Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Testen van NBIA-genen: analyse van genetische heterogeniteit en validatie van mitochondriale markers voor het beoordelen van de causaliteit van sequentievarianten. (NBIA MITO)

7 november 2022 bijgewerkt door: University Hospital, Bordeaux

Neurodegeneratie met hersenijzeraccumulatie (NBIA) vertegenwoordigt een groep zeldzame neurologische ontwikkelingsziekten, zowel genetisch als fenotypisch heterogeen.

De diagnose is gebaseerd op hersen-MRI. Het is ook gebaseerd op genetische testen. Er bestaan ​​echter overlappingen tussen de verschillende klinische presentaties en de moleculaire diagnose kan verkeerd worden geïnterpreteerd.

Er moeten twee hoofddoelen worden nagestreefd om een ​​betere moleculaire diagnose te krijgen: aan de ene kant het bereiken van voldoende volledigheid, wat kan worden uitgevoerd met een groter genenpanel en sequentiëring van de volgende generatie; aan de andere kant is het nu nodig om de schadelijke gevolgen van varianten te valideren of te bevestigen met behulp van functionele studies.

Studie Overzicht

Gedetailleerde beschrijving

Neurodegeneratie met hersenijzeraccumulatie (NBIA) vertegenwoordigt een groep zeldzame neurologische ontwikkelingsziekten, zowel genetisch als fenotypisch heterogeen.

De diagnose is gebaseerd op hersen-MRI. Het vertoont abnormale ijzerafzetting in de basale ganglia, vooral in de globus pallidus en de substantie nigra. Het is ook gebaseerd op genetische testen. Er worden nu tien geïndividualiseerde vormen beschreven. Er zijn echter overlappingen tussen de verschillende klinische presentaties en de moleculaire diagnose kan verkeerd worden geïnterpreteerd vanwege varianten, genoemd als varianten met onbekende betekenis, waarvan de pathogene rol niet is bewezen. Ongeveer de helft van de klinisch relevante gevallen met ijzerafzettingen op MRI van de hersenen blijft zonder enige moleculaire schadelijke wijziging.

Er moeten twee hoofddoelen worden nagestreefd om een ​​betere moleculaire diagnose te krijgen: aan de ene kant het bereiken van voldoende volledigheid, wat kan worden uitgevoerd met een groter genenpanel en sequentiëring van de volgende generatie; dit panel zal nieuwe genen bevatten en kan worden uitgebreid naarmate er meer genen worden geïdentificeerd. Aan de andere kant is het nu nodig om de schadelijke gevolgen van varianten te valideren of te weerleggen met behulp van functionele studies.

Vier belangrijke routes zijn betrokken bij de pathofysiologie van NBIA: ijzer- en lipidenmetabolisme, mitochondriaal metabolisme en autofagie.

Gezien het feit dat biochemische mechanismen in het mitochodrion betrokken zijn bij deze vier routes, voerden de onderzoekers een eerste test uit uitgaande van de fibroblasten van de patiënt en analyseerden ze de literatuur om de parameters te definiëren die relevant zouden kunnen zijn als biologische markers van NBIA.

Er worden twee verschillende groepen bestudeerd:

  • Een groep NBIA-patiënten zonder gevonden mutatie na sequencing van het genenpanel dat momenteel wordt gebruikt in het academisch ziekenhuis van Bordeaux. Genetische tests zullen worden uitgevoerd met behulp van een alternatieve methode van doelverrijking toegepast op 16 NBIA-genen.
  • Een groep patiënten met 2 frequente vormen van NBIA met geïdentificeerde varianten zal worden geanalyseerd om de beste mitochondriale markers van fibroblasten te bepalen.

De onderzoekers zijn van plan deze nieuwe genetische en biochemische strategieën over te dragen naar de diagnostische procedures met de steun van het Franse netwerk voor zeldzame ziekten dat verantwoordelijk is voor neurodegeneraties en het "CARAMMEL"-netwerk dat betrokken is bij de diagnose van mitochondriale ziekten.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Werkelijk)

70

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

      • Talence, Frankrijk
        • Centre Hospitalier Universitaire De Bordeaux

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiënten met NBIA

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • NBIA Patiënten gediagnosticeerd met een pathogene variatie of een variatie die de genfunctie zou kunnen beïnvloeden (klasse 4 of 5 volgens ACMG-criteria) in de volgende genen: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP en ATP13A2 en bij wie de fibroblasten zijn verzameld in het Universitair Ziekenhuis van Bordeaux voor functionele analyse tijdens de diagnoseprocedure
  • NBIA-patiënten zonder afdoende testen in geen van deze negen genen en van wie het DNA is verzameld tijdens de diagnoseprocedure in het Universitair Ziekenhuis van Bordeaux

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten zonder beeldvormende (MRI of scan) tekenen van NBIA
  • Patiënten zonder Franse zorgverzekering

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Cohort
  • Tijdsperspectieven: Retrospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Patiënten met NBIA die blijven zonder moleculaire diagnose
Een groep van 40 patiënten met NBIA, die zonder moleculaire diagnose blijven
sequentietests van een panel van 22 genen (9 reeds bekende en 13 nieuwe genen) met behulp van een speciale aangepaste capture en een sequencingprotocol met gemiddelde doorvoer.
Patiënten met NBIA met geïdentificeerde mutaties in genen
Een groep patiënten met 2 frequente vormen van NBIA, drager van mutaties in genen (reeds onderzocht in het moleculair diagnostisch laboratorium van het CHU)
Vaststelling van mitochondriale markers van fibroblasten in kweek, verkregen uit een huidbiopsie. Vaststelling van gistmodellen om biochemische mitochondriale veranderingen aan te tonen: introductie van missense-varianten in het pantothenaatkinase-gistgen Cab1 waarvan de deletie dodelijk is, gevolgd door groei van mutante stammen op fermentatie- en ademhalingsmedia.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Sequentietests van een panel van 22 genen met behulp van een speciale aangepaste capture en een sequencingprotocol met gemiddelde doorvoer.
Tijdsspanne: tot studieafronding gemiddeld 2 jaar
Registraties van dekking (% van ontworpen regio's)
tot studieafronding gemiddeld 2 jaar
Sequentietests van een panel van 22 genen met behulp van een speciale aangepaste capture en een sequencingprotocol met gemiddelde doorvoer.
Tijdsspanne: tot studievoltooiing gemiddeld 4 jaar
Records van diepte van sequencing (lees nummer)
tot studievoltooiing gemiddeld 4 jaar

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Identificatie van de dominante vorm met behulp van biochemische analyse in de fibroblasten van de patiënt
Tijdsspanne: tot studieafronding gemiddeld 2 jaar
Tellen van mitochondriën met spanningsafhankelijke anionkanaal (VDAC) labeling
tot studieafronding gemiddeld 2 jaar
Identificatie van de dominante vorm met behulp van biochemische analyse in de fibroblasten van de patiënt
Tijdsspanne: tot studieafronding gemiddeld 2 jaar
Metingen van ijzer- en ferritine-cellulaire niveaus na ijzertekort en ijzerbelasting
tot studieafronding gemiddeld 2 jaar

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

4 januari 2018

Primaire voltooiing (Werkelijk)

30 november 2020

Studie voltooiing (Werkelijk)

30 november 2020

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

1 juli 2021

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

7 november 2022

Eerst geplaatst (Werkelijk)

14 november 2022

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

14 november 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

7 november 2022

Laatst geverifieerd

1 september 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

Nee

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren