母体基因和表观突变：贝克威斯-维德曼综合征和生殖风险
母体效应基因和表观突变在贝克威斯-维德曼综合征和不良生殖后果中的作用
研究概览
详细说明
该项目的首要目标是确定母体效应基因 (MEG) 的发生率，特别是 SCMC 致病性变异的发生率，作为不育女性群体和 BWS 儿童母亲生殖结果差异的原因。 为此，将招募三组患者：健康女性，其后代受 BWS 影响，并且来自我们临床和分子诊断的 BWS 家庭群体中的特殊生殖史（第 1 组），35 岁以下因不孕症接受 ART 的女性（定义为未能经过 12 个月或更长时间的定期无保护性交后成功怀孕），并且在三个完整周期后或在移植至少 6 个囊胚后无法获得活产（第 2 组），以及 35 岁以下患有 RPL（复发性妊娠丢失）的女性定义为妊娠 24 周之前两次或两次以上妊娠流产）（队列 3）。
为了识别致病变异，全外显子组测序（WES）将作为所有招募患者的第一种方法进行。 WES 分析将按照各个步骤进行。 首先，研究人员将分析不同的基因子集，属于：
- 母体效应基因如SCMC成分及其他相关基因；
- 在胚胎发生早期阶段卵母细胞成熟和受精卵进展所必需的基因，或在卵母细胞成熟的不同阶段高度表达的基因；
- 在基因组印记的建立和控制中具有已知和潜在作用并参与 DNA 甲基化反应的基因。
随后，将分析具有高致病性评分的变体，以识别可能与该现象相关但不属于先前描述的基因类别的任何基因。 最后，研究人员将对选定的具有特殊临床病史和 WES 分析阴性的 BWS 母亲亚组进行全基因组测序 (WGS) 分析，以探索 WES 未靶向的所有非编码和调控区域。
该项目的第二个目标是采用全基因组甲基化分析来确定患有生殖问题的妇女（包括那些后代受 BWS 影响的妇女）的甲基化变化。 具体任务将是：
- 确定目标 1 中描述的女性群体的血液白细胞的全基因组甲基化，并将其与类似数量的性别和年龄匹配的对照进行比较；
- 确定来自同一队列的不成功 ART 周期的未受精卵母细胞的全基因组甲基化，并将其与对照卵母细胞（来自研究捐赠或公共数据集）进行比较。
将通过甲基化阵列分析确定血液白细胞中的 DNA 甲基化，并通过单细胞亚硫酸氢盐测序 (scBS-Seq) 确定未受精卵母细胞中的 DNA 甲基化。
该项目的第三个目标是通过使用小鼠模型来确定与破坏性 SCMC 基因变异相关的女性不孕症和印记障碍的分子机制。 具体任务将是：
- 测定野生型精子 IVF 后获得的 Padi6 mut/mut 卵母细胞和植入前胚胎的全基因组甲基化和 RNA 谱；
- 将a)中描述的IVF衍生的囊胚转移至假孕雌性中，并通过BS-seq和RNA-seq分析衍生的妊娠中期胚胎中的全基因组DNA甲基化和RNA；
- 对 2 细胞 Padi6 mut/mut 胚胎进行表观遗传学化合物的小筛选。 小鼠卵母细胞和胚胎的 DNA 甲基化和 RNA 表达将通过全基因组 scBS-seq 和 scRNA-seq 确定。
研究类型
注册 (估计的)
阶段
- 不适用
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Marco Reschini, MSc
- 电话号码：+390255034303
- 邮箱：marco.reschini@policlinico.mi.it
研究联系人备份
- 姓名：Edgardo Somigliana, PhD
- 电话号码：+390255034303
- 邮箱：edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
学习地点
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Milan、意大利、20145
- 招聘中
- Istituto Auxologico Italiano
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接触：
- Silvia Russo, Phd
- 电话号码：+393493237520
- 邮箱：s.russo@auxologico.it
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Milan、意大利、20122
- 招聘中
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
接触：
- Edgardo Somigliana, PhD
- 电话号码：+390255034303
- 邮箱：edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
描述
纳入标准：
- 第 1 组：健康女性，其后代受 BWS 影响，并且来自我们临床和分子诊断的 BWS 家庭群体中的特殊生殖史；
- 第 2 组：因不孕症接受 ART 的 35 岁以下女性（定义为在 12 个月或更长时间的定期无保护性交后未能怀孕），并且在三个完整周期或移植至少 6 个囊胚后无法获得活产；
- 第 3 组：35 岁以下、患有 RPL（定义为妊娠 24 周之前两次或两次以上妊娠流产）的女性。
排除标准：
- 存在常规和分子核型改变
- 发生可能导致生育能力下降或反复流产的已知原因：卵巢疾病，如多囊卵巢综合征和其他卵泡疾病、导致生殖激素水平失衡的内分泌系统疾病、自身免疫性疾病、男性不育、子宫或输卵管不育功能障碍和畸形、易血栓性或未纠正的甲状腺功能障碍。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：基础科学
- 分配：非随机化
- 介入模型：并行分配
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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实验性的：后代受 BWS 影响的健康女性
后代受 BWS 影响的健康女性以及我们经过临床和分子诊断的 BWS 家庭群体的特殊生殖史
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全外显子组测序将作为所有招募患者的第一种方法进行。 首先，我们将分析不同的基因子集，属于：
随后，将分析具有高致病性评分的变体，以识别可能与该现象相关但不属于先前描述的基因类别的任何基因。 最后，我们将对选定的具有特殊临床病史和 WES 分析阴性的 BWS 母亲亚组进行全基因组测序 (WGS) 分析，以探索 WES 未靶向的所有非编码和调控区域。
将进行全基因组甲基化分析，以确定患有生殖问题的女性（包括后代受 BWS 影响的女性）的甲基化变化
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实验性的：35 岁以下接受 ART 的女性
因不孕症接受 ART 的 35 岁以下女性（定义为在 12 个月或更长时间的定期无保护性交后未能怀孕），并且在三个完整周期或移植至少 6 个囊胚后无法获得活产
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全外显子组测序将作为所有招募患者的第一种方法进行。 首先，我们将分析不同的基因子集，属于：
随后，将分析具有高致病性评分的变体，以识别可能与该现象相关但不属于先前描述的基因类别的任何基因。 最后，我们将对选定的具有特殊临床病史和 WES 分析阴性的 BWS 母亲亚组进行全基因组测序 (WGS) 分析，以探索 WES 未靶向的所有非编码和调控区域。
将进行全基因组甲基化分析，以确定患有生殖问题的女性（包括后代受 BWS 影响的女性）的甲基化变化
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实验性的：35岁以下女性，RPL
35 岁以下患有 RPL（定义为妊娠 24 周前两次或两次以上妊娠流产）的女性
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全外显子组测序将作为所有招募患者的第一种方法进行。 首先，我们将分析不同的基因子集，属于：
随后，将分析具有高致病性评分的变体，以识别可能与该现象相关但不属于先前描述的基因类别的任何基因。 最后，我们将对选定的具有特殊临床病史和 WES 分析阴性的 BWS 母亲亚组进行全基因组测序 (WGS) 分析，以探索 WES 未靶向的所有非编码和调控区域。
将进行全基因组甲基化分析，以确定患有生殖问题的女性（包括后代受 BWS 影响的女性）的甲基化变化
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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乙二醇发生率
大体时间：所有队列中特定基因的 WES 和 SNP 阵列将在入组后进行，并将在第 17 个月内完成。最后一部分与选定的 BWS 母亲亚组的 WGS 相关的部分将于第 16 至 20 个月完成
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不孕女性群体和受 BWS 影响的儿童母亲中 MEG 的发病率，特别是 SCMC 的致病变异
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所有队列中特定基因的 WES 和 SNP 阵列将在入组后进行，并将在第 17 个月内完成。最后一部分与选定的 BWS 母亲亚组的 WGS 相关的部分将于第 16 至 20 个月完成
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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比较 DNA 甲基化
大体时间：收集的样本将在 20 个月内进行全基因组甲基化评估
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对患有生殖问题的妇女群体（包括其后代受 BWS 影响的妇女）的血液白细胞进行全基因组 DNA 甲基化，并将其与类似数量的性别和年龄匹配的对照进行比较。 生物信息学分析将用于从甲基化数据推断差异甲基化区域，并根据甲基化概况对女性状态进行分类。 由于与全基因组甲基化谱相关的复杂分布，降维技术（例如 PCA，MDS）和聚类方法（基于层次和质心）将用于评估特定区域（例如，区域）的重要性。 印迹基因座）根据甲基化谱将优先女性与对照区分开来。 有生殖问题，包括后代受 BWS 影响的人 |
收集的样本将在 20 个月内进行全基因组甲基化评估
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员：Edgardo Somigliana, PhD、Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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