Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Molekylær epidemiologi av hepatitt B i Cayenne General Hospital, Fransk Guyana

11. mai 2021 oppdatert av: Centre Hospitalier de Cayenne
I Sør-Amerika er prevalensen av HBV variabel, men høy (> 8 %) i Amazonasbassenget. I noen områder er en tredjedel av HBsAg-bærere også infisert med HDV, en stor komorbiditetsfaktor. Pre-core-mutasjonene er assosiert med den negative HBe Ag-fenotypen som er assosiert med et mer alvorlig forløp. Disse mutasjonene er av økende og høy frekvens. Fransk Guyana er befolket av populasjoner av afrikansk, europeisk og asiatisk opprinnelse med kjeder av viral overføring som ikke er kjent og virus sannsynligvis av forskjellig opprinnelse med varierende virulens og overføringspotensialer.

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Menneskelig demografi og migrasjoner spiller en avgjørende rolle i fylogeografien til virale populasjoner. Hepatitt B-virus er preget av et høyt genetisk mangfold som skyldes at dette viruset bruker en revers transkriptase under replikasjonssyklusen, noe som induserer feil og derfor variasjon. Et dusin genotyper har så langt blitt beskrevet og er delt inn i sub-genotyper som har en distinkt etnogeografisk fordeling. Genotype A og D er allestedsnærværende og representerer de vanligste genotypene i Europa; genotype B og C er svært vanlige i Asia og Oseania, genotype E i Sentral-Afrika og Vest-Afrika, genotype H og F i Latin-Amerika og Alaska, og genotype I i Sørøst-Asia. Populasjonene som kommer fra disse forskjellige kontinentene er alle representert i Guyana, og det er derfor interessant å forstå hva som er overføringskjedene og de fylodynamiske aspektene ved epidemien i Fransk Guyana. I tillegg har de ulike genotypene varierende kliniske konsekvenser, og dette på ulike måter avhengig av vertens etnisitet. I Mexico ser derfor F- og H-genotypene ut til å være ganske godartede hos indianerne som de har sirkulert blant i lang tid. På den annen side er genotypene F, A og D av ganske alvorlig utvikling hos meksikanere av kaukasisk opprinnelse, og antyder dermed at de immunogenetiske faktorene til verten er viktige determinanter for virusenes patogene kraft (Roman og al WJG 2014).

Noen pre-core mutasjoner etterlater viruset med kapasitet til å replikere. Fraværet av HBe-antigenet fratar immunsystemet et viktig mål, og viruset kan derfor fortsette å replikere. Disse pre-core mutasjonene er assosiert med den HBe Ag negative fenotypen (7 til 30 % av pasientene) som er assosiert med et mer alvorlig forløp av kronisk hepatitt. Disse mutasjonene er av økende og høy frekvens (Funk ML, og al 2001).

Avhengighet av crack-kokain er utbredt i Fransk Guyana og ser ut til å være en av driverne bak epidemien. Rørene som brukes til å røyke sprekker forårsaker brannskader på leppene og ved deling av røret kan det bidra til å øke risikoen for overføring (Fischer og al 2008). Risikofylt seksuell atferd er assosiert med bruk av crack-kokain, noe som tyder på at det kan være spesifikke overføringskjeder rundt crack-brukere.

Primært mål Identifisere faktorene assosiert med ulike genotyper (alder, kjønn, fødeland, seksuell legning, seksuell risikotaking, forestillingen om IV rusmiddelavhengighet, crack ...) for å identifisere spesifikke smittekjeder i Fransk Guyana.

Sekundære mål

  • Beskriv den molekylære epidemiologien til hepatitt B (AgS og pre-core mutasjoner) i Fransk Guyana
  • Utfør den fylodynamiske studien av de forskjellige HBV-genotypene for å rekonstruere historien til epidemien i Fransk Guyana
  • Identifiser de kliniske prognostiske faktorene assosiert med de forskjellige genotypene og fylogenetiske aspektene for å identifisere virusene med det største patogene potensialet i Fransk Guyana
  • Beskriv den molekylære epidemiologien til hepatitt D i B-D samtidig infisert i Fransk Guyana

Tverrsnitt, monosentrisk, observasjonsstudie med biologisk samling.

Forskningsprotokoll som involverer mennesket (Kategori 3 - Ikke-intervensjonell forskning_ ikke relatert til et helseprodukt)

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

400

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

  • Navn: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Telefonnummer: +594 594 39 53 85
  • E-post: cicec@ch-cayenne.fr

Studiesteder

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Voksne pasienter infisert med hepatitt B fulgt på sykehussenteret i Cayenne (dagsykehuskonsultasjoner for voksne, konsultasjoner med avdeling for infeksjons- og tropesykdommer og konsultasjoner med hepatologi B-medisin)

Estimert størrelse på målpopulasjon: 1000

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Alder ≥ 18 år gammel
  • Person med bekreftet kronisk hepatitt B
  • Person som ikke motsetter seg deres deltakelse i protokollen
  • HBV viral belastning> = 500 kopier / ml
  • Person som har planlagt / er villig til å få sin neste HBV-vurdering av nåværende omsorg tatt på Cayenne Hospital senter

Ekskluderingskriterier:

  • Nekter å delta
  • Alder <18 år
  • Person som motsetter seg deres deltakelse i protokollen
  • HBV-virusmengde <500 kopier / ml
  • Person som ikke har planlagt / vært uvillig til å få sin neste HBV-vurdering av nåværende omsorg tatt på Cayenne Hospital senter

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Hepatitt B-virus (HBV) sekvensering
Tidsramme: 2 år

Mutasjonene som er studert vil være de som er relatert til AgS og til pre-core-regionene.

De virale nukleinsyrene vil bli ekstrahert ved hjelp av Qiagen®-teknikken på Qiacube®-maskinen. HBV-genotypingen vil bli utført ved å sekvensere nukleotidene til et DNA-segment amplifisert fra HBV S-genet (nt 414 til nt 822, referansesekvens HBV-stamme NC003977). For å studere den genetiske nærheten mellom HBV-stammene, vil prøvene bli utsatt for helgenomsekvensering basert på metoden til Ramachandran et al. ved bruk av to amplifikasjonstrinn. Den første runden med amplifikasjon av hele genomet vil bli fulgt av en andre runde med PCR nestet på 6 overlappende fragmenter på 600 bp hver.

En fylodynamisk tilnærming vil estimere aspektene tid av viral evolusjon. Fylogenetiske trær vil bli produsert for å illustrere de genetiske forskjellene mellom de forskjellige typene virus som sirkulerer i Fransk Guyana med Mega-programvare.

2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Hepatitt D-virus (VHD) sekvensering
Tidsramme: 2 år

Hos pasienter også med HDV-infeksjon vil HDV-genotyping utføres ved nukleotidsekvensering og fylogenetisk analyse av de amplifiserte R0-regionene i genomet (nt 889 til nt 1289). De komplette sekvensene vil bli karakterisert ved amplifikasjon og sekvensering av 4 overlappende regioner som dekker hele genomet: R0 (nt 889 til nt 1289), R1 (nt 320 til nt 1289), R2 (nt 889 til nt 420) og R3 (nt 200 til nt 560).

En fylodynamisk tilnærming vil estimere aspektene tid av viral evolusjon. Fylogenetiske trær vil bli produsert for å illustrere de genetiske forskjellene mellom de forskjellige typene virus som sirkulerer i Fransk Guyana med Mega-programvare.

2 år
Leverfunksjonsmarkører
Tidsramme: 2 år
Ulike leverfunksjonsmarkører vil bli tatt. Flere grupper vil bli skilt ut og sammenlignet når det gjelder genotype og subklader, og tester dermed nullhypotesen om fravær av forskjell mellom genotyper og evolusjonsmarkører. Assosiasjon vil bli vurdert ved hjelp av Chi-kvadrat-tester for krysstabulering av kategoriske variabler og andre genotyper (eksplorative analyser).
2 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

11. februar 2021

Primær fullføring (Forventet)

1. februar 2022

Studiet fullført (Forventet)

1. februar 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

27. januar 2021

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

11. mai 2021

Først lagt ut (Faktiske)

13. mai 2021

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

13. mai 2021

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

11. mai 2021

Sist bekreftet

1. mai 2021

Mer informasjon

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere