Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Molecular Epidemiology of Hepatitis B i Cayenne General Hospital, Franska Guyana

11 maj 2021 uppdaterad av: Centre Hospitalier de Cayenne
I Sydamerika är förekomsten av HBV varierande men hög (> 8%) i Amazonas. I vissa områden är en tredjedel av HBsAg-bärare också infekterade med HDV, en viktig samsjuklighetsfaktor. Pre-core-mutationerna är associerade med den negativa HBe Ag-fenotypen som är associerad med ett allvarligare förlopp. Dessa mutationer är av ökande och hög frekvens. Franska Guyana är befolkat av populationer av afrikanskt, europeiskt och asiatiskt ursprung med kedjor av virusöverföring som inte är kända och virus troligen av olika ursprung med varierande virulens och överföringspotential.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Människans demografi och migrationer spelar en avgörande roll i fylogeografin av viruspopulationer. Hepatit B-virus kännetecknas av en hög genetisk mångfald som är resultatet av det faktum att detta virus använder ett omvänt transkriptas under sin replikationscykel, vilket inducerar fel och därför variation. Ett dussin genotyper har hittills beskrivits och är uppdelade i sub-genotyper som har en distinkt etnogeografisk fördelning. Genotyperna A och D är allestädes närvarande och representerar de vanligaste genotyperna i Europa; genotyperna B och C är mycket vanliga i Asien och Oceanien, genotyp E i Centralafrika och Västafrika, genotyperna H och F i Latinamerika och Alaska och genotyp I i ​​Sydostasien. Populationerna som kommer från dessa olika kontinenter är alla representerade i Guyana och det är därför intressant att förstå vilka överföringskedjorna är och de fylodynamiska aspekterna av epidemin i Franska Guyana. Dessutom har de olika genotyperna varierande kliniska konsekvenser, och detta på olika sätt beroende på värdens etnicitet. Sålunda, i Mexiko, verkar F- och H-genotyperna vara ganska godartade hos indianerna bland vilka de har cirkulerat under lång tid. Å andra sidan är genotyperna F, A och D av ganska allvarlig utveckling hos mexikaner av kaukasiskt ursprung, vilket antyder att värdens immunogenetiska faktorer är viktiga bestämningsfaktorer för virusens patogena kraft (Roman and al WJG 2014).

Vissa pre-core mutationer lämnar viruset med kapacitet att replikera. Frånvaron av HBe-antigenet berövar immunsystemet ett viktigt mål och viruset kan därför fortsätta att replikera. Dessa pre-core-mutationer är associerade med den HBe Ag-negativa fenotypen (7 till 30 % av patienterna) som är associerad med ett allvarligare förlopp av kronisk hepatit. Dessa mutationer är av ökande och hög frekvens (Funk ML, och al 2001).

Beroende av crack-kokain är utbrett i Franska Guyana och verkar vara en av orsakerna till epidemin. De rör som används för att röka crack orsakar brännskador på läpparna och när man delar röret kan det bidra till att öka risken för överföring (Fischer och al 2008). Riskfyllt sexuellt beteende är förknippat med användningen av crack-kokain, vilket tyder på att det kan finnas specifika överföringskedjor kring crackanvändare.

Primärt mål Identifiera faktorer som är associerade med olika genotyper (ålder, kön, födelseland, sexuell läggning, sexuellt risktagande, föreställning om IV-drogberoende, crack ...) för att identifiera specifika smittkedjor i Franska Guyana.

Sekundära mål

  • Beskriv den molekylära epidemiologin av hepatit B (AgS och pre-core mutationer) i Franska Guyana
  • Genomför den fylodynamiska studien av de olika HBV-genotyperna för att rekonstruera epidemins historia i Franska Guyana
  • Identifiera de kliniska prognostiska faktorerna associerade med de olika genotyperna och fylogenetiska aspekterna för att identifiera virusen med störst patogen potential i Franska Guyana
  • Beskriv den molekylära epidemiologin för hepatit D i B-D saminfekterad i Franska Guyana

Tvärsnitts, monocentrisk, observationsstudie med biologisk insamling.

Forskningsprotokoll som involverar människan (Kategori 3 - Icke-interventionell forskning_ inte relaterad till en hälsoprodukt)

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

400

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

  • Namn: DRISP General Hospital of Cayenne
  • Telefonnummer: +594 594 39 53 85
  • E-post: cicec@ch-cayenne.fr

Studieorter

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Vuxna patienter infekterade med hepatit B följdes på sjukhuscentret i Cayenne (konsultationer för vuxna dag på sjukhus, konsultationer med avdelningen för infektionssjukdomar och tropiska sjukdomar och konsultationer med hepatologi B-medicin)

Uppskattad storlek på målpopulationen: 1 000

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Ålder ≥ 18 år
  • Person med bekräftad kronisk hepatit B
  • Person som inte motsätter sig sin medverkan i protokollet
  • HBV-virusmängd> = 500 kopior/ml
  • Person som har planerat/är villig att få sin nästa HBV-bedömning av nuvarande vård utförd på Cayenne Hospital Center

Exklusions kriterier:

  • Vägra att delta
  • Ålder <18 år
  • Person som motsätter sig deras deltagande i protokollet
  • HBV-virusmängd <500 kopior/ml
  • Person som inte har planerat / varit ovillig att få sin nästa HBV-bedömning av nuvarande vård utförd på Cayenne Hospital Center

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Hepatit B-virus (HBV) sekvensering
Tidsram: 2 år

De studerade mutationerna kommer att vara de som hänför sig till AgS och till pre-core-regionerna.

De virala nukleinsyrorna kommer att extraheras med Qiagen®-tekniken på Qiacube®-maskinen. HBV-genotypningen kommer att utföras genom att sekvensera nukleotiderna i ett DNA-segment amplifierat från HBV S-genen (nt 414 till nt 822, referenssekvens HBV-stam NC003977). För att studera den genetiska närheten mellan HBV-stammarna kommer proverna att utsättas för helgenomsekvensering baserat på metoden enligt Ramachandran et al med två amplifieringssteg. Den första omgången av helgenomamplifiering kommer att följas av en andra omgång av PCR kapslad på 6 överlappande fragment på 600 bp vardera.

Ett fylodynamiskt tillvägagångssätt kommer att uppskatta aspekternas tid för viral evolution. Filogenetiska träd kommer att produceras för att illustrera de genetiska skillnaderna mellan de olika typerna av virus som cirkulerar i Franska Guyana med Mega-mjukvaran.

2 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Hepatit D-virus (VHD) sekvensering
Tidsram: 2 år

Hos patienter även med HDV-infektion kommer HDV-genotypning att utföras genom nukleotidsekvensering och fylogenetisk analys av de amplifierade R0-regionerna i genomet (nt 889 till nt 1289). De kompletta sekvenserna kommer att karakteriseras av amplifiering och sekvensering av 4 överlappande regioner som täcker hela genomet: R0 (nt 889 till nt 1289), R1 (nt 320 till nt 1289), R2 (nt 889 till nt 420) och R3 (nt 200 till nt 560).

Ett fylodynamiskt tillvägagångssätt kommer att uppskatta aspekternas tid för viral evolution. Filogenetiska träd kommer att produceras för att illustrera de genetiska skillnaderna mellan de olika typerna av virus som cirkulerar i Franska Guyana med Mega-mjukvaran.

2 år
Leverfunktionsmarkörer
Tidsram: 2 år
Olika leverfunktionsmarkörer kommer att tas. Flera grupper kommer att särskiljas och jämföras i termer av genotyp och subklader, vilket testar nollhypotesen om frånvaro av skillnad mellan genotyper och evolutionsmarkörer. Association kommer att bedömas med hjälp av Chi-kvadrat-tester för korstabulering av kategoriska variabler och andra genotyper (utforskande analyser).
2 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Mathieu NACHER, MD, PhD, Centre Hospitalier de Cayenne

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

11 februari 2021

Primärt slutförande (Förväntat)

1 februari 2022

Avslutad studie (Förväntat)

1 februari 2022

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

27 januari 2021

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

11 maj 2021

Första postat (Faktisk)

13 maj 2021

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

13 maj 2021

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

11 maj 2021

Senast verifierad

1 maj 2021

Mer information

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Hepatit B, kronisk

3
Prenumerera