微生物组种群适应研究 (OLIMPAS)

正在接受成骨不全手术的患者将被询问是否愿意参加该研究。 研究收集的所有数据均与研究相关，将收集在病例报告表 (CRF)/源文件中，并将输入亨利·杰克逊基金会 (HJF) REDCap。

以下是与研究相关的研究程序的细分。 所有这些程序都将用于研究目的，而不是为了护理标准。 研究人员将研究访视与临床访视/随访同时进行。 研究人员将从患者/临床医生那里收集以下信息：

基线/术前手术第一阶段

人口统计数据（出生日期、性别、身高、体重、体重指数、残肢长度、截肢侧、需要手术的一侧、截肢日期、截肢原因、截肢原因的详细信息、先前/当前假肢的问题） 药物：研究人员将收集有关药物的详细信息（名称、适应症、剂量、频率、途径。 等）患者目前正在服用的药物（包括非处方药、维生素或草药治疗）。

卫生问卷 生物群落样本（骨整合和控制位点） 植物群数据收集样本问卷 植物群数据收集样本问卷-对照 Holger 评分系统问卷（调查人员在评估参与者的皮肤状况后给出的分数）。

临床评估

II 期手术前、II 期手术术后 3 周、3 个月、6 个月和 12 个月随访

药物：将询问患者目前正在服用的药物是否有任何变化。

卫生调查问卷 生物群系样本（骨整合和控制位点） 植物群数据收集样本问卷 植物群数据收集样本问卷-对照 Holger 评分系统问卷

术后第二阶段（手术室）

植物群数据收集样本调查问卷 植物群数据收集样本调查问卷-控制生物群落样本（骨整合和控制位点） Holger 评分系统调查问卷

术后 24 个月 手术 II 期

药物：将询问患者目前正在服用的药物是否有任何变化。

卫生问卷 生物群系样本（骨整合和控制位点） 菌群数据收集样本问卷 菌群数据收集样本问卷控制 Holger 评分系统问卷 大腿成形术问卷 临床评估

收集的数据将包括菌群样本收集和软组织包膜分析

植物群样品收藏

生物群落样本将由研究小组成员之一收集/擦拭。 皮肤或基台的拭子面积约为 2 厘米 x 2 厘米。

采样拭子部位 对于单侧截肢患者 截肢：植入物表面、开口部位、截肢部位与腹股沟或腋窝皱襞的中点、截肢部位 对侧肢体作为对照：与截肢处于同一水平（拭子部位与截肢位置兼容）对于双侧截肢患者 双侧截肢：植入物表面、孔径部位、截肢部位与腹股沟或腋窝折痕之间的中点（作为对照） 任何时候参与者出现感染并且在研究相关时间点之外进入 研究人员将收集生物群落样本（骨整合和对照位点）、植物群数据收集样本调查问卷、植物群数据收集样本调查问卷-对照和临床评估。

样本采集拭子程序

植物群是存在于所有生物中的微生物。 研究人员将使用拭子方法在骨整合和控制部位收集参与者的皮肤生物群落/菌群样本。 新鲜拭子将置于湿润缓冲液中，例如盐水或蒸馏水。 研究小组的一名成员将用一只手将皮肤部位拉紧。 用另一只手握住拭子，使轴与皮肤表面平行。 用力用力将棉签来回擦拭 50 次（持续 30 秒）。 拭子将放入试管缓冲液中，并尽快（采集后 30 分钟内）放入冰箱。 这是一种非侵入性手术，不会引起疼痛，但可能会导致采集部位不适。 如果参与者因为感到任何疼痛而要求我们停止采集样本，调查人员将停止采集菌群样本。

参与者的皮肤菌群样本将在基线/术前手术第一阶段、术前手术第二阶段、术后即刻手术第二阶段（在手术室中）、术后3周、3个月、6个月收集第二阶段手术的 12 个月和 24 个月随访。

拭子样本处理、储存和分析

拭子需要放入试管缓冲液中并尽快放入冰箱（采集后 30 分钟内）。 这些生物群系样本将储存在位于 9 号楼的外科重症监护计划 (SC2i) 冰箱的 -20° 冷冻室中。 一旦研究人员积累了足够的样本，研究人员会将这些样本发送至 Zymo Research Corporation 在干冰上进行测序，以便样本保持冷冻状态。 Zymo 对这些样本进行分析后，结果将以文本和 fasta 文件形式发回。 文本文件将是结果（α 和β 多样性、已识别的物种等），而 fasta 文件将是实际的基因序列。 研究完成后三个月后，Zymo 将处理所有未使用的样本

软组织包膜分析

将测量软组织包膜的冗余度并使用改良霍尔格评分系统进行评分。 研究人员将记录软组织冗余和过度活动、排水和烦躁以及活动性感染。 收集的临床数据包括人口统计数据（出生日期、性别、身高、体重、体重指数、残肢长度、截肢侧、需要手术的一侧、截肢日期、截肢原因、截肢原因的详细信息、先前/当前假肢的问题）、过去和现在的其他相关医疗状况和药物。 将收集的调查问卷是卫生方面的（参与者每天清洁参与者残肢多少次，参与者使用什么产品清洁残肢，参与者在清洁后是否使用任何产品，例如乳液）参与者已经清洁了他们的残肢，如果是的话，使用什么产品，菌群数据收集样本调查问卷（评估日期，菌群样本站点，菌群样本对照站点，从什么站点收集（植入物表面，孔径站点，对侧肢体）以及采集样本的人）、Holger 评分系统（正常皮肤、微红、红润、肉芽组织和导致基台移除的皮肤并发症、皮肤过度生长）、临床评估（软组织冗余、过度活动、引流烦躁）、伤口等级（改善、停滞和恶化）和大腿成形术问卷（患者是否必须进行大腿成形术）。