Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Epidemiologia molekularna zapalenia wątroby typu B w Cayenne General Hospital w Gujanie Francuskiej

11 maja 2021 zaktualizowane przez: Centre Hospitalier de Cayenne
W Ameryce Południowej częstość występowania HBV jest zmienna, ale wysoka (> 8%) w dorzeczu Amazonki. Na niektórych obszarach jedna trzecia nosicieli HBsAg jest również zakażona wirusem HDV, który jest głównym czynnikiem współistniejącym. Mutacje pre-core są związane z ujemnym fenotypem HBe Ag, który jest związany z cięższym przebiegiem. Mutacje te mają rosnącą i wysoką częstotliwość. Gujana Francuska jest zamieszkana przez populacje pochodzenia afrykańskiego, europejskiego i azjatyckiego, których łańcuchy przenoszenia wirusów nie są znane, oraz wirusy prawdopodobnie różnego pochodzenia o różnej zjadliwości i potencjale przenoszenia.

Przegląd badań

Szczegółowy opis

Demografia i migracje ludzi odgrywają kluczową rolę w filogeografii populacji wirusów. Wirusy zapalenia wątroby typu B charakteryzują się dużą różnorodnością genetyczną, co wynika z faktu, że wirus ten w swoim cyklu replikacyjnym wykorzystuje odwrotną transkryptazę, co powoduje powstawanie błędów, a co za tym idzie zmienności. Do tej pory opisano kilkanaście genotypów, które podzielono na podgenotypy o wyraźnym rozmieszczeniu etnogeograficznym. Genotypy A i D są wszechobecne i reprezentują najpowszechniejsze genotypy w Europie; genotypy B i C są bardzo powszechne w Azji i Oceanii, genotyp E w Afryce Środkowej i Afryce Zachodniej, genotypy H i F w Ameryce Łacińskiej i na Alasce, a genotyp I w Azji Południowo-Wschodniej. Populacje pochodzące z tych różnych kontynentów są reprezentowane w Gujanie i dlatego interesujące jest zrozumienie, jakie są łańcuchy przenoszenia i filodynamiczne aspekty epidemii w Gujanie Francuskiej. Ponadto różne genotypy mają różne konsekwencje kliniczne, i to na różne sposoby, w zależności od pochodzenia etnicznego gospodarza. Tak więc w Meksyku genotypy F i H wydają się być raczej łagodne u Indian, wśród których krążą od dawna. Z drugiej strony, genotypy F, A i D ewoluowały raczej silnie u Meksykanów pochodzenia kaukaskiego, co sugeruje, że czynniki immunogenetyczne gospodarza są ważnymi determinantami siły patogennej wirusów (Roman i in. WJG 2014).

Niektóre mutacje poprzedzające rdzeń pozostawiają wirusa ze zdolnością do replikacji. Brak antygenu HBe pozbawia układ odpornościowy ważnego celu, dzięki czemu wirus może kontynuować replikację. Te mutacje pre-core są związane z ujemnym fenotypem HBe Ag (7 do 30% pacjentów), który jest związany z cięższym przebiegiem przewlekłego zapalenia wątroby. Mutacje te mają rosnącą i wysoką częstotliwość (Funk ML i in. 2001).

Uzależnienie od cracku jest szeroko rozpowszechnione w Gujanie Francuskiej i wydaje się być jednym z czynników napędzających epidemię. Fajki używane do palenia cracku powodują oparzenia ust, a dzielenie fajki może przyczynić się do zwiększenia ryzyka transmisji (Fischer i in. 2008). Ryzykowne zachowania seksualne są związane z używaniem cracku, co sugeruje, że mogą istnieć określone łańcuchy przenoszenia wokół użytkowników cracku.

Główny cel Zidentyfikować czynniki związane z różnymi genotypami (wiek, płeć, kraj urodzenia, orientacja seksualna, podejmowanie ryzyka seksualnego, pojęcie narkomanii dożylnej, crack ...) w celu zidentyfikowania określonych łańcuchów transmisji w Gujanie Francuskiej.

Cele drugorzędne

  • Opisać epidemiologię molekularną wirusowego zapalenia wątroby typu B (AgS i mutacje pre-core) w Gujanie Francuskiej
  • Przeprowadzenie badań filodynamicznych różnych genotypów HBV w celu odtworzenia historii epidemii w Gujanie Francuskiej
  • Zidentyfikuj kliniczne czynniki prognostyczne związane z różnymi genotypami i aspektami filogenetycznymi w celu zidentyfikowania wirusów o największym potencjale patogennym w Gujanie Francuskiej
  • Opisz epidemiologię molekularną wirusowego zapalenia wątroby typu D w B-D koinfekcji w Gujanie Francuskiej

Przekrojowe, monocentryczne badanie obserwacyjne z kolekcją biologiczną.

Protokół badania z udziałem człowieka (Kategoria 3 - Badania nieinterwencyjne_ niezwiązane z produktem zdrowotnym)

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Oczekiwany)

400

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

  • Nazwa: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Numer telefonu: +594 594 39 53 85
  • E-mail: cicec@ch-cayenne.fr

Lokalizacje studiów

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat i starsze (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci dorośli z wirusowym zapaleniem wątroby typu B obserwowani w ośrodku szpitalnym w Cayenne (konsultacje w szpitalu dziennym dla dorosłych, konsultacje z oddziałem chorób zakaźnych i tropikalnych oraz konsultacje lekarskie z zakresu hepatologii B)

Szacunkowa wielkość populacji docelowej: 1000

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Wiek ≥ 18 lat
  • Osoba z potwierdzonym przewlekłym wirusowym zapaleniem wątroby typu B
  • Osoba, która nie sprzeciwia się swojemu udziałowi w protokole
  • Obciążenie wirusem HBV> = 500 kopii/ml
  • Osoba, która zaplanowała/jest chętna do kolejnej oceny HBV obecnej opieki świadczonej w ośrodku Cayenne Hospital

Kryteria wyłączenia:

  • Odmowa udziału
  • Wiek <18 lat
  • Osoba sprzeciwiająca się udziałowi w protokole
  • Miano wirusa HBV <500 kopii/ml
  • Osoba, która nie planowała / nie chciała poddać się kolejnej ocenie HBV obecnej opieki w ośrodku Cayenne Hospital

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Sekwencjonowanie wirusa zapalenia wątroby typu B (HBV).
Ramy czasowe: 2 lata

Badane mutacje będą dotyczyć AgS i regionów przedrdzeniowych.

Wirusowe kwasy nukleinowe zostaną wyekstrahowane przy użyciu techniki Qiagen® na maszynie Qiacube®. Genotypowanie HBV zostanie przeprowadzone przez sekwencjonowanie nukleotydów segmentu DNA zamplifikowanego z genu S HBV (nt 414 do nt 822, sekwencja referencyjna szczepu HBV NC003977). W celu zbadania bliskości genetycznej szczepów HBV próbki zostaną poddane sekwencjonowaniu całego genomu w oparciu o metodę Ramachandrana i wsp. z wykorzystaniem dwóch etapów amplifikacji. Po pierwszej rundzie amplifikacji całego genomu nastąpi druga runda PCR zagnieżdżona na 6 zachodzących na siebie fragmentach po 600 pz każdy.

Podejście filodynamiczne pozwoli oszacować aspekty czasu ewolucji wirusa. Zostaną utworzone drzewa filogenetyczne w celu zilustrowania różnic genetycznych między różnymi typami wirusów krążących w Gujanie Francuskiej za pomocą oprogramowania Mega.

2 lata

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Sekwencjonowanie wirusa zapalenia wątroby typu D (VHD).
Ramy czasowe: 2 lata

U pacjentów również z zakażeniem HDV genotypowanie HDV zostanie przeprowadzone przez sekwencjonowanie nukleotydów i analizę filogenetyczną zamplifikowanych regionów R0 genomu (nt 889 do nt 1289). Kompletne sekwencje będą charakteryzowane przez amplifikację i sekwencjonowanie 4 nakładających się regionów obejmujących cały genom: R0 (nt 889 do nt 1289), R1 (nt 320 do nt 1289), R2 (nt 889 do nt 420) i R3 (nt 889 do nt 1289) 200 do Nt 560).

Podejście filodynamiczne pozwoli oszacować aspekty czasu ewolucji wirusa. Zostaną utworzone drzewa filogenetyczne w celu zilustrowania różnic genetycznych między różnymi typami wirusów krążących w Gujanie Francuskiej za pomocą oprogramowania Mega.

2 lata
Markery funkcji wątroby
Ramy czasowe: 2 lata
Zostaną pobrane różne markery czynności wątroby. Kilka grup zostanie wyróżnionych i porównanych pod względem genotypu i podkladów, testując w ten sposób hipotezę zerową o braku różnic między genotypami a markerami ewolucji. Powiązanie zostanie ocenione za pomocą testów chi-kwadrat do zestawień krzyżowych zmiennych kategorialnych i innych genotypów (analizy eksploracyjne).
2 lata

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

11 lutego 2021

Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)

1 lutego 2022

Ukończenie studiów (Oczekiwany)

1 lutego 2022

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

27 stycznia 2021

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

11 maja 2021

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

13 maja 2021

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

13 maja 2021

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

11 maja 2021

Ostatnia weryfikacja

1 maja 2021

Więcej informacji

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Wirusowe zapalenie wątroby typu B, przewlekłe

3
Subskrybuj