Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Testning av NBIA-gener: Analys av genetisk heterogenitet och validering av mitokondriella markörer för bedömning av kausalitet av sekvensvarianter. (NBIA MITO)

7 november 2022 uppdaterad av: University Hospital, Bordeaux

Neurodegeneration med hjärnansamling av järn (NBIA) representerar en grupp sällsynta neuroutvecklingssjukdomar, genetiskt såväl som fenotypiskt heterogena.

Diagnosen baseras på hjärn-MR. Den är också baserad på genetiska tester. Det finns dock överlappningar mellan de olika kliniska presentationerna och den molekylära diagnosen kan misstolkas.

Två huvudsyften måste åtgärdas för att få en bättre molekylär diagnos: å ena sidan nå tillräckligt uttömmande som kan utföras med en större genpanel och nästa generations sekvensering; å andra sidan är det nu nödvändigt att validera eller bekräfta de skadliga konsekvenserna av varianter med hjälp av funktionsstudier.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Neurodegeneration med hjärnansamling av järn (NBIA) representerar en grupp sällsynta neuroutvecklingssjukdomar, genetiskt såväl som fenotypiskt heterogena.

Diagnosen baseras på hjärn-MR. Den visar onormal avlagring av järn i basalganglierna, speciellt i globus pallidus och ämnet nigra. Den är också baserad på genetiska tester. Tio individualiserade former beskrivs nu. Det finns dock överlappningar mellan de olika kliniska presentationerna och den molekylära diagnosen kan misstolkas på grund av varianter, namngivna som varianter av okänd betydelse, vars patogena roll inte är bevisad. Ungefär hälften av de kliniskt relevanta fallen med järnavlagringar på hjärn-MRT kvarstår utan någon molekylär skadlig förändring.

Två huvudsyften måste åtgärdas för att få en bättre molekylär diagnos: å ena sidan nå tillräckligt uttömmande som kan utföras med en större genpanel och nästa generations sekvensering; denna panel kommer att inkludera nya gener och skulle kunna utökas när fler gener identifieras. Å andra sidan är det nu nödvändigt att validera eller invalidera de skadliga konsekvenserna av varianter med hjälp av funktionsstudier.

Fyra huvudvägar är involverade i patofysiologin för NBIA: järn- och lipidmetabolism, mitokondriell metabolism och autofagi.

Med tanke på att biokemiska mekanismer inuti mitokondrien är involverade i dessa fyra vägar, utförde utredarna ett första test med utgångspunkt från patientens fibroblaster och analyserade litteraturen för att definiera de parametrar som kan vara relevanta som biologiska markörer för NBIA.

Två olika grupper kommer att studeras:

  • En grupp NBIA-patienter utan funnen mutation efter sekvensering av genpanelen som för närvarande används vid universitetssjukhuset i Bordeaux. Genetisk testning kommer att utföras med hjälp av en alternativ metod för målberikning applicerad på 16 NBIA-gener.
  • En grupp patienter med 2 frekventa former av NBIA med identifierade varianter kommer att analyseras för att bedöma de bästa mitokondriella markörerna från fibroblaster.

Utredarna planerar att överföra dessa nya genetiska och biokemiska strategier till diagnostiska procedurer med stöd av det franska nätverket för sällsynta sjukdomar som ansvarar för neurodegenerationer och nätverket "CARAMMEL" som är involverat i diagnostik av mitokondriella sjukdomar.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Faktisk)

70

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

      • Talence, Frankrike
        • Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Barn
  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patienter med NBIA

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • NBIA Patienter som diagnostiserats med en patogen variation eller någon variation som kan påverka genfunktionen (klass 4 eller 5 enligt ACMG-kriterier) i följande gener: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP och ATP13A2 och vars fibroblaster har samlats in på Bordeaux universitetssjukhus för funktionsanalys under diagnosproceduren
  • NBIA-patienter utan avgörande test i ingen av dessa nio gener och vars DNA har samlats in under diagnosproceduren på Bordeaux University Hospital

Exklusions kriterier:

  • Patienter utan avbildning (MRT eller skanning) tecken på NBIA
  • Patienter utan fransk sjukförsäkring

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiv: Retrospektiv

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Patienter med NBIA som förblir utan molekylär diagnos
En grupp på 40 patienter med NBIA, som förblir utan molekylär diagnos
sekvenseringstester av en panel med 22 gener (9 redan kända och 13 nya gener) med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
Patienter med NBIA med identifierade mutationer i gener
En grupp patienter med 2 frekventa former av NBIA, som bär mutationer i gener (redan studerat i CHU:s molekylärdiagnostiska laboratorium)
Etablering av mitokondriella markörer från fibroblaster i kultur, erhållna från en hudbiopsi. Etablering av jästmodeller för att visa biokemiska mitokondriella förändringar: införande av missense-varianter i pantotenatkinasjästgenen Cab1 vars deletion är dödlig, följt av tillväxt av mutanta stammar på fermentering och respiratoriska medier.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Sekvenseringstester av en panel med 22 gener med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Register över täckning (% av designade regioner)
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Sekvenseringstester av en panel med 22 gener med hjälp av en dedikerad anpassad infångning och ett sekvenseringsprotokoll med medelhög genomströmning.
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 4 år
Registreringar av djup av sekvensering (läser nummer)
genom avslutad studie, i genomsnitt 4 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Identifiering av den dominerande formen med hjälp av biokemisk analys i patientens fibroblaster
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Räkning av mitokondrier med spänningsberoende anjonkanal (VDAC) märkning
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Identifiering av den dominerande formen med hjälp av biokemisk analys i patientens fibroblaster
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Mätningar av järn- och ferritincellulära nivåer efter järnbrist och järnladdning
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

4 januari 2018

Primärt slutförande (Faktisk)

30 november 2020

Avslutad studie (Faktisk)

30 november 2020

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

1 juli 2021

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

7 november 2022

Första postat (Faktisk)

14 november 2022

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

14 november 2022

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

7 november 2022

Senast verifierad

1 september 2022

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

Nej

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Sekvenseringstester

3
Prenumerera