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NBIA 基因测试:遗传异质性分析和线粒体标记的验证,用于评估序列变异的因果关系。 (NBIA MITO)

2022年11月7日 更新者:University Hospital, Bordeaux

具有脑铁积累的神经变性 (NBIA) 代表一组罕见的神经发育疾病,具有遗传和表型异质性。

诊断基于脑 MRI。 它也基于基因检测。 然而,不同临床表现之间存在重叠,分子诊断可能会被误解。

必须解决两个主要目的以获得更好的分子诊断:一方面达到足够的详尽性,这可以通过更大的基因组和下一代测序来进行;另一方面,现在有必要借助功能研究来验证或证实变异的有害后果。

研究概览

详细说明

具有脑铁积累的神经变性 (NBIA) 代表一组罕见的神经发育疾病,具有遗传和表型异质性。

诊断基于脑 MRI。 它显示基底神经节中铁的异常沉积,特别是在苍白球和黑质中。 它也基于基因检测。 现在描述了十种个性化的形式。 然而,不同临床表现之间存在重叠,分子诊断可能因变异而被误解,命名为意义不明的变异,其致病作用尚未得到证实。 在脑部 MRI 上有铁沉积的临床相关病例中,大约一半没有任何分子有害改变。

必须解决两个主要目的以获得更好的分子诊断:一方面达到足够的详尽性,这可以通过更大的基因组和下一代测序来进行;该小组将包括新基因,并可能随着更多基因的鉴定而扩大。 另一方面,现在有必要借助功能研究来验证或证实变异的有害后果。

NBIA 的病理生理学涉及四种主要途径:铁和脂质代谢、线粒体代谢和自噬。

考虑到这四种途径涉及线粒体内部的生化机制,研究人员从患者的成纤维细胞开始进行了第一次测试,并分析了文献,以确定可能与 NBIA 生物标志物相关的参数。

将研究两个不同的群体:

  • 波尔多大学医院目前使用的基因panel测序后未发现突变的一组NBIA患者。 基因检测将在另一种靶向富集方法的帮助下进行,该方法适用于 16 个 NBIA 基因。
  • 将分析一组具有 2 种常见 NBIA 形式和已识别变体的患者,以评估来自成纤维细胞的最佳线粒体标记物。

研究人员计划在负责神经变性的法国罕见疾病网络和参与线粒体疾病诊断的“CARAMMEL”网络的支持下,将这些新的遗传和生化策略转移到诊断程序中。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

70

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

      • Talence、法国
        • Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 孩子
  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

NBIA患者

描述

纳入标准:

  • NBIA 诊断为以下基因的致病性变异或任何可能影响基因功能(根据 ACMG 标准为 4 级或 5 级)的变异的患者:C19ORF12、PANK2、PLA2G6、DCAF17、FA2H、WDR45、FTL、CP 和 ATP13A2,并且其成纤维细胞已在波尔多大学医院收集,用于诊断过程中的功能分析
  • NBIA 患者在这九个基因中都没有进行确凿的测试,并且在波尔多大学医院的诊断过程中收集了他们的 DNA

排除标准:

  • 无 NBIA 影像学(MRI 或扫描)体征的患者
  • 没有法国医疗保险的患者

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:队列
  • 时间观点:追溯

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
仍未进行分子诊断的 NBIA 患者
一组 40 名 NBIA 患者,仍未进行分子诊断
使用专用的自定义捕获和中等通量测序协议对一组 22 个基因(9 个已知基因和 13 个新基因)进行测序测试。
发现基因突变的 NBIA 患者
一组携带基因突变的 2 种常见 NBIA 患者(已在 CHU 分子诊断实验室进行研究)
从皮肤活检获得的培养成纤维细胞中建立线粒体标记。 建立酵母模型以显示生化线粒体改变:在泛酸激酶酵母基因 Cab1 中引入错义变异,其缺失是致命的,随后突变菌株在发酵和呼吸培养基中生长。

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
使用专用定制捕获和中等通量测序方案对一组 22 个基因进行测序测试。
大体时间:通过学习完成,平均2年
覆盖记录(设计区域的百分比)
通过学习完成,平均2年
使用专用定制捕获和中等通量测序方案对一组 22 个基因进行测序测试。
大体时间:通过学习完成,平均4年
测序深度记录(reads数)
通过学习完成,平均4年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
使用患者成纤维细胞的生化分析鉴定主要形式
大体时间:通过学习完成,平均2年
用电压依赖性阴离子通道 (VDAC) 标记计数线粒体
通过学习完成,平均2年
使用患者成纤维细胞的生化分析鉴定主要形式
大体时间:通过学习完成,平均2年
铁剥夺和铁负荷后铁和铁蛋白细胞水平的测量
通过学习完成,平均2年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Patricia FERGELOT MAURIN、University Hospital, Bordeaux

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2018年1月4日

初级完成 (实际的)

2020年11月30日

研究完成 (实际的)

2020年11月30日

研究注册日期

首次提交

2021年7月1日

首先提交符合 QC 标准的

2022年11月7日

首次发布 (实际的)

2022年11月14日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2022年11月14日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2022年11月7日

最后验证

2022年9月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

不

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

在美国制造并从美国出口的产品

不

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