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Testen von NBIA-Genen: Analyse der genetischen Heterogenität und Validierung von mitochondrialen Markern zur Beurteilung der Kausalität von Sequenzvarianten. (NBIA MITO)

7. November 2022 aktualisiert von: University Hospital, Bordeaux

Neurodegeneration mit Eisenakkumulation im Gehirn (NBIA) stellt eine Gruppe seltener neurologischer Entwicklungserkrankungen dar, die sowohl genetisch als auch phänotypisch heterogen sind.

Die Diagnose basiert auf der MRT des Gehirns. Es basiert auch auf Gentests. Es bestehen jedoch Überschneidungen zwischen den verschiedenen klinischen Präsentationen und die molekulare Diagnose kann falsch interpretiert werden.

Zwei Hauptzwecke müssen angegangen werden, um eine bessere molekulare Diagnose zu erhalten: einerseits das Erreichen einer ausreichenden Vollständigkeit, die mit einem größeren Gen-Panel und Sequenzierung der nächsten Generation durchgeführt werden kann; Andererseits ist es nun notwendig, die schädlichen Folgen von Varianten mit Hilfe von Funktionsstudien zu validieren oder zu bestätigen.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

Neurodegeneration mit Eisenakkumulation im Gehirn (NBIA) stellt eine Gruppe seltener neurologischer Entwicklungserkrankungen dar, die sowohl genetisch als auch phänotypisch heterogen sind.

Die Diagnose basiert auf der MRT des Gehirns. Es zeigt abnorme Eisenablagerungen in den Basalganglien, insbesondere im Globus pallidus und der Substanz nigra. Es basiert auch auf Gentests. Zehn individualisierte Formen werden nun beschrieben. Es bestehen jedoch Überschneidungen zwischen den verschiedenen klinischen Präsentationen und die molekulare Diagnose kann aufgrund von Varianten, die als Varianten mit unbekannter Bedeutung bezeichnet werden, deren pathogene Rolle nicht bewiesen ist, falsch interpretiert werden. Etwa die Hälfte der klinisch relevanten Fälle mit Eisenablagerungen im MRT des Gehirns bleiben ohne molekulare schädliche Veränderung.

Zwei Hauptzwecke müssen angegangen werden, um eine bessere molekulare Diagnose zu erhalten: einerseits das Erreichen einer ausreichenden Vollständigkeit, die mit einem größeren Gen-Panel und Sequenzierung der nächsten Generation durchgeführt werden kann; Dieses Panel wird neue Gene enthalten und könnte erweitert werden, wenn mehr Gene identifiziert werden. Andererseits ist es nun notwendig, die schädlichen Folgen von Varianten mit Hilfe von Funktionsstudien zu validieren oder zu bestätigen.

Vier Hauptwege sind an der Pathophysiologie von NBIA beteiligt: ​​Eisen- und Lipidstoffwechsel, mitochondrialer Stoffwechsel und Autophagie.

In Anbetracht der Tatsache, dass biochemische Mechanismen innerhalb des Mitochodrions an diesen vier Signalwegen beteiligt sind, führten die Forscher einen ersten Test ausgehend von den Fibroblasten des Patienten durch und analysierten die Literatur, um die Parameter zu definieren, die als biologische Marker von NBIA relevant sein könnten.

Es werden zwei verschiedene Gruppen untersucht:

  • Eine Gruppe von NBIA-Patienten ohne gefundene Mutation nach Sequenzierung des derzeit an der Universitätsklinik von Bordeaux verwendeten Genpanels. Gentests werden mit Hilfe einer alternativen Methode der Zielanreicherung durchgeführt, die auf 16 NBIA-Gene angewendet wird.
  • Eine Gruppe von Patienten mit 2 häufigen Formen von NBIA mit identifizierten Varianten wird analysiert, um die besten mitochondrialen Marker von Fibroblasten zu bestimmen.

Die Forscher planen, diese neuen genetischen und biochemischen Strategien mit Unterstützung des französischen Netzwerks für seltene Krankheiten, das für Neurodegenerationen zuständig ist, und des „CARAMMEL“-Netzwerks, das an der Diagnose von mitochondrialen Erkrankungen beteiligt ist, auf diagnostische Verfahren zu übertragen.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

70

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

      • Talence, Frankreich
        • Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patienten mit NBIA

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • NBIA Patienten, bei denen eine pathogene Variation oder eine Variation, die die Genfunktion (Klasse 4 oder 5 gemäß ACMG-Kriterien) beeinträchtigen könnte, in den folgenden Genen diagnostiziert wurde: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP und ATP13A2 und deren Fibroblasten wurden im Universitätsklinikum Bordeaux zur Funktionsanalyse während des Diagnoseverfahrens gesammelt
  • NBIA-Patienten ohne schlüssigen Test auf keines dieser neun Gene und deren DNA während des Diagnoseverfahrens im Universitätsklinikum Bordeaux gesammelt wurde

Ausschlusskriterien:

  • Patienten ohne bildgebende (MRT oder Scan) Anzeichen von NBIA
  • Patienten ohne französische Krankenversicherung

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Kohorte
  • Zeitperspektiven: Retrospektive

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Patienten mit NBIA, die ohne molekulare Diagnose bleiben
Eine Gruppe von 40 Patienten mit NBIA, die ohne molekulare Diagnose bleiben
Sequenzierungstests einer Reihe von 22 Genen (9 bereits bekannte und 13 neue Gene) unter Verwendung eines speziellen benutzerdefinierten Erfassungs- und Sequenzierungsprotokolls mit mittlerem Durchsatz.
Patienten mit NBIA mit identifizierten Mutationen in Genen
Eine Gruppe von Patienten mit 2 häufigen Formen von NBIA, die Mutationen in Genen tragen (bereits im molekulardiagnostischen Labor des CHU untersucht)
Etablierung von mitochondrialen Markern aus Fibroblasten in Kultur, gewonnen aus einer Hautbiopsie. Etablierung von Hefemodellen zur Darstellung biochemischer mitochondrialer Veränderungen: Einführung von Missense-Varianten in das Pantothenatkinase-Hefegen Cab1, dessen Deletion tödlich ist, gefolgt von Wachstum mutierter Stämme auf Fermentations- und Atmungsmedien.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Sequenzierungstests eines Panels von 22 Genen unter Verwendung einer dedizierten benutzerdefinierten Erfassung und eines Sequenzierungsprotokolls mit mittlerem Durchsatz.
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre
Aufzeichnungen über die Abdeckung (% der entworfenen Regionen)
bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre
Sequenzierungstests eines Panels von 22 Genen unter Verwendung einer dedizierten benutzerdefinierten Erfassung und eines Sequenzierungsprotokolls mit mittlerem Durchsatz.
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss durchschnittlich 4 Jahre
Aufzeichnungen über die Tiefe der Sequenzierung (liest Anzahl)
bis zum Studienabschluss durchschnittlich 4 Jahre

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Identifizierung der dominanten Form durch biochemische Analyse in den Fibroblasten des Patienten
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre
Zählung von Mitochondrien mit Kennzeichnung des spannungsabhängigen Anionenkanals (VDAC).
bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre
Identifizierung der dominanten Form durch biochemische Analyse in den Fibroblasten des Patienten
Zeitfenster: bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre
Messungen der zellulären Eisen- und Ferritinspiegel nach Eisenentzug und Eisenbelastung
bis zum Studienabschluss, durchschnittlich 2 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

4. Januar 2018

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

30. November 2020

Studienabschluss (Tatsächlich)

30. November 2020

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

1. Juli 2021

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

7. November 2022

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

14. November 2022

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

14. November 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

7. November 2022

Zuletzt verifiziert

1. September 2022

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

Nein

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

Klinische Studien zur Sequenzierungstests

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