence souche VHB NC003977). Afin d'étudier la proximité génétique entre les souches de VHB, les échantillons seront soumis à un séquençage du génome entier basé sur la méthode de Ramachandran et al en utilisant deux étapes d'amplification. Le premier cycle d'amplification du génome entier sera suivi d'un second cycle de PCR niché sur 6 fragments se chevauchant de 600 pb chacun.

Une approche phylodynamique permettra d'estimer les aspects temporels de l'évolution virale. Des arbres phylogénétiques seront réalisés pour illustrer les différences génétiques entre les différents types de virus circulant en Guyane avec le logiciel Mega.

2 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Séquençage du virus de l'hépatite D (VHD)
Délai: 2 années

Chez les patients également infectés par le VHD, le génotypage du VHD sera effectué par séquençage des nucléotides et analyse phylogénétique des régions R0 amplifiées du génome (nt 889 à nt 1289). Les séquences complètes seront caractérisées par l'amplification et le séquençage de 4 régions chevauchantes couvrant l'ensemble du génome : R0 (nt 889 à nt 1289), R1 (nt 320 à nt 1289), R2 (nt 889 à nt 420) et R3 (nt 200 à 560 NT).

Une approche phylodynamique permettra d'estimer les aspects temporels de l'évolution virale. Des arbres phylogénétiques seront réalisés pour illustrer les différences génétiques entre les différents types de virus circulant en Guyane avec le logiciel Mega.

2 années
Fonction hépatique Marqueurs
Délai: 2 années
Divers marqueurs de la fonction hépatique seront prélevés. Plusieurs groupes seront distingués et comparés en termes de génotype et de sous-clades, testant ainsi l'hypothèse nulle d'une absence de différence entre génotypes et marqueurs d'évolution. L'association sera évaluée à l'aide de tests du chi carré pour le croisement de variables catégorielles et d'autres génotypes (analyses exploratoires).
2 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

11 février 2021

Achèvement primaire (Anticipé)

1 février 2022

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 février 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

27 janvier 2021

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

11 mai 2021

Première publication (Réel)

13 mai 2021

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

13 mai 2021

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

11 mai 2021

Dernière vérification

1 mai 2021

Plus d'information

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

Essais cliniques sur Hépatite B chronique

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