- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT05615571
Testning av NBIA-gener: Analys av genetisk heterogenitet och validering av mitokondriella markörer för bedömning av kausalitet av sekvensvarianter. (NBIA MITO)
Neurodegeneration med hjärnansamling av järn (NBIA) representerar en grupp sällsynta neuroutvecklingssjukdomar, genetiskt såväl som fenotypiskt heterogena.
Diagnosen baseras på hjärn-MR. Den är också baserad på genetiska tester. Det finns dock överlappningar mellan de olika kliniska presentationerna och den molekylära diagnosen kan misstolkas.
Två huvudsyften måste åtgärdas för att få en bättre molekylär diagnos: å ena sidan nå tillräckligt uttömmande som kan utföras med en större genpanel och nästa generations sekvensering; å andra sidan är det nu nödvändigt att validera eller bekräfta de skadliga konsekvenserna av varianter med hjälp av funktionsstudier.
Studieöversikt
Status
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Neurodegeneration med hjärnansamling av järn (NBIA) representerar en grupp sällsynta neuroutvecklingssjukdomar, genetiskt såväl som fenotypiskt heterogena.
Diagnosen baseras på hjärn-MR. Den visar onormal avlagring av järn i basalganglierna, speciellt i globus pallidus och ämnet nigra. Den är också baserad på genetiska tester. Tio individualiserade former beskrivs nu. Det finns dock överlappningar mellan de olika kliniska presentationerna och den molekylära diagnosen kan misstolkas på grund av varianter, namngivna som varianter av okänd betydelse, vars patogena roll inte är bevisad. Ungefär hälften av de kliniskt relevanta fallen med järnavlagringar på hjärn-MRT kvarstår utan någon molekylär skadlig förändring.
Två huvudsyften måste åtgärdas för att få en bättre molekylär diagnos: å ena sidan nå tillräckligt uttömmande som kan utföras med en större genpanel och nästa generations sekvensering; denna panel kommer att inkludera nya gener och skulle kunna utökas när fler gener identifieras. Å andra sidan är det nu nödvändigt att validera eller invalidera de skadliga konsekvenserna av varianter med hjälp av funktionsstudier.
Fyra huvudvägar är involverade i patofysiologin för NBIA: järn- och lipidmetabolism, mitokondriell metabolism och autofagi.
Med tanke på att biokemiska mekanismer inuti mitokondrien är involverade i dessa fyra vägar, utförde utredarna ett första test med utgångspunkt från patientens fibroblaster och analyserade litteraturen för att definiera de parametrar som kan vara relevanta som biologiska markörer för NBIA.
Två olika grupper kommer att studeras:
- En grupp NBIA-patienter utan funnen mutation efter sekvensering av genpanelen som för närvarande används vid universitetssjukhuset i Bordeaux. Genetisk testning kommer att utföras med hjälp av en alternativ metod för målberikning applicerad på 16 NBIA-gener.
- En grupp patienter med 2 frekventa former av NBIA med identifierade varianter kommer att analyseras för att bedöma de bästa mitokondriella markörerna från fibroblaster.
Utredarna planerar att överföra dessa nya genetiska och biokemiska strategier till diagnostiska procedurer med stöd av det franska nätverket för sällsynta sjukdomar som ansvarar för neurodegenerationer och nätverket "CARAMMEL" som är involverat i diagnostik av mitokondriella sjukdomar.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Talence, Frankrike
- Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- NBIA Patienter som diagnostiserats med en patogen variation eller någon variation som kan påverka genfunktionen (klass 4 eller 5 enligt ACMG-kriterier) i följande gener: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP och ATP13A2 och vars fibroblaster har samlats in på Bordeaux universitetssjukhus för funktionsanalys under diagnosproceduren
- NBIA-patienter utan avgörande test i ingen av dessa nio gener och vars DNA har samlats in under diagnosproceduren på Bordeaux University Hospital
Exklusions kriterier:
- Patienter utan avbildning (MRT eller skanning) tecken på NBIA
- Patienter utan fransk sjukförsäkring
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Retrospektiv
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
---|---|
Patienter med NBIA som förblir utan molekylär diagnos
En grupp på 40 patienter med NBIA, som förblir utan molekylär diagnos
|
sekvenseringstester av en panel med 22 gener (9 redan kända och 13 nya gener) med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
|
Patienter med NBIA med identifierade mutationer i gener
En grupp patienter med 2 frekventa former av NBIA, som bär mutationer i gener (redan studerat i CHU:s molekylärdiagnostiska laboratorium)
|
Etablering av mitokondriella markörer från fibroblaster i kultur, erhållna från en hudbiopsi.
Etablering av jästmodeller för att visa biokemiska mitokondriella förändringar: införande av missense-varianter i pantotenatkinasjästgenen Cab1 vars deletion är dödlig, följt av tillväxt av mutanta stammar på fermentering och respiratoriska medier.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
---|---|---|
Sekvenseringstester av en panel med 22 gener med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Register över täckning (% av designade regioner)
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Sekvenseringstester av en panel med 22 gener med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 4 år
|
Registreringar av djup av sekvensering (läser nummer)
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 4 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
---|---|---|
Identifiering av den dominerande formen med hjälp av biokemisk analys i patientens fibroblaster
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Räkning av mitokondrier med spänningsberoende anjonkanal (VDAC) märkning
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Identifiering av den dominerande formen med hjälp av biokemisk analys i patientens fibroblaster
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Mätningar av järn- och ferritincellulära nivåer efter järnbrist och järnladdning
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
- Patologiska processer
- Hjärnsjukdomar
- Sjukdomar i centrala nervsystemet
- Sjukdomar i nervsystemet
- Genetiska sjukdomar, medfödda
- Basala ganglia sjukdomar
- Rörelsestörningar
- Neurodegenerativa sjukdomar
- Heredodegenerativa störningar, nervsystemet
- Neuroaxonala dystrofier
- Pantotenatkinas-associerad neurodegeneration
- Nervdegeneration
Andra studie-ID-nummer
- CHUBX 2017/38
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Sekvenseringstester
-
Mayo ClinicAktiv, inte rekryterandeBenign pankreatisk neoplasm | Malign bukspottkörtelneoplasmaFörenta staterna
-
University of California, San FranciscoAvslutadSkelettanomalier | Flera anomalier | Strukturella anomalier | Hjärtavvikelser | Anomalier i centrala nervsystemet | Thorax anomalier | Genito-urinära anomalier | Gastrointestinala anomalierFörenta staterna
-
Jagiellonian UniversityRekrytering
-
University Hospital TuebingenRekryteringSällsynta sjukdomar | Genetisk predispositionTyskland
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteDana-Farber Cancer InstituteAktiv, inte rekryterandeIcke-småcellig lungcancerFörenta staterna
-
University of Illinois College of Medicine at PeoriaRady Children's Institute of Genomic MedicineAktiv, inte rekryterandeGenetisk sjukdom | Genetiskt syndromFörenta staterna
-
Samsung Medical CenterRekryteringTrippel negativ bröstcancer | Pembrolizumab | Neoadjuvant kemoterapi | TumörmikromiljöKorea, Republiken av
-
Imperial College London Diabetes CentreOkändMendelska sjukdomar | Genetisk störning | Ny mutation | Ärftlig sjukdom | De Novo Mutation | Ärftlig sjukdom | Singelgen defekterFörenade arabemiraten
-
Munich Leukemia LaboratoryIllumina, Inc.RekryteringLeukemi | Sällsynta sjukdomar | Refraktärt lymfom | Hematologisk malignitet | Refraktär leukemi | Okända primära tumörerTyskland
-
Ambry GeneticsBeth Israel Deaconess Medical Center; HonorHealth Research Institute; University...AvslutadDuktalt adenokarcinom i bukspottkörtelnFörenta staterna