Hepatiitti B:n molekyyliepidemiologia Cayennen yleissairaalassa, Ranskan Guayanassa

Ihmisen demografia ja muuttoliikkeet ovat ratkaisevassa asemassa viruspopulaatioiden fylogeografiassa. Hepatiitti B -viruksille on ominaista suuri geneettinen monimuotoisuus, joka johtuu siitä, että tämä virus käyttää käänteiskopioijaentsyymiä replikaatiosyklinsä aikana, mikä aiheuttaa virheitä ja siten vaihtelua. Tähän mennessä on kuvattu kymmenkunta genotyyppiä, ja ne on jaettu alagenotyyppeihin, joilla on selkeä etnogeografinen jakautuminen. Genotyypit A ja D ovat kaikkialla ja edustavat yleisimpiä genotyyppejä Euroopassa; genotyypit B ja C ovat hyvin yleisiä Aasiassa ja Oseaniassa, genotyyppi E Keski- ja Länsi-Afrikassa, genotyypit H ja F Latinalaisessa Amerikassa ja Alaskassa ja genotyyppi I Kaakkois-Aasiassa. Näiltä eri mantereilta peräisin olevat populaatiot ovat kaikki edustettuina Guyanassa, ja siksi on mielenkiintoista ymmärtää, mitkä ovat Ranskan Guyanan epidemian leviämisketjut ja fylodynaamiset näkökohdat. Lisäksi eri genotyypeillä on vaihtelevia kliinisiä seurauksia, ja tämä eri tavoin riippuen isännän etnisestä alkuperästä. Siten Meksikossa F- ja H-genotyypit näyttävät olevan melko hyvänlaatuisia amerindialaisilla, joiden keskuudessa ne ovat kiertäneet pitkään. Toisaalta genotyypit F, A ja D ovat melko vakavaa kehitystä valkoihoisilla meksikolaisilla, mikä viittaa siihen, että isännän immunogeneettiset tekijät ovat tärkeitä virusten patogeenisen voiman determinantteja (Roman ja al WJG 2014).

Jotkut pre-core mutaatiot jättävät virukselle kyvyn replikoitua. HBe-antigeenin puuttuminen riistää immuunijärjestelmältä tärkeän kohteen ja virus voi siksi jatkaa replikoitumista. Nämä esiydinmutaatiot liittyvät HBe Ag-negatiiviseen fenotyyppiin (7-30 % potilaista), joka liittyy vakavampaan kroonisen hepatiitin kulkuun. Nämä mutaatiot ovat lisääntyviä ja korkeataajuisia (Funk ML ja al 2001).

Riippuvuus crack-kokaiinista on laajalle levinnyt Ranskan Guyanassa ja näyttää olevan yksi epidemian aiheuttajista. Halkeaman polttamiseen käytetyt putket aiheuttavat palovammoja huulille ja putken jakaminen voivat lisätä tartuntariskiä (Fischer ja al 2008). Riskialtista seksuaalista käyttäytymistä liittyy crack-kokaiinin käyttöön, mikä viittaa siihen, että crack-käyttäjien ympärillä voi olla erityisiä tartuntaketjuja.

Ensisijainen tavoite Tunnista eri genotyyppeihin liittyvät tekijät (ikä, sukupuoli, syntymämaa, seksuaalinen suuntautuminen, seksuaalinen riskinotto, IV-huumeriippuvuuden käsite, crack...) erityisten tartuntaketjujen tunnistamiseksi Ranskan Guyanassa.

Toissijaiset tavoitteet

• Kuvaile hepatiitti B:n (AgS ja pre-core mutaatiot) molekyyliepidemiologiaa Ranskan Guyanassa
• Suorita eri HBV-genotyyppien fylodynaaminen tutkimus, jotta voidaan rekonstruoida Ranskan Guayanan epidemian historia
• Tunnista eri genotyyppeihin ja fylogeneettisiin näkökohtiin liittyvät kliiniset prognostiset tekijät, jotta voidaan tunnistaa virukset, joilla on suurin patogeeninen potentiaali Ranskan Guayanassa
• Kuvaile hepatiitti D:n molekyyliepidemiologiaa Ranskan Guyanassa samanaikaisesti tartunnan saaneessa B-D:ssä

Poikkileikkaus, yksikeskinen, havainnollinen tutkimus biologisella keräyksellä.

Tutkimusprotokolla, jossa on mukana ihminen (luokka 3 – ei-interventiotutkimus_ ei liity terveystuotteeseen)