- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT05615571
Test af NBIA-gener: Analyse af genetisk heterogenitet og validering af mitokondrielle markører til vurdering af kausalitet af sekvensvarianter. (NBIA MITO)
Neurodegeneration med hjernejernakkumulering (NBIA) repræsenterer en gruppe af sjældne neuroudviklingssygdomme, genetisk såvel som fænotypisk heterogene.
Diagnosen er baseret på hjerne-MR. Det er også baseret på genetisk testning. Der er dog overlapninger mellem de forskellige kliniske præsentationer, og den molekylære diagnose kan misfortolkes.
To hovedformål skal løses for at få en bedre molekylær diagnose: på den ene side at nå tilstrækkelig udtømmende, som kan udføres med et større genpanel og næste generations sekventering; på den anden side er det nu nødvendigt at validere eller bekræfte de skadelige konsekvenser af varianter ved hjælp af funktionelle undersøgelser.
Studieoversigt
Status
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Neurodegeneration med hjernejernakkumulering (NBIA) repræsenterer en gruppe af sjældne neuroudviklingssygdomme, genetisk såvel som fænotypisk heterogene.
Diagnosen er baseret på hjerne-MR. Det viser unormal aflejring af jern i basalganglierne, især i globus pallidus og stoffet nigra. Det er også baseret på genetisk testning. Ti individualiserede former er nu beskrevet. Der eksisterer imidlertid overlapninger mellem de forskellige kliniske præsentationer, og den molekylære diagnose kan misfortolkes på grund af varianter, navngivet som varianter af ukendt betydning, hvis patogene rolle ikke er bevist. Cirka halvdelen af de klinisk relevante tilfælde med jernaflejringer på hjerne-MR forbliver uden nogen molekylær skadelig ændring.
To hovedformål skal løses for at få en bedre molekylær diagnose: på den ene side at nå tilstrækkelig udtømmende, som kan udføres med et større genpanel og næste generations sekventering; dette panel vil omfatte nye gener og kan forstørres, efterhånden som flere gener identificeres. På den anden side er det nu nødvendigt at validere eller bekræfte de skadelige konsekvenser af varianter ved hjælp af funktionelle undersøgelser.
Fire hovedveje er involveret i patofysiologien af NBIA: jern- og lipidmetabolisme, mitokondriel metabolisme og autofagi.
I betragtning af at biokemiske mekanismer inde i mitochodrion er involveret i disse fire veje, udførte efterforskerne en første test med udgangspunkt i patientens fibroblaster og analyserede litteraturen for at definere de parametre, der kunne være relevante som biologiske markører for NBIA.
To forskellige grupper vil blive undersøgt:
- En gruppe NBIA-patienter uden fundet mutation efter sekventering af genpanelet, der i øjeblikket anvendes på universitetshospitalet i Bordeaux. Gentestning vil blive udført ved hjælp af en alternativ metode til målberigelse anvendt på 16 NBIA-gener.
- En gruppe patienter med 2 hyppige former for NBIA med identificerede varianter vil blive analyseret for at vurdere de bedste mitokondrielle markører fra fibroblaster.
Efterforskerne planlægger at overføre disse nye genetiske og biokemiske strategier til diagnostiske procedurer med støtte fra det franske netværk af sjældne sygdomme, der er ansvarligt for neurodegenerationer, og netværket "CARAMMEL", der er involveret i diagnosticering af mitokondrielle sygdomme.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Talence, Frankrig
- Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- NBIA Patienter diagnosticeret med en patogen variation eller enhver variation, der kunne påvirke genfunktionen (klasse 4 eller 5 i henhold til ACMG-kriterier) i følgende gener: C19ORF12, PANK2, PLA2G6, DCAF17, FA2H, WDR45, FTL, CP og ATP13A2, og hvis fibroblaster er blevet indsamlet på Bordeaux Universitetshospital til funktionsanalyse under diagnoseproceduren
- NBIA-patienter uden endelig test i ingen af disse ni gener, og hvis DNA er blevet indsamlet under diagnoseproceduren på Bordeaux University Hospital
Ekskluderingskriterier:
- Patienter uden billeddannelse (MRI eller scanning) tegn på NBIA
- Patienter uden fransk sygesikring
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Tilbagevirkende kraft
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Patienter med NBIA, som forbliver uden molekylær diagnose
En gruppe på 40 patienter med NBIA, som forbliver uden molekylær diagnose
|
sekventeringstest af et panel af 22 gener (9 allerede kendte og 13 nye gener) ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
|
Patienter med NBIA med identificerede mutationer i gener
En gruppe patienter med 2 hyppige former for NBIA, som bærer mutationer i gener (allerede undersøgt i CHU's molekylærdiagnostiske laboratorium)
|
Etablering af mitokondrielle markører fra fibroblaster i kultur, opnået fra en hudbiopsi.
Etablering af gærmodeller for at vise biokemiske mitokondrielle ændringer: introduktion af missense-varianter i pantothenatkinase-gærgenet Cab1, hvis deletion er dødelig, efterfulgt af vækst af mutantstammer på fermentering og respiratoriske medier.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Sekventeringstest af et panel af 22 gener ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Registreringer af dækning (% af designet regioner)
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Sekventeringstest af et panel af 22 gener ved hjælp af en dedikeret brugerdefineret capture og en medium throughput sekventeringsprotokol.
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 4 år
|
Registreringer af dybde af sekventering (læser nummer)
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 4 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Identifikation af den dominerende form ved hjælp af biokemisk analyse i patientens fibroblaster
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Optælling af mitokondrier med spændingsafhængig anionkanal (VDAC) mærkning
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Identifikation af den dominerende form ved hjælp af biokemisk analyse i patientens fibroblaster
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Målinger af jern- og ferritincelleniveauer efter jernmangel og jernbelastning
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Patricia FERGELOT MAURIN, University Hospital, Bordeaux
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
- Patologiske processer
- Hjernesygdomme
- Sygdomme i centralnervesystemet
- Sygdomme i nervesystemet
- Genetiske sygdomme, medfødte
- Basal Ganglia Sygdomme
- Bevægelsesforstyrrelser
- Neurodegenerative sygdomme
- Heredodegenerative lidelser, nervesystem
- Neuroaksonale dystrofier
- Pantothenatkinase-associeret neurodegeneration
- Nerve degeneration
Andre undersøgelses-id-numre
- CHUBX 2017/38
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Sekvenseringstest
-
University of California, San FranciscoAfsluttetSkeletanomalier | Flere anomalier | Strukturelle anomalier | Hjerteanomalier | Anomalier i centralnervesystemet | Thorax anomalier | Genito-urinary anomalier | Gastrointestinale anomalierForenede Stater
-
Jagiellonian UniversityRekruttering
-
University Hospital TuebingenRekrutteringSjældne sygdomme | Genetisk dispositionTyskland
-
Blood Donation Service Zurich, SRCUkendtGenetisk blodgruppe (bg) Polymorfi i U-negativitet og St(a) af MNS'erSchweiz
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteDana-Farber Cancer InstituteAktiv, ikke rekrutterendeIkke-småcellet lungekræftForenede Stater
-
University of Illinois College of Medicine at PeoriaRady Children's Institute of Genomic MedicineAktiv, ikke rekrutterendeGenetisk sygdom | Genetisk syndromForenede Stater
-
Samsung Medical CenterRekrutteringTredobbelt negativ brystkræft | Pembrolizumab | Neoadjuverende kemoterapi | Tumor mikromiljøKorea, Republikken
-
Charite University, Berlin, GermanyGerman Federal Ministry of Education and ResearchAfsluttet
-
Munich Leukemia LaboratoryIllumina, Inc.RekrutteringLeukæmi | Sjældne sygdomme | Refraktær lymfom | Hæmatologisk malignitet | Refraktær leukæmi | Ukendte primære tumorerTyskland
-
Scripps Translational Science InstituteRekrutteringMedfødt hjertesygdomForenede Stater