通过患者衍生的类器官来表征乳腺癌亚型。 (BCinsightPDO)
2024年3月11日 更新者:Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS
通过患者衍生的类器官来表征乳腺癌亚型”。(BCinsightPDO)
对于缺乏 TNBC 等靶向治疗的 BC 患者,或辅助化疗或靶向治疗后复发的患者来说,开发预测患者化疗敏感性的工具并识别相应的生物标志物是一项紧迫的挑战。
过去十年经历的 3D 培养技术的改进使得能够在器官型结构中培养源自患者的癌细胞,称为源自患者的类器官 (PDO),它保留了原发性肿瘤的组织学、基因组和转录组特征。 PDO 允许在接近生理学的环境中对患者来源的癌细胞进行繁殖、药物治疗和基因操作,从而成为开发个性化疗法的有前途的工具
研究概览
详细说明
PDO 已被证明可以有效地在体外重现 BC 患者对激素治疗的体内反应。
这些观察结果表明,PDO 是对患者特异性化疗敏感性进行快速、个性化前瞻性评估的潜在有价值工具。
此外,PDO 可以代表一个有价值的体外平台,用于以中到高通量的方式筛选新疗法或当前疗法的组合。
因此,开发代表 BC 亚型异质性(包括复发性疾病的演变)的稳定 PDO 集合,对于旨在了解与化疗耐药相关的分子表型的前瞻性和回顾性研究来说是极其有用的资源。
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
306
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名:Alba Di Leone, Doc
- 电话号码:0039 3474980503
- 邮箱:alba.dileone@policlinicogemelli.it
研究联系人备份
- 姓名:Chiara Naro, Doc
- 电话号码:0039 3495087203
- 邮箱:chiara.naro@unicatt.it
学习地点
-
-
-
Roma、意大利、00168
- 招聘中
- IRCCS Fondazione Policlinico A. Gemelli
-
接触:
- alba di leone, MD
- 电话号码:0039 3474980503
- 邮箱:alba.dileone@policlinicogemelli.it
-
-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
不
取样方法
概率样本
研究人群
符合资格的人群包括被诊断患有原发性 BC 并根据国家和国际指南有资格接受肿瘤手术切除的女性。 每个病例都将在手术前在 IRCCS 的 Fondazione Policlinico A. Gemelli 的 BC 多学科肿瘤委员会进行讨论。
所有女性都必须签署书面知情同意书才能参加这项研究。 研究设计考虑了以下纳入标准:年龄在 18 岁至 70 岁之间;新诊断的乳腺肿瘤,肿瘤直径至少为1.5厘米。
描述
纳入标准:
- 被诊断患有原发性乳腺癌的女性,根据国家和国际指南,有资格接受肿瘤手术切除。
年龄在18岁至70岁之间;新诊断的乳腺肿瘤,肿瘤直径至少为1.5厘米。
排除标准:
怀孕期间诊断出乳腺癌,新辅助化疗
学习计划
本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的?
设计细节
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
评估 PDO 与匹配的原发和/或复发 BC 样本之间的组织学和分子一致性(是/否),以开发 ER/PR+、HER2+ 和 TNBC PDO 的活体生物库。
大体时间:36个月
|
每个手术标本的一部分将用于根据既定程序获得 PDO,一部分将被固定并石蜡包埋用于组织学分析,一部分将被闪冻用于 DNA、RNA 和蛋白质分析。
在第一代中,将表征类器官的组织学和细胞学特征。
将通过下一代测序 (NGS) 分析忠实再现匹配原发肿瘤特征的 PDO 的基因组特征和剪接敏感转录组特征。
二分变量:是(符合)/否(不符合)
|
36个月
|
|
在 BC 或其他癌症类型的临床试验中评估 ER/PR+、HER2+ 和 TNBC PDO 对新型治疗药物的敏感性
大体时间:42个月
|
通过在治疗前后进行细胞活力测定和克隆形成潜力测定,将测试 PDO 对给予相应患者的治疗剂和/或在 BC 或其他癌症类型的临床试验中对新型治疗剂的敏感性。
对测试药物的敏感性将根据已知的药物最大血浆浓度 (Cmax) 进行评估:如果在 Cmax 剂量下存活率 <50%,则为敏感;如果 Cmax 剂量下存活率 >50%,则具有耐药性。
二分变量:是(敏感)/否(抵抗)
|
42个月
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
测试 PDO 对剪接靶向治疗的敏感性,无论是单独使用还是与其他疗法联合使用
大体时间:42个月
|
将评估源自原发性和复发性 BC 患者的 PDO 对单独给药或与标准化疗联合给药的剪接靶向药物的敏感性。
对测试的剪接靶向药物的敏感性将根据药物对其分子靶标的已知 EC50 进行评估:如果 EC50 剂量下存活率 <50%,则敏感;如果 EC50 剂量下存活率 <50%,则敏感;如果在 EC50 剂量下存活率 >50%,则具有耐药性。
二分变量:是(敏感)/否(抵抗)。
将评估组合指数(CI)来评估协同效应,CI<1表示协同作用。
|
42个月
|
|
通过与自体免疫细胞共培养实验来测试药物剪接靶向治疗与免疫疗法的协同效应
大体时间:42个月
|
无论是否用选定的剪接抑制剂处理过的 PDO,都将暴露于来自同一患者的 PMBC,这些 PMBC 之前在可行的条件下保存,无论是否存在临床上可用的免疫检查点抑制剂(抗 PD1 和抗 PD-L1 抗体)。
存活和增殖测定将评估治疗是否增强 PBMC 对癌细胞的细胞毒活性。
二分变量:是/否
|
42个月
|
合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Harbeck N, Gnant M. Breast cancer. Lancet. 2017 Mar 18;389(10074):1134-1150. doi: 10.1016/S0140-6736(16)31891-8. Epub 2016 Nov 17.
- Liedtke C, Mazouni C, Hess KR, Andre F, Tordai A, Mejia JA, Symmans WF, Gonzalez-Angulo AM, Hennessy B, Green M, Cristofanilli M, Hortobagyi GN, Pusztai L. Response to neoadjuvant therapy and long-term survival in patients with triple-negative breast cancer. J Clin Oncol. 2008 Mar 10;26(8):1275-81. doi: 10.1200/JCO.2007.14.4147. Epub 2008 Feb 4.
- Garrido-Castro AC, Lin NU, Polyak K. Insights into Molecular Classifications of Triple-Negative Breast Cancer: Improving Patient Selection for Treatment. Cancer Discov. 2019 Feb;9(2):176-198. doi: 10.1158/2159-8290.CD-18-1177. Epub 2019 Jan 24.
- Denkert C, Liedtke C, Tutt A, von Minckwitz G. Molecular alterations in triple-negative breast cancer-the road to new treatment strategies. Lancet. 2017 Jun 17;389(10087):2430-2442. doi: 10.1016/S0140-6736(16)32454-0. Epub 2016 Dec 7.
- Kornblihtt AR, Schor IE, Allo M, Dujardin G, Petrillo E, Munoz MJ. Alternative splicing: a pivotal step between eukaryotic transcription and translation. Nat Rev Mol Cell Biol. 2013 Mar;14(3):153-65. doi: 10.1038/nrm3525. Epub 2013 Feb 6. Erratum In: Nat Rev Mol Cell Biol. 2013 Mar;14(3). doi:10.1038/nrm3560.
- Pagliarini V, Naro C, Sette C. Splicing Regulation: A Molecular Device to Enhance Cancer Cell Adaptation. Biomed Res Int. 2015;2015:543067. doi: 10.1155/2015/543067. Epub 2015 Jul 26.
- Chabot B, Shkreta L. Defective control of pre-messenger RNA splicing in human disease. J Cell Biol. 2016 Jan 4;212(1):13-27. doi: 10.1083/jcb.201510032.
- Karni R, de Stanchina E, Lowe SW, Sinha R, Mu D, Krainer AR. The gene encoding the splicing factor SF2/ASF is a proto-oncogene. Nat Struct Mol Biol. 2007 Mar;14(3):185-93. doi: 10.1038/nsmb1209. Epub 2007 Feb 18.
- Hsu TY, Simon LM, Neill NJ, Marcotte R, Sayad A, Bland CS, Echeverria GV, Sun T, Kurley SJ, Tyagi S, Karlin KL, Dominguez-Vidana R, Hartman JD, Renwick A, Scorsone K, Bernardi RJ, Skinner SO, Jain A, Orellana M, Lagisetti C, Golding I, Jung SY, Neilson JR, Zhang XH, Cooper TA, Webb TR, Neel BG, Shaw CA, Westbrook TF. The spliceosome is a therapeutic vulnerability in MYC-driven cancer. Nature. 2015 Sep 17;525(7569):384-8. doi: 10.1038/nature14985. Epub 2015 Sep 2.
- Chan S, Sridhar P, Kirchner R, Lock YJ, Herbert Z, Buonamici S, Smith P, Lieberman J, Petrocca F. Basal-A Triple-Negative Breast Cancer Cells Selectively Rely on RNA Splicing for Survival. Mol Cancer Ther. 2017 Dec;16(12):2849-2861. doi: 10.1158/1535-7163.MCT-17-0461. Epub 2017 Sep 6.
- Stricker TP, Brown CD, Bandlamudi C, McNerney M, Kittler R, Montoya V, Peterson A, Grossman R, White KP. Robust stratification of breast cancer subtypes using differential patterns of transcript isoform expression. PLoS Genet. 2017 Mar 6;13(3):e1006589. doi: 10.1371/journal.pgen.1006589. eCollection 2017 Mar.
- Trincado JL, Sebestyen E, Pages A, Eyras E. The prognostic potential of alternative transcript isoforms across human tumors. Genome Med. 2016 Aug 17;8(1):85. doi: 10.1186/s13073-016-0339-3.
- Kahles A, Lehmann KV, Toussaint NC, Huser M, Stark SG, Sachsenberg T, Stegle O, Kohlbacher O, Sander C; Cancer Genome Atlas Research Network; Ratsch G. Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients. Cancer Cell. 2018 Aug 13;34(2):211-224.e6. doi: 10.1016/j.ccell.2018.07.001. Epub 2018 Aug 2.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2023年6月15日
初级完成 (估计的)
2026年6月15日
研究完成 (估计的)
2027年6月15日
研究注册日期
首次提交
2023年5月11日
首先提交符合 QC 标准的
2024年3月11日
首次发布 (实际的)
2024年3月18日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2024年3月18日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2024年3月11日
最后验证
2023年6月1日
更多信息
此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.