Anyai gének és epimutációk: Beckwith-Wiedemann szindróma és reproduktív kockázatok
Az anyai hatású gének és epimutációk szerepe a Beckwith-Wiedemann-szindrómában és a nemkívánatos szaporodási eredményekben
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
A projekt első célja az anyai hatású gének (MEG) és konkrétan az SCMC patogén variánsok előfordulási gyakoriságának meghatározása a meddő női populációban és a BWS-es gyermekek anyáiban a reproduktív kimenetelben mutatkozó különbségek okaként. Ebből a célból három betegcsoportot vesznek fel: egészséges nőket, akiknek BWS-ben érintett utódai vannak, és sajátos szaporodási anamnézisük van a klinikailag és molekulárisan diagnosztizált BWS-családok populációjából (1. kohorsz), valamint a 35 év alatti nőket, akiket meddőség miatt ART (definíció szerint: 12 hónapos vagy annál hosszabb rendszeres, védekezés nélküli szexuális együttlét után teherbe esnek, és nem tudnak élve születést elérni három befejezett ciklus után vagy legalább 6 blasztociszta átvitele után (2. kohorsz), valamint a 35 év alatti nők RPL-ben (Recurrent Pregnancy Loss) definíció szerint két vagy több terhesség elvesztése a terhesség 24. hete előtt) (3. kohorsz).
A patogén variánsok azonosítása érdekében első megközelítésként teljes exome szekvenálást (WES) végeznek minden felvett betegnél. A WES-elemzés különböző lépésekben történik. Először is, a kutatók a gének különböző részhalmazait elemzik, amelyek a következőkhöz tartoznak:
- Anyai hatás gének, mint SCMC komponensek és egyéb kapcsolódó gének;
- Gének, amelyek elengedhetetlenek a petesejtek éréséhez és a zigóta progressziójához az embriogenezis korai fázisaiban, vagy erősen expresszálódnak a petesejtek érésének különböző szakaszaiban;
- A genomi lenyomat kialakításában és szabályozásában ismert és potenciális szerepet játszó gének, amelyek részt vesznek a DNS-metilációs reakciókban.
Ezt követően a magas patogenitási pontszámú változatokat elemzik, hogy azonosítsák azokat a géneket, amelyek összefüggésbe hozhatók a jelenséggel, de nem tartoznak a korábban leírt génkategóriákba. Végül a kutatók teljes genom szekvenálási (WGS) elemzést végeznek a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján, amelyek sajátos klinikai előzményekkel és negatív WES elemzéssel rendelkeznek, hogy feltárják az összes nem kódoló és szabályozó régiót, amelyet nem céloz meg a WES.
A projekt második célja a teljes genom metilációs elemzésének alkalmazása a reproduktív problémákkal küzdő nők metilációs változásainak azonosítására, beleértve azokat is, akiknek utódaik BWS-ben szenvednek. A konkrét feladatok a következők lesznek:
- Az 1. célban leírt női kohorszok vér leukocitáinak teljes genom metilációjának meghatározása és összehasonlítása hasonló számú nem és életkor szerinti kontrolléval;
- Az azonos kohorszok sikertelen ART ciklusaiból származó megtermékenyítetlen petesejtek teljes genom metilációjának meghatározása és összehasonlítása a kontroll petesejtekével (amely kutatási célú adományozásból vagy nyilvános adatkészletekből származik).
A DNS-metilációt a vér leukocitáiban metilációs tömb analízissel, a megtermékenyítetlen oocitákban pedig egysejtes biszulfit szekvenálással (scBS-Seq) határozzuk meg.
A projekt harmadik célja az SCMC génváltozatok károsításával összefüggő női meddőség és imprinting rendellenesség hátterében álló molekuláris mechanizmusok meghatározása egérmodell segítségével. A konkrét feladatok a következők lesznek:
- A Padi6 mut/mut petesejtek és a beültetés előtti embriók teljes genom metilációs és RNS profiljának meghatározása vad típusú spermiumokkal végzett IVF után;
- Az a) pontban leírt IVF-ből származó blasztociszták álterhes nőstényekbe való átvitele, valamint a teljes genom DNS-metilációjának és RNS-ének elemzése a származtatott középső terhességi embriókban BS-seq és RNS-seq segítségével;
- Epigenetikai vegyületek mini-szűrése a 2 sejtes Padi6 mut/mut embriókon. Az egér oociták és embriók DNS-metilációját és RNS-expresszióját a teljes genom scBS-seq és scRNS-seq meghatározza.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Fázis
- Nem alkalmazható
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Marco Reschini, MSc
- Telefonszám: +390255034303
- E-mail: marco.reschini@policlinico.mi.it
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonszám: +390255034303
- E-mail: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
Tanulmányi helyek
-
-
-
Milan, Olaszország, 20145
- Toborzás
- Istituto Auxologico Italiano
-
Kapcsolatba lépni:
- Silvia Russo, Phd
- Telefonszám: +393493237520
- E-mail: s.russo@auxologico.it
-
Milan, Olaszország, 20122
- Toborzás
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
Kapcsolatba lépni:
- Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonszám: +390255034303
- E-mail: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Leírás
Bevételi kritériumok:
- 1. kohorsz: egészséges nők BWS-ben érintett utódokkal és sajátos szaporodási előzményekkel a klinikailag és molekulárisan diagnosztizált BWS-családok populációjából;
- 2. kohorsz: olyan 35 év alatti nők, akiknél meddőség miatt ART-t végeznek (ez úgy definiálható, hogy 12 hónapos vagy hosszabb rendszeres, védekezés nélküli szexuális együttlét után nem sikerül teherbe esni), és három befejezett ciklus vagy legalább 6 blasztociszta átvitele után nem tudnak élve szülni;
- 3. kohorsz: 35 év alatti, RPL-ben szenvedő nők (a definíció szerint két vagy több terhesség elvesztése a terhesség 24. hete előtt).
Kizárási kritériumok:
- hagyományos és molekuláris kariotípus elváltozások jelenléte
- ismert okok előfordulása, amelyek csökkent termékenységhez vagy ismétlődő abortuszhoz vezethetnek: petefészek-rendellenességek, például policisztás petefészek-szindróma és egyéb tüszős rendellenességek, az endokrin rendszer rendellenességei, amelyek a reproduktív hormonok szintjének egyensúlyhiányát okozzák, autoimmun állapotok, férfi meddőség, méh vagy petevezeték diszfunkciók és fejlődési rendellenességek, thrombophiliás vagy nem korrigált pajzsmirigyműködési zavarok.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Elsődleges cél: Alapvető tudomány
- Kiosztás: Nem véletlenszerű
- Beavatkozó modell: Párhuzamos hozzárendelés
- Maszkolás: Nincs (Open Label)
Fegyverek és beavatkozások
Résztvevő csoport / kar |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Kísérleti: egészséges nők, akiknek utódaik érintettek BWS-ben
egészséges nők BWS-ben érintett utódokkal és sajátos szaporodási előzményekkel a klinikailag és molekulárisan diagnosztizált BWS-családunk populációjából
|
A teljes exome szekvenálást első megközelítésként minden felvett betegnél elvégzik. Először is elemezzük a gének különböző részhalmazait, amelyek a következőkhöz tartoznak:
Ezt követően a magas patogenitási pontszámú változatokat elemzik, hogy azonosítsák azokat a géneket, amelyek összefüggésbe hozhatók a jelenséggel, de nem tartoznak a korábban leírt génkategóriákba. Végül egy teljes genom szekvenálási (WGS) elemzést végzünk a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján, sajátos klinikai előzményekkel és negatív WES elemzéssel, hogy feltárjuk a WES által nem célzott összes nem kódoló és szabályozó régiót.
A teljes genomra kiterjedő metilációs analízist végeznek a reproduktív problémákkal küzdő nők metilációs változásainak azonosítására, beleértve azokat is, akiknek utódaik BWS-ben szenvednek.
|
|
Kísérleti: ART-on átesett 35 év alatti nők
olyan 35 év alatti nők, akiknél meddőség miatt ART-t végeznek (a definíció szerint 12 hónapos vagy hosszabb rendszeres, védekezés nélküli szexuális együttlét után nem sikerül teherbe esni), és három befejezett ciklus vagy legalább 6 blasztociszta átvitele után nem tudnak élve szülni
|
A teljes exome szekvenálást első megközelítésként minden felvett betegnél elvégzik. Először is elemezzük a gének különböző részhalmazait, amelyek a következőkhöz tartoznak:
Ezt követően a magas patogenitási pontszámú változatokat elemzik, hogy azonosítsák azokat a géneket, amelyek összefüggésbe hozhatók a jelenséggel, de nem tartoznak a korábban leírt génkategóriákba. Végül egy teljes genom szekvenálási (WGS) elemzést végzünk a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján, sajátos klinikai előzményekkel és negatív WES elemzéssel, hogy feltárjuk a WES által nem célzott összes nem kódoló és szabályozó régiót.
A teljes genomra kiterjedő metilációs analízist végeznek a reproduktív problémákkal küzdő nők metilációs változásainak azonosítására, beleértve azokat is, akiknek utódaik BWS-ben szenvednek.
|
|
Kísérleti: 35 év alatti nők, RPL-vel
35 év alatti, RPL-ben szenvedő nők (a definíció szerint két vagy több terhesség elvesztése a terhesség 24. hete előtt)
|
A teljes exome szekvenálást első megközelítésként minden felvett betegnél elvégzik. Először is elemezzük a gének különböző részhalmazait, amelyek a következőkhöz tartoznak:
Ezt követően a magas patogenitási pontszámú változatokat elemzik, hogy azonosítsák azokat a géneket, amelyek összefüggésbe hozhatók a jelenséggel, de nem tartoznak a korábban leírt génkategóriákba. Végül egy teljes genom szekvenálási (WGS) elemzést végzünk a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján, sajátos klinikai előzményekkel és negatív WES elemzéssel, hogy feltárjuk a WES által nem célzott összes nem kódoló és szabályozó régiót.
A teljes genomra kiterjedő metilációs analízist végeznek a reproduktív problémákkal küzdő nők metilációs változásainak azonosítására, beleértve azokat is, akiknek utódaik BWS-ben szenvednek.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
MEG előfordulása
Időkeret: A WES-t az összes kohorszban és az SNP-tömbben meghatározott géneknél a beiratkozást követően végzik el, és a 17. hónapon belül véglegesítik. A WGS-hez kapcsolódó utolsó rész a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján a 16. és a 20. hónap között fog megtörténni.
|
A MEG-ek, különösen az SCMC patogenetikai variánsainak előfordulása meddő női populációban és BWS-ben érintett gyermek anyákban
|
A WES-t az összes kohorszban és az SNP-tömbben meghatározott géneknél a beiratkozást követően végzik el, és a 17. hónapon belül véglegesítik. A WGS-hez kapcsolódó utolsó rész a BWS anyák egy kiválasztott alcsoportján a 16. és a 20. hónap között fog megtörténni.
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Hasonlítsa össze a DNS-metilációt
Időkeret: az összegyűjtött mintákat a 20. hónapon belül értékelik a teljes genom metilációja szempontjából
|
A vér leukocitáinak teljes genom DNS-metilációja a szaporodási problémákkal küzdő nők csoportjaiban, beleértve a BWS-ben érintett utódokat is, és összehasonlítva azt hasonló számú, nemnek és életkornak megfelelő kontrolléval. A bioinformatikai elemzés segítségével a metilációs adatokból differenciáltan metilált régiókra következtethetünk, és a metilációs profilok alapján osztályozzuk a nők állapotát. A teljes genom metilációs profiljaihoz kapcsolódó összetett eloszlás miatt a dimenziócsökkentési technikák (pl. PCA, MDS) és klaszterezési módszereket (mind hierarchikus, mind centroid alapú) alkalmaznak az egyes régiók (pl. imprinted lókuszok), hogy a kiemelt nőket metilációs profiljuk alapján megkülönböztessék a kontrolloktól. szaporodási problémákkal, beleértve a BWS-ben érintett utódokat is |
az összegyűjtött mintákat a 20. hónapon belül értékelik a teljes genom metilációja szempontjából
|
Együttműködők és nyomozók
Együttműködők
Nyomozók
- Kutatásvezető: Edgardo Somigliana, PhD, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- PNRR-MR1-2022-12376622
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .