使用剩余 qFIT 样本研究肠道微生物群的可行性。 (FUTURISTIC)

我们的目的是测试以下假设：qFIT 盒中悬浮在缓冲试剂中的 2 毫克粪便足以进行 16S rRNA 基因测序，并将产生与传统收集的粪便样本相当的结果，从而使我们能够研究大量患者' 在未来的研究中可从国家肠道筛查计划获得样本。

如果我们能够证明这些粪便中的 DNA 会产生与传统收集的样本（例如粪便）相似的结果。 15-20 毫升粪便收集到 30 毫升粪便样本罐中），这可以让我们在未来的研究中研究国家肠道筛查计划提供的大量患者样本。

其他研究调查了使用新鲜或冷冻残留 FIT 测试缓冲液代替完整粪便样本，通过 16S rRNA 基因测序测量粪便微生物特征的可能性，使用 OC-Auto FIT 试剂盒 (Polymedco Inc)，将 10 毫克粪便添加到 2 毫升粪便中缓冲液，但缓冲液稳定性低于 EXTEL 收集选择器盒（室温下 7 天与 32 天；2-8oC 下 28 天与 120 天）。

我们假设 qFIT 盒中悬浮在缓冲试剂中的少量粪便足以进行 16S rRNA 基因测序，并且将产生与传统收集的粪便样本相当的结果。

我们应该：

1. 确定 qFIT 收集盒中的 500 ul 缓冲液/粪便混合物是否会产生足够的 DNA 用于 16S rRNA 基因测序，或者是否需要 1.5 至 2 ml
2. 使用 qFIT 盒和传统粪便收集方法比较 16 名人类志愿者的新鲜粪便（24 小时内处理）的 16S rRNA 基因测序
3. 确定 qFIT 收集的粪便的适用性，粪便在盒中保存的时间与苏格兰肠道筛查计划中处理的样本相当，最长 14 天
4. 对来自阿伯丁皇家医院有症状患者的 100 个 qFIT 样本中多余的 DNA 进行定量，以确定具有足够 DNA 进行 16S rRNA 基因测序的样本比例。