- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT05615571
Test dei geni NBIA: analisi dell'eterogeneità genetica e convalida dei marcatori mitocondriali per la valutazione della causalità delle varianti di sequenza. (NBIA MITO)
La neurodegenerazione con accumulo cerebrale di ferro (NBIA) rappresenta un gruppo di malattie rare del neurosviluppo, geneticamente e fenotipicamente eterogenee.
La diagnosi si basa sulla risonanza magnetica cerebrale. Si basa anche su test genetici. Tuttavia esistono sovrapposizioni tra le diverse presentazioni cliniche e la diagnosi molecolare può essere male interpretata.
Due obiettivi principali devono essere affrontati per ottenere una migliore diagnosi molecolare: da un lato raggiungere un'esaustività sufficiente che può essere eseguita con un pannello genico più ampio e il sequenziamento di nuova generazione; d'altra parte, è ora necessario convalidare o infirmare le conseguenze deleterie delle varianti con l'aiuto di studi funzionali.
Panoramica dello studio
Stato
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
La neurodegenerazione con accumulo cerebrale di ferro (NBIA) rappresenta un gruppo di malattie rare del neurosviluppo, geneticamente e fenotipicamente eterogenee.
La diagnosi si basa sulla risonanza magnetica cerebrale. Mostra un deposito anormale di ferro nei gangli della base, specialmente nel globo pallido e nella sostanza nigra. Si basa anche su test genetici. Vengono ora descritte dieci forme individualizzate. Tuttavia esistono sovrapposizioni tra le diverse presentazioni cliniche e la diagnosi molecolare può essere male interpretata a causa di varianti, denominate come varianti di significato sconosciuto, il cui ruolo patogenetico non è dimostrato. Circa la metà dei casi clinicamente rilevanti con depositi di ferro alla risonanza magnetica cerebrale rimane senza alcuna alterazione molecolare deleteria.
Due obiettivi principali devono essere affrontati per ottenere una migliore diagnosi molecolare: da un lato raggiungere un'esaustività sufficiente che può essere eseguita con un pannello genico più ampio e il sequenziamento di nuova generazione; questo pannello includerà nuovi geni e potrebbe essere ampliato man mano che verranno identificati più geni. D'altra parte, è ora necessario convalidare o confermare le conseguenze deleterie delle varianti con l'aiuto di studi funzionali.
Quattro percorsi principali sono coinvolti nella fisiopatologia dell'NBIA: metabolismo del ferro e dei lipidi, metabolismo mitocondriale e autofagia.
Considerando che i meccanismi biochimici all'interno del mitochodrion sono coinvolti in questi quattro percorsi, i ricercatori hanno eseguito un primo test partendo dai fibroblasti del paziente e analizzato la letteratura per definire i parametri che potrebbero essere pertinenti come marcatori biologici di NBIA.
Saranno studiati due diversi gruppi:
- Un gruppo di pazienti NBIA senza mutazione trovata dopo il sequenziamento del pannello genico attualmente utilizzato presso l'ospedale universitario di Bordeaux. I test genetici saranno eseguiti con l'ausilio di un metodo alternativo di arricchimento del target applicato a 16 geni NBIA.
- Verrà analizzato un gruppo di pazienti con 2 forme frequenti di NBIA con varianti identificate per valutare i migliori marcatori mitocondriali da fibroblasti.
I ricercatori intendono trasferire queste nuove strategie genetiche e biochimiche alle procedure diagnostiche con il supporto della rete francese delle malattie rare responsabile delle neurodegenerazioni e della rete "CARAMMEL" coinvolta nella diagnosi delle malattie mitocondriali.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
-
Talence, Francia
- Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- NBIA Pazienti con diagnosi di variazione patogena o qualsiasi variazione che potrebbe influire sulla funzione genica (classe 4 o 5 secondo i criteri ACMG) nei seguenti geni: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP e ATP13A2 e i cui fibroblasti sono stati raccolti presso l'ospedale universitario di Bordeaux per l'analisi funzionale durante la procedura di diagnosi
- Pazienti NBIA senza test conclusivi in nessuno di questi nove geni e il cui DNA è stato raccolto durante la procedura di diagnosi presso l'ospedale universitario di Bordeaux
Criteri di esclusione:
- Pazienti senza segni di imaging (MRI o scansione) di NBIA
- Pazienti senza assicurazione sanitaria francese
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Retrospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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Pazienti con NBIA che rimangono senza diagnosi molecolare
Un gruppo di 40 pazienti con NBIA, che rimangono senza diagnosi molecolare
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test di sequenziamento di un pannello di 22 geni (9 già noti e 13 nuovi geni) utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
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Pazienti con NBIA con mutazioni identificate nei geni
Un gruppo di pazienti con 2 forme frequenti di NBIA, portatori di mutazioni nei geni (già studiati nel laboratorio di diagnostica molecolare CHU)
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Istituzione di marcatori mitocondriali da fibroblasti in coltura, ottenuti da una biopsia cutanea.
Istituzione di modelli di lievito per mostrare alterazioni biochimiche mitocondriali: introduzione di varianti missenso nel gene del lievito pantotenato chinasi Cab1 la cui delezione è letale, seguita dalla crescita di ceppi mutanti sulla fermentazione e sui mezzi respiratori.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Test di sequenziamento di un pannello di 22 geni utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Record di copertura (% delle regioni progettate)
|
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
|
|
Test di sequenziamento di un pannello di 22 geni utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 4 anni
|
Registrazioni della profondità del sequenziamento (numero di letture)
|
attraverso il completamento degli studi, una media di 4 anni
|
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Identificazione della forma dominante mediante analisi biochimica nei fibroblasti del paziente
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Conteggio dei mitocondri con etichettatura del canale anionico dipendente dalla tensione (VDAC).
|
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
|
|
Identificazione della forma dominante mediante analisi biochimica nei fibroblasti del paziente
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Misurazioni dei livelli cellulari di ferro e ferritina dopo deprivazione di ferro e carico di ferro
|
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Investigatori
- Investigatore principale: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Processi patologici
- Malattie del cervello
- Malattie del sistema nervoso centrale
- Malattie del sistema nervoso
- Malattie genetiche, congenite
- Malattie dei gangli basali
- Disturbi del movimento
- Malattie Neurodegenerative
- Malattie Eredodegenerative, Sistema Nervoso
- Distrofie neuroassonali
- Neurodegenerazione associata alla pantotenato chinasi
- Degenerazione nervosa
Altri numeri di identificazione dello studio
- CHUBX 2017/38
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
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Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
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