母親の遺伝子と後変異: ベックウィズ ヴィーデマン症候群と生殖リスク
ベックウィズ・ヴィーデマン症候群および生殖有害事象における母性効果遺伝子とエピ突然変異の役割
調査の概要
詳細な説明
このプロジェクトの最初の目的は、不妊女性集団とBWS児の母親における生殖結果の差異の原因として、母体効果遺伝子(MEG)、特にSCMC病的バリアントの発生率を定義することである。 この目的のために、3つの患者コホートが募集される。すなわち、BWSに罹患した子孫と、臨床的および分子的に診断されたBWS家族の集団からの特異な生殖歴を持つ健康な女性(コホート1)、不妊症(治療の失敗と定義される)のためにARTを受けている35歳未満の女性である。 12 か月以上の定期的な保護されていない性交の後に妊娠に達し、3 周期完了後、または少なくとも 6 個の胚盤胞の移植後に生児を得ることができない (コホート 2)、および RPL (不育症) の 35 歳未満の女性妊娠 24 週以前の 2 つ以上の妊娠の喪失として定義されます)(コホート 3)。
病原性多様体を特定するために、最初のアプローチとして全エクソーム配列決定(WES)が採用されたすべての患者に対して実施されます。 WES 分析はさまざまな手順に従って実行されます。 まず、研究者らは以下に属する遺伝子のさまざまなサブセットを分析します。
- SCMC コンポーネントとしての母性効果遺伝子およびその他の関連遺伝子。
- 胚発生の初期段階における卵母細胞の成熟および接合子の進行に必須の遺伝子、または卵母細胞成熟のさまざまな段階で高度に発現する遺伝子。
- ゲノムインプリンティングの確立と制御において既知および潜在的な役割を持ち、DNA メチル化反応に関与する遺伝子。
続いて、高い病原性スコアを持つ変異体が分析され、その現象に関連している可能性があるが、前述の遺伝子のカテゴリーに属さない遺伝子が特定されます。 最後に、研究者らは、特異な病歴を持つBWS母親の選択されたサブグループに対して全ゲノム配列(WGS)解析を実施し、WES解析が陰性となり、WESの標的になっていない非コード領域および調節領域をすべて調査する予定である。
このプロジェクトの 2 番目の目的は、全ゲノムのメチル化解析を利用して、BWS に罹患した子孫を持つ女性を含む生殖問題を抱える女性のメチル化の変化を特定することです。 具体的なタスクは次のとおりです。
- 目的 1 に記載された女性のコホートの血液白血球の全ゲノム メチル化を決定し、それを同数の性別および年齢が一致した対照のメチル化と比較する。
- 同じコホートの失敗したARTサイクルに由来する未受精卵母細胞の全ゲノムメチル化を決定し、それを対照卵母細胞(研究用の寄付または公開データセットのいずれかに由来)のメチル化と比較する。
DNA メチル化は、血液白血球ではメチル化アレイ分析によって、未受精卵母細胞では単一細胞重亜硫酸塩シーケンス (scBS-Seq) によって決定されます。
このプロジェクトの 3 番目の目的は、マウス モデルを使用して、SCMC 遺伝子変異の損傷に関連する女性の不妊症とインプリンティング障害の根底にある分子機構を解明することです。 具体的なタスクは次のとおりです。
- 野生型精子を用いた体外受精後に得られたPadi6 mut/mut卵母細胞および着床前胚の全ゲノムメチル化およびRNAプロファイルを決定する。
- a)に記載の体外受精由来の胚盤胞の偽妊娠雌への移植、およびBS-seqおよびRNA-seqによる、派生した妊娠中期胚における全ゲノムDNAメチル化およびRNAの分析。
- 2細胞Padi6 mut/mut胚におけるエピジェネティクス化合物のミニスクリーニング。 マウス卵母細胞および胚の DNA メチル化および RNA 発現は、全ゲノム scBS-seq および scRNA-seq によって決定されます。
研究の種類
入学 (推定)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Marco Reschini, MSc
- 電話番号:+390255034303
- メール:marco.reschini@policlinico.mi.it
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Edgardo Somigliana, PhD
- 電話番号:+390255034303
- メール:edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
研究場所
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Milan、イタリア、20145
- 募集
- Istituto Auxologico Italiano
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コンタクト:
- Silvia Russo, Phd
- 電話番号:+393493237520
- メール:s.russo@auxologico.it
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Milan、イタリア、20122
- 募集
- Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
コンタクト:
- Edgardo Somigliana, PhD
- 電話番号:+390255034303
- メール:edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
- コホート 1: BWS に罹患した子孫と、臨床的および分子的に診断された BWS 家族の集団からの特異な生殖歴を持つ健康な女性。
- コホート2:不妊症(12か月以上の定期的な保護されていない性交後に妊娠に達しないことと定義)のためARTを受けており、3周期完了後、または少なくとも6個の胚盤胞の移植後に生児出産ができない35歳未満の女性。
- コホート 3: RPL (妊娠 24 週以前の 2 つ以上の妊娠の喪失として定義される) を患う 35 歳未満の女性。
除外基準:
- 従来型および分子核型変化の存在
- 生殖能力の低下または再発性中絶につながる既知の原因の発生:多嚢胞性卵巣症候群やその他の卵胞疾患などの卵巣の疾患、生殖ホルモンレベルの不均衡を引き起こす内分泌系の疾患、自己免疫疾患、男性不妊、子宮または卵管の疾患機能不全および奇形、血栓形成性または未矯正の甲状腺機能不全。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:基礎科学
- 割り当て:非ランダム化
- 介入モデル:並列代入
- マスキング:なし(オープンラベル)
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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実験的:BWSの影響を受けた子孫を持つ健康な女性
BWS に罹患した子孫と、臨床的および分子的に診断された BWS 家族の集団からの特異な生殖歴を持つ健康な女性
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全エクソーム配列決定は、採用されたすべての患者に対する最初のアプローチとして実行されます。 まず、以下に属する遺伝子のさまざまなサブセットを分析します。
続いて、高い病原性スコアを持つ変異体が分析され、その現象に関連している可能性があるが、前述の遺伝子のカテゴリーに属さない遺伝子が特定されます。 最後に、特異な病歴を持つ BWS 母親の選択されたサブグループに対して全ゲノム配列決定 (WGS) 解析を実施し、WES 解析が陰性で、WES の標的になっていないすべての非コード領域および制御領域を探索します。
BWSに罹患した子孫を持つ女性を含む、生殖問題を抱える女性のメチル化変化を特定するために、全ゲノムメチル化解析が実施される予定
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実験的:ARTを受けている35歳未満の女性
不妊症(12か月以上の定期的な保護されていない性交にもかかわらず妊娠に達しないことと定義)のためARTを受けており、3周期完了後、または少なくとも6個の胚盤胞の移植後に生児出産ができない35歳未満の女性
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全エクソーム配列決定は、採用されたすべての患者に対する最初のアプローチとして実行されます。 まず、以下に属する遺伝子のさまざまなサブセットを分析します。
続いて、高い病原性スコアを持つ変異体が分析され、その現象に関連している可能性があるが、前述の遺伝子のカテゴリーに属さない遺伝子が特定されます。 最後に、特異な病歴を持つ BWS 母親の選択されたサブグループに対して全ゲノム配列決定 (WGS) 解析を実施し、WES 解析が陰性で、WES の標的になっていないすべての非コード領域および制御領域を探索します。
BWSに罹患した子孫を持つ女性を含む、生殖問題を抱える女性のメチル化変化を特定するために、全ゲノムメチル化解析が実施される予定
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実験的:35歳未満の女性、RPLあり
RPL(妊娠24週以前の2つ以上の妊娠の喪失として定義)を患う35歳未満の女性
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全エクソーム配列決定は、採用されたすべての患者に対する最初のアプローチとして実行されます。 まず、以下に属する遺伝子のさまざまなサブセットを分析します。
続いて、高い病原性スコアを持つ変異体が分析され、その現象に関連している可能性があるが、前述の遺伝子のカテゴリーに属さない遺伝子が特定されます。 最後に、特異な病歴を持つ BWS 母親の選択されたサブグループに対して全ゲノム配列決定 (WGS) 解析を実施し、WES 解析が陰性で、WES の標的になっていないすべての非コード領域および制御領域を探索します。
BWSに罹患した子孫を持つ女性を含む、生殖問題を抱える女性のメチル化変化を特定するために、全ゲノムメチル化解析が実施される予定
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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MEGの発生率
時間枠:すべてのコホートにおける特定の遺伝子における WES と SNP アレイは登録後に実施され、17 か月以内に最終決定されます。BWS 母親の選択されたサブグループに関する WGS に関連する最後の部分は、16 か月から 20 か月までに完了します。
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不妊女性集団およびBWSに罹患した子供の母親におけるMEG、特にSCMCの病的バリアントの発生率
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すべてのコホートにおける特定の遺伝子における WES と SNP アレイは登録後に実施され、17 か月以内に最終決定されます。BWS 母親の選択されたサブグループに関する WGS に関連する最後の部分は、16 か月から 20 か月までに完了します。
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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DNAメチル化を比較する
時間枠:収集されたサンプルは、20 か月以内に全ゲノムのメチル化について評価されます。
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BWSに罹患した子孫を持つ女性を含む、生殖問題を抱える女性コホートの血液白血球の全ゲノムDNAメチル化と、同数の性別および年齢が一致した対照のメチル化との比較。 バイオインフォマティクス分析は、メチル化データから差次的にメチル化された領域を推測し、メチル化プロファイルに基づいて女性のステータスを分類するために使用されます。 全ゲノムメチル化プロファイルに関連する複雑な分布のため、次元削減技術(例: PCA、MDS) およびクラスタリング手法 (階層ベースと重心ベースの両方) を使用して、特定の領域 (例: 領域) の重要性を評価します。 刷り込まれた遺伝子座)を使用して、メチル化プロファイルに従って優先順位の高い女性を対照から区別します。 BWSの影響を受ける子孫の問題を含む生殖問題を伴う |
収集されたサンプルは、20 か月以内に全ゲノムのメチル化について評価されます。
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協力者と研究者
協力者
捜査官
- 主任研究者:Edgardo Somigliana, PhD、Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- PNRR-MR1-2022-12376622
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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