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Test dei geni NBIA: analisi dell'eterogeneità genetica e convalida dei marcatori mitocondriali per la valutazione della causalità delle varianti di sequenza. (NBIA MITO)

7 novembre 2022 aggiornato da: University Hospital, Bordeaux

La neurodegenerazione con accumulo cerebrale di ferro (NBIA) rappresenta un gruppo di malattie rare del neurosviluppo, geneticamente e fenotipicamente eterogenee.

La diagnosi si basa sulla risonanza magnetica cerebrale. Si basa anche su test genetici. Tuttavia esistono sovrapposizioni tra le diverse presentazioni cliniche e la diagnosi molecolare può essere male interpretata.

Due obiettivi principali devono essere affrontati per ottenere una migliore diagnosi molecolare: da un lato raggiungere un'esaustività sufficiente che può essere eseguita con un pannello genico più ampio e il sequenziamento di nuova generazione; d'altra parte, è ora necessario convalidare o infirmare le conseguenze deleterie delle varianti con l'aiuto di studi funzionali.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

La neurodegenerazione con accumulo cerebrale di ferro (NBIA) rappresenta un gruppo di malattie rare del neurosviluppo, geneticamente e fenotipicamente eterogenee.

La diagnosi si basa sulla risonanza magnetica cerebrale. Mostra un deposito anormale di ferro nei gangli della base, specialmente nel globo pallido e nella sostanza nigra. Si basa anche su test genetici. Vengono ora descritte dieci forme individualizzate. Tuttavia esistono sovrapposizioni tra le diverse presentazioni cliniche e la diagnosi molecolare può essere male interpretata a causa di varianti, denominate come varianti di significato sconosciuto, il cui ruolo patogenetico non è dimostrato. Circa la metà dei casi clinicamente rilevanti con depositi di ferro alla risonanza magnetica cerebrale rimane senza alcuna alterazione molecolare deleteria.

Due obiettivi principali devono essere affrontati per ottenere una migliore diagnosi molecolare: da un lato raggiungere un'esaustività sufficiente che può essere eseguita con un pannello genico più ampio e il sequenziamento di nuova generazione; questo pannello includerà nuovi geni e potrebbe essere ampliato man mano che verranno identificati più geni. D'altra parte, è ora necessario convalidare o confermare le conseguenze deleterie delle varianti con l'aiuto di studi funzionali.

Quattro percorsi principali sono coinvolti nella fisiopatologia dell'NBIA: metabolismo del ferro e dei lipidi, metabolismo mitocondriale e autofagia.

Considerando che i meccanismi biochimici all'interno del mitochodrion sono coinvolti in questi quattro percorsi, i ricercatori hanno eseguito un primo test partendo dai fibroblasti del paziente e analizzato la letteratura per definire i parametri che potrebbero essere pertinenti come marcatori biologici di NBIA.

Saranno studiati due diversi gruppi:

  • Un gruppo di pazienti NBIA senza mutazione trovata dopo il sequenziamento del pannello genico attualmente utilizzato presso l'ospedale universitario di Bordeaux. I test genetici saranno eseguiti con l'ausilio di un metodo alternativo di arricchimento del target applicato a 16 geni NBIA.
  • Verrà analizzato un gruppo di pazienti con 2 forme frequenti di NBIA con varianti identificate per valutare i migliori marcatori mitocondriali da fibroblasti.

I ricercatori intendono trasferire queste nuove strategie genetiche e biochimiche alle procedure diagnostiche con il supporto della rete francese delle malattie rare responsabile delle neurodegenerazioni e della rete "CARAMMEL" coinvolta nella diagnosi delle malattie mitocondriali.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

70

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Talence, Francia
        • Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Pazienti con NBIA

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • NBIA Pazienti con diagnosi di variazione patogena o qualsiasi variazione che potrebbe influire sulla funzione genica (classe 4 o 5 secondo i criteri ACMG) nei seguenti geni: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP e ATP13A2 e i cui fibroblasti sono stati raccolti presso l'ospedale universitario di Bordeaux per l'analisi funzionale durante la procedura di diagnosi
  • Pazienti NBIA senza test conclusivi in ​​nessuno di questi nove geni e il cui DNA è stato raccolto durante la procedura di diagnosi presso l'ospedale universitario di Bordeaux

Criteri di esclusione:

  • Pazienti senza segni di imaging (MRI o scansione) di NBIA
  • Pazienti senza assicurazione sanitaria francese

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Coorte
  • Prospettive temporali: Retrospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con NBIA che rimangono senza diagnosi molecolare
Un gruppo di 40 pazienti con NBIA, che rimangono senza diagnosi molecolare
test di sequenziamento di un pannello di 22 geni (9 già noti e 13 nuovi geni) utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
Pazienti con NBIA con mutazioni identificate nei geni
Un gruppo di pazienti con 2 forme frequenti di NBIA, portatori di mutazioni nei geni (già studiati nel laboratorio di diagnostica molecolare CHU)
Istituzione di marcatori mitocondriali da fibroblasti in coltura, ottenuti da una biopsia cutanea. Istituzione di modelli di lievito per mostrare alterazioni biochimiche mitocondriali: introduzione di varianti missenso nel gene del lievito pantotenato chinasi Cab1 la cui delezione è letale, seguita dalla crescita di ceppi mutanti sulla fermentazione e sui mezzi respiratori.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Test di sequenziamento di un pannello di 22 geni utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Record di copertura (% delle regioni progettate)
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Test di sequenziamento di un pannello di 22 geni utilizzando un'acquisizione personalizzata dedicata e un protocollo di sequenziamento a media velocità.
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 4 anni
Registrazioni della profondità del sequenziamento (numero di letture)
attraverso il completamento degli studi, una media di 4 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Identificazione della forma dominante mediante analisi biochimica nei fibroblasti del paziente
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Conteggio dei mitocondri con etichettatura del canale anionico dipendente dalla tensione (VDAC).
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Identificazione della forma dominante mediante analisi biochimica nei fibroblasti del paziente
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Misurazioni dei livelli cellulari di ferro e ferritina dopo deprivazione di ferro e carico di ferro
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

4 gennaio 2018

Completamento primario (Effettivo)

30 novembre 2020

Completamento dello studio (Effettivo)

30 novembre 2020

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

1 luglio 2021

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

7 novembre 2022

Primo Inserito (Effettivo)

14 novembre 2022

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

14 novembre 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

7 novembre 2022

Ultimo verificato

1 settembre 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

No

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Test di sequenziamento

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