Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Testing av NBIA-gener: Analyse av genetisk heterogenitet og validering av mitokondrielle markører for vurdering av årsakssammenheng for sekvensvarianter. (NBIA MITO)

7. november 2022 oppdatert av: University Hospital, Bordeaux

Nevrodegenerasjon med hjernejernakkumulering (NBIA) representerer en gruppe sjeldne nevroutviklingssykdommer, genetisk så vel som fenotypisk heterogene.

Diagnosen er basert på hjerne-MR. Den er også basert på genetisk testing. Imidlertid eksisterer overlappinger mellom de ulike kliniske presentasjonene og den molekylære diagnosen kan mistolkes.

To hovedformål må adresseres for å få en bedre molekylær diagnose: på den ene siden å nå nok uttømmelighet som kan utføres med et større genpanel og neste generasjons sekvensering; på den annen side er det nå nødvendig å validere eller bekrefte de skadelige konsekvensene av varianter ved hjelp av funksjonelle studier.

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Nevrodegenerasjon med hjernejernakkumulering (NBIA) representerer en gruppe sjeldne nevroutviklingssykdommer, genetisk så vel som fenotypisk heterogene.

Diagnosen er basert på hjerne-MR. Den viser unormal avsetning av jern i basalgangliene, spesielt i globus pallidus og stoffet nigra. Den er også basert på genetisk testing. Ti individualiserte former er nå beskrevet. Imidlertid eksisterer overlappinger mellom de forskjellige kliniske presentasjonene og den molekylære diagnosen kan mistolkes på grunn av varianter, navngitt som varianter av ukjent betydning, der den patogene rollen ikke er bevist. Omtrent halvparten av de klinisk relevante tilfellene med jernavleiringer på hjerne-MR forblir uten noen molekylær skadelig endring.

To hovedformål må adresseres for å få en bedre molekylær diagnose: på den ene siden å nå nok uttømmelighet som kan utføres med et større genpanel og neste generasjons sekvensering; dette panelet vil inkludere nye gener og kan forstørres etter hvert som flere gener blir identifisert. På den annen side er det nå nødvendig å validere eller bekrefte de skadelige konsekvensene av varianter ved hjelp av funksjonelle studier.

Fire hovedveier er involvert i patofysiologien til NBIA: jern- og lipidmetabolisme, mitokondriell metabolisme og autofagi.

Tatt i betraktning at biokjemiske mekanismer inne i mitokondriene er involvert i disse fire banene, utførte etterforskerne en første test med utgangspunkt i pasientens fibroblaster og analyserte litteraturen for å definere parametrene som kan være relevante som biologiske markører for NBIA.

To ulike grupper vil bli studert:

  • En gruppe NBIA-pasienter uten funnet mutasjon etter sekvensering av genpanelet som for tiden brukes ved universitetssykehuset i Bordeaux. Genetisk testing vil bli utført ved hjelp av en alternativ metode for målanriking brukt på 16 NBIA-gener.
  • En gruppe pasienter med 2 hyppige former for NBIA med identifiserte varianter vil bli analysert for å vurdere de beste mitokondrielle markørene fra fibroblaster.

Etterforskerne planlegger å overføre disse nye genetiske og biokjemiske strategiene til diagnostiske prosedyrer med støtte fra det franske nettverket av sjeldne sykdommer med ansvar for nevrodegenerasjoner og "CARAMMEL"-nettverket involvert i diagnostisering av mitokondrielle sykdommer.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Faktiske)

70

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

      • Talence, Frankrike
        • Centre hospitalier universitaire de Bordeaux

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter med NBIA

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • NBIA Pasienter diagnostisert med en patogen variasjon eller en hvilken som helst variasjon som kan påvirke genfunksjon (klasse 4 eller 5 i henhold til ACMG-kriterier) i følgende gener: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP og ATP13A2 og hvis fibroblaster har blitt samlet inn ved Bordeaux universitetssykehus for funksjonsanalyse under diagnoseprosedyren
  • NBIA-pasienter uten konkluderende testing i ingen av disse ni genene og hvis DNA har blitt samlet inn under diagnoseprosedyren ved Bordeaux University Hospital

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter uten bildediagnostikk (MR eller skanning) tegn på NBIA
  • Pasienter uten fransk helseforsikring

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiver: Retrospektiv

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Pasienter med NBIA som forblir uten molekylær diagnose
En gruppe på 40 pasienter med NBIA, som forblir uten molekylær diagnose
sekvenseringstester av et panel med 22 gener (9 allerede kjente og 13 nye gener) ved bruk av en dedikert tilpasset fangst og en sekvenseringsprotokoll med middels gjennomstrømning.
Pasienter med NBIA med identifiserte mutasjoner i gener
En gruppe pasienter med 2 hyppige former for NBIA, som bærer mutasjoner i gener (allerede studert i CHUs molekylærdiagnostiske laboratorium)
Etablering av mitokondrielle markører fra fibroblaster i kultur, hentet fra en hudbiopsi. Etablering av gjærmodeller for å vise biokjemiske mitokondrieendringer: introduksjon av missense-varianter i pantothenatkinase-gjærgenet Cab1 hvis sletting er dødelig, etterfulgt av vekst av mutante stammer på fermentering og respirasjonsmedier.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Sekvenseringstester av et panel med 22 gener ved hjelp av en dedikert tilpasset fangst og en sekvenseringsprotokoll med middels gjennomstrømning.
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
Registreringer av dekning (% av utformede regioner)
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
Sekvenseringstester av et panel med 22 gener ved hjelp av en dedikert tilpasset fangst og en sekvenseringsprotokoll med middels gjennomstrømning.
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 4 år
Registreringer av dybde av sekvensering (leser nummer)
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 4 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Identifikasjon av den dominerende formen ved hjelp av biokjemisk analyse i pasientens fibroblaster
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
Telling av mitokondrier med merking av spenningsavhengig anionkanal (VDAC).
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
Identifikasjon av den dominerende formen ved hjelp av biokjemisk analyse i pasientens fibroblaster
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
Målinger av jern- og ferritincellenivåer etter jernmangel og jernbelastning
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

4. januar 2018

Primær fullføring (Faktiske)

30. november 2020

Studiet fullført (Faktiske)

30. november 2020

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

1. juli 2021

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

7. november 2022

Først lagt ut (Faktiske)

14. november 2022

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

14. november 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

7. november 2022

Sist bekreftet

1. september 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere