Mors gener og epimutasjoner: Beckwith-Wiedemann syndrom og reproduksjonsrisiko
Rollen til gener for morseffekt og epimutasjoner i Beckwith-Wiedemanns syndrom og uønskede reproduktive utfall
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Det første målet med prosjektet er å definere forekomsten av Maternal-Effect-gener (MEG) og spesifikt av SCMC-patogene varianter som en årsak til forskjeller i reproduktive utfall i den infertile kvinnelige befolkningen og mødre til BWS-barn. Til dette målet vil tre kohorter av pasienter rekrutteres: friske kvinner med avkom påvirket av BWS og særegen reproduksjonshistorie fra vår populasjon av klinisk og molekylært diagnostiserte BWS-familier (Kohort 1), kvinner under 35 år som gjennomgår ART for infertilitet (definert som manglende oppnå en graviditet etter 12 måneder eller mer med regelmessig ubeskyttet samleie) og ute av stand til å oppnå en levende fødsel etter tre fullførte sykluser eller etter overføring av minst 6 blastocyster (Kohort 2), og kvinner under 35 år, med RPL (Recurrent Pregnancy Loss) definert som tap av to eller flere svangerskap før 24 ukers svangerskap) (Kohort 3).
For å identifisere patogene varianter vil heleksomsekvensering (WES) bli utført som den første tilnærmingen hos alle de rekrutterte pasientene. WES-analyse vil bli utført etter ulike trinn. Først vil etterforskerne analysere ulike undergrupper av gener, som tilhører:
- Maternal effektgener som SCMC-komponenter og andre relaterte gener;
- Gener som er essensielle i modningen av oocytten og zygoteprogresjonen gjennom de tidlige faser av embryogenesen eller sterkt uttrykt på forskjellige stadier av oocyttmodningen;
- Gener med kjente og potensielle roller i etablering og kontroll av genomisk imprinting og involvert i DNA-metyleringsreaksjoner.
Deretter vil varianter med høy patogenitetsskåre bli analysert, for å identifisere eventuelle gener som kan være assosiert med fenomenet, men som ikke tilhører de tidligere beskrevne kategoriene av gener. Til slutt vil etterforskerne gjennomføre en helgenomsekvenseringsanalyse (WGS) på en utvalgt undergruppe av BWS-mødre med særegne kliniske historier og negativ WES-analyse, for å utforske alle de ikke-kodende og regulatoriske områdene som ikke er målrettet av WES.
Det andre målet med dette prosjektet er å bruke hel-genom-metyleringsanalyse for å identifisere metyleringsendringer hos kvinner med reproduksjonsproblemer, inkludert de med avkom påvirket av BWS. Spesifikke oppgaver vil være:
- Bestemmelse av helgenommetyleringen av blodleukocytter fra kohortene av kvinner beskrevet i mål 1 og sammenligne den med et tilsvarende antall kjønns- og alderstilpassede kontroller;
- Bestemme helgenommetyleringen av ubefruktede oocytter avledet fra mislykkede ART-sykluser av de samme kohortene og sammenligne den med kontrolloocytter (avledet fra enten donasjon til forskning eller offentlige datasett).
DNA-metylering vil bli bestemt i blodleukocytter ved metyleringsarray-analyse og i ubefruktede oocytter ved enkeltcelle Bisulfitt-sekvensering (scBS-Seq).
Det tredje målet med prosjektet er å bestemme de molekylære mekanismene som ligger til grunn for kvinnelig infertilitet og imprinting lidelse assosiert med skadelige SCMC-genvarianter ved å bruke en musemodell. Spesifikke oppgaver vil være:
- Bestemmelse av helgenommetylerings- og RNA-profilene til Padi6 mut/mut-oocyttene og pre-implantasjonsembryoer oppnådd etter IVF med villtype sædceller;
- Overføring av blastocystene avledet fra IVF beskrevet i a) til pseudogravide kvinner og analyse av helgenomets DNA-metylering og RNA i de avledede embryoene i midten av svangerskapet ved BS-seq og RNA-seq;
- Mini-screening av epigenetiske forbindelser på 2-celle Padi6 mut/mut embryoer. DNA-metylering og RNA-ekspresjon av museoocytter og -embryoer vil bli bestemt av helgenom scBS-seq og scRNA-seq.
Studietype
Registrering (Antatt)
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Marco Reschini, MSc
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: marco.reschini@policlinico.mi.it
Studer Kontakt Backup
- Navn: Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
Studiesteder
-
-
-
Milan, Italia, 20145
- Rekruttering
- Istituto Auxologico Italiano
-
Ta kontakt med:
- Silvia Russo, Phd
- Telefonnummer: +393493237520
- E-post: s.russo@auxologico.it
-
Milan, Italia, 20122
- Rekruttering
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
Ta kontakt med:
- Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Kohort 1: friske kvinner med avkom påvirket av BWS og særegen reproduksjonshistorie fra vår populasjon av klinisk og molekylært diagnostiserte BWS-familier;
- Kohort 2: kvinner under 35 år som gjennomgår ART for infertilitet (definert som svikt i å oppnå graviditet etter 12 måneder eller mer med regelmessig ubeskyttet samleie) og ute av stand til å få en levende fødsel etter tre fullførte sykluser eller etter overføring av minst 6 blastocyster;
- Kohort 3: kvinner under 35 år, med RPL (definert som tap av to eller flere graviditeter før 24 ukers svangerskap).
Ekskluderingskriterier:
- tilstedeværelse av konvensjonelle og molekylære karyotypeendringer
- forekomst av kjente årsaker som kan føre til nedsatt fertilitet eller tilbakevendende aborter: lidelser i eggstokkene, som polycystisk ovariesyndrom og andre follikulære lidelser, forstyrrelser i det endokrine systemet som forårsaker ubalanse i reproduktive hormonnivåer, autoimmune tilstander, mannlig infertilitet, livmor eller tubal dysfunksjoner og misdannelser, trombofile eller ikke-korrigerte skjoldbruskdysfunksjoner.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Grunnvitenskap
- Tildeling: Ikke-randomisert
- Intervensjonsmodell: Parallell tildeling
- Masking: Ingen (Open Label)
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentell: friske kvinner med avkom påvirket av BWS
friske kvinner med avkom påvirket av BWS og særegen reproduksjonshistorie fra vår populasjon av klinisk og molekylært diagnostiserte BWS-familier
|
Heleksom-sekvensering vil bli utført som den første tilnærmingen hos alle de rekrutterte pasientene. Først vil vi analysere forskjellige undergrupper av gener, som tilhører:
Deretter vil varianter med høy patogenitetsskåre bli analysert, for å identifisere eventuelle gener som kan være assosiert med fenomenet, men som ikke tilhører de tidligere beskrevne kategoriene av gener. Til slutt vil vi gjennomføre en helgenomsekvenseringsanalyse (WGS) på en utvalgt undergruppe av BWS-mødre med særegne kliniske historier og negativ WES-analyse, for å utforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regionene som ikke er målrettet av WES.
En helgenommetyleringsanalyse vil bli utført for å identifisere metyleringsendringer hos kvinner med reproduksjonsproblemer, inkludert de med avkom påvirket av BWS
|
|
Eksperimentell: kvinner under 35 år som gjennomgår ART
kvinner under 35 år som gjennomgår ART for infertilitet (definert som manglende graviditet etter 12 måneder eller mer med regelmessig ubeskyttet samleie) og ute av stand til å få en levende fødsel etter tre fullførte sykluser eller etter overføring av minst 6 blastocyster
|
Heleksom-sekvensering vil bli utført som den første tilnærmingen hos alle de rekrutterte pasientene. Først vil vi analysere forskjellige undergrupper av gener, som tilhører:
Deretter vil varianter med høy patogenitetsskåre bli analysert, for å identifisere eventuelle gener som kan være assosiert med fenomenet, men som ikke tilhører de tidligere beskrevne kategoriene av gener. Til slutt vil vi gjennomføre en helgenomsekvenseringsanalyse (WGS) på en utvalgt undergruppe av BWS-mødre med særegne kliniske historier og negativ WES-analyse, for å utforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regionene som ikke er målrettet av WES.
En helgenommetyleringsanalyse vil bli utført for å identifisere metyleringsendringer hos kvinner med reproduksjonsproblemer, inkludert de med avkom påvirket av BWS
|
|
Eksperimentell: kvinner under 35, med RPL
kvinner under 35 år, med RPL (definert som tap av to eller flere graviditeter før 24 ukers svangerskap)
|
Heleksom-sekvensering vil bli utført som den første tilnærmingen hos alle de rekrutterte pasientene. Først vil vi analysere forskjellige undergrupper av gener, som tilhører:
Deretter vil varianter med høy patogenitetsskåre bli analysert, for å identifisere eventuelle gener som kan være assosiert med fenomenet, men som ikke tilhører de tidligere beskrevne kategoriene av gener. Til slutt vil vi gjennomføre en helgenomsekvenseringsanalyse (WGS) på en utvalgt undergruppe av BWS-mødre med særegne kliniske historier og negativ WES-analyse, for å utforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regionene som ikke er målrettet av WES.
En helgenommetyleringsanalyse vil bli utført for å identifisere metyleringsendringer hos kvinner med reproduksjonsproblemer, inkludert de med avkom påvirket av BWS
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
MEG-forekomst
Tidsramme: WES ved spesifikke gener i alle kohorter og SNP-array vil bli utført etter innmelding og vil bli ferdigstilt innen måned 17. Den siste delen relatert til WGS på en utvalgt undergruppe av BWS mødre vil bli utført fra 16 til måned 20
|
Forekomst av MEG, spesielt patogenetiske varianter av SCMC, i infertil kvinnelig befolkning og mødre til barn rammet av BWS
|
WES ved spesifikke gener i alle kohorter og SNP-array vil bli utført etter innmelding og vil bli ferdigstilt innen måned 17. Den siste delen relatert til WGS på en utvalgt undergruppe av BWS mødre vil bli utført fra 16 til måned 20
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sammenlign DNA-metylering
Tidsramme: prøver som samles inn vil bli evaluert for helgenommetylering innen måned 20
|
Helgenom-DNA-metylering av blodleukocytter fra kohorter av kvinner med reproduksjonsproblemer, inkludert de med avkom påvirket av BWS og sammenligne det med et tilsvarende antall kjønns- og alderstilpassede kontroller. Bioinformatikkanalyse vil bli brukt til å utlede differensielt metylerte regioner fra metyleringsdata og for å klassifisere kvinnestatus basert på metyleringsprofiler. På grunn av den komplekse distribusjonen assosiert med metyleringsprofiler for hele genomet, kan dimensjonalitetsreduksjonsteknikker (f. PCA, MDS) og klyngemetoder (både hierarkiske og centroidbaserte) vil bli brukt for å vurdere viktigheten av spesifikke regioner (f.eks. påtrykte loci) for å diskriminere prioriterte kvinner fra kontroller i henhold til deres metyleringsprofiler. med reproduksjonsproblemer inkludert de med avkom påvirket av BWS |
prøver som samles inn vil bli evaluert for helgenommetylering innen måned 20
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Edgardo Somigliana, PhD, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- PNRR-MR1-2022-12376622
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .