Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Test af NBIA-gener: Analyse af genetisk heterogenitet og validering af mitokondrielle markører til vurdering af kausalitet af sekvensvarianter. (NBIA MITO)

7. november 2022 opdateret af: University Hospital, Bordeaux

Neurodegeneration med hjernejernakkumulering (NBIA) repræsenterer en gruppe af sjældne neuroudviklingssygdomme, genetisk såvel som fænotypisk heterogene.

Diagnosen er baseret på hjerne-MR. Det er også baseret på genetisk testning. Der er dog overlapninger mellem de forskellige kliniske præsentationer, og den molekylære diagnose kan misfortolkes.

To hovedformål skal løses for at få en bedre molekylær diagnose: på den ene side at nå tilstrækkelig udtømmende, som kan udføres med et større genpanel og næste generations sekventering; på den anden side er det nu nødvendigt at validere eller bekræfte de skadelige konsekvenser af varianter ved hjælp af funktionelle undersøgelser.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Neurodegeneration med hjernejernakkumulering (NBIA) repræsenterer en gruppe af sjældne neuroudviklingssygdomme, genetisk såvel som fænotypisk heterogene.

Diagnosen er baseret på hjerne-MR. Det viser unormal aflejring af jern i basalganglierne, især i globus pallidus og stoffet nigra. Det er også baseret på genetisk testning. Ti individualiserede former er nu beskrevet. Der eksisterer imidlertid overlapninger mellem de forskellige kliniske præsentationer, og den molekylære diagnose kan misfortolkes på grund af varianter, navngivet som varianter af ukendt betydning, hvis patogene rolle ikke er bevist. Cirka halvdelen af ​​de klinisk relevante tilfælde med jernaflejringer på hjerne-MR forbliver uden nogen molekylær skadelig ændring.

To hovedformål skal løses for at få en bedre molekylær diagnose: på den ene side at nå tilstrækkelig udtømmende, som kan udføres med et større genpanel og næste generations sekventering; dette panel vil omfatte nye gener og kan forstørres, efterhånden som flere gener identificeres. På den anden side er det nu nødvendigt at validere eller bekræfte de skadelige konsekvenser af varianter ved hjælp af funktionelle undersøgelser.

Fire hovedveje er involveret i patofysiologien af ​​NBIA: jern- og lipidmetabolisme, mitokondriel metabolisme og autofagi.

I betragtning af at biokemiske mekanismer inde i mitochodrion er involveret i disse fire veje, udførte efterforskerne en første test med udgangspunkt i patientens fibroblaster og analyserede litteraturen for at definere de parametre, der kunne være relevante som biologiske markører for NBIA.

To forskellige grupper vil blive undersøgt:

  • En gruppe NBIA-patienter uden fundet mutation efter sekventering af genpanelet, der i øjeblikket anvendes på universitetshospitalet i Bordeaux. Gentestning vil blive udført ved hjælp af en alternativ metode til målberigelse anvendt på 16 NBIA-gener.
  • En gruppe patienter med 2 hyppige former for NBIA med identificerede varianter vil blive analyseret for at vurdere de bedste mitokondrielle markører fra fibroblaster.

Efterforskerne planlægger at overføre disse nye genetiske og biokemiske strategier til diagnostiske procedurer med støtte fra det franske netværk af sjældne sygdomme, der er ansvarligt for neurodegenerationer, og netværket "CARAMMEL", der er involveret i diagnosticering af mitokondrielle sygdomme.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

70

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

      • Talence, Frankrig
        • Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter med NBIA

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • NBIA Patienter diagnosticeret med en patogen variation eller enhver variation, der kunne påvirke genfunktionen (klasse 4 eller 5 i henhold til ACMG-kriterier) i følgende gener: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP og ATP13A2, og hvis fibroblaster er blevet indsamlet på Bordeaux Universitetshospital til funktionsanalyse under diagnoseproceduren
  • NBIA-patienter uden endelig test i ingen af ​​disse ni gener, og hvis DNA er blevet indsamlet under diagnoseproceduren på Bordeaux University Hospital

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter uden billeddannelse (MRI eller scanning) tegn på NBIA
  • Patienter uden fransk sygesikring

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Tilbagevirkende kraft

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Patienter med NBIA, som forbliver uden molekylær diagnose
En gruppe på 40 patienter med NBIA, som forbliver uden molekylær diagnose
sekventeringstest af et panel af 22 gener (9 allerede kendte og 13 nye gener) ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
Patienter med NBIA med identificerede mutationer i gener
En gruppe patienter med 2 hyppige former for NBIA, som bærer mutationer i gener (allerede undersøgt i CHU's molekylærdiagnostiske laboratorium)
Etablering af mitokondrielle markører fra fibroblaster i kultur, opnået fra en hudbiopsi. Etablering af gærmodeller for at vise biokemiske mitokondrielle ændringer: introduktion af missense-varianter i pantothenatkinase-gærgenet Cab1, hvis deletion er dødelig, efterfulgt af vækst af mutantstammer på fermentering og respiratoriske medier.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Sekventeringstest af et panel af 22 gener ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Registreringer af dækning (% af designet regioner)
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Sekventeringstest af et panel af 22 gener ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 4 år
Registreringer af dybde af sekventering (læser nummer)
gennem studieafslutning, i gennemsnit 4 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Identifikation af den dominerende form ved hjælp af biokemisk analyse i patientens fibroblaster
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Optælling af mitokondrier med spændingsafhængig anionkanal (VDAC) mærkning
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Identifikation af den dominerende form ved hjælp af biokemisk analyse i patientens fibroblaster
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Målinger af jern- og ferritincelleniveauer efter jernmangel og jernbelastning
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

4. januar 2018

Primær færdiggørelse (Faktiske)

30. november 2020

Studieafslutning (Faktiske)

30. november 2020

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

1. juli 2021

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

7. november 2022

Først opslået (Faktiske)

14. november 2022

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

14. november 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

7. november 2022

Sidst verificeret

1. september 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

Ingen

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sekvenseringstest

3
Abonner