Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Geny matki i epimutacje: zespół Beckwitha-Wiedemanna i ryzyko reprodukcyjne

29 kwietnia 2025 zaktualizowane przez: Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico

Rola genów wpływających na matkę i epimutacji w zespole Beckwitha-Wiedemanna i niekorzystnych skutkach rozrodczych

Warianty patogenne w podkorowym kompleksie matczynym (SCMC) zidentyfikowano nie tylko u matek dzieci z zespołem Beckwitha-Wiedemanna (BWS), ale także u kobiet z zaburzeniami rozrodu, takimi jak nieudane próby zajścia w ciążę i nawracające utraty ciąży. W oparciu o większą częstość występowania BWS u dzieci urodzonych dzięki technologii wspomaganego rozrodu (ART), projekt ten ma na celu zbadanie częstości występowania i mechanizmu molekularnego patogennych wariantów SCMC u kobiet z zaburzeniami rozrodu. Celem badania będzie (i) ocena częstości występowania tych wariantów jako przyczyny różnic w wynikach reprodukcyjnych w populacji niepłodnych kobiet i matek dzieci z BWS; (ii) zidentyfikować zmiany metylacji u kobiet z problemami reprodukcyjnymi, w tym u kobiet, których potomstwo dotknięte jest BWS; (iii) określić przyczyny molekularne leżące u podstaw niepłodności u kobiet i zaburzeń wdrukowania związanych z uszkadzaniem wariantów genu SCMC za pomocą modelu mysiego.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

Pierwszym celem projektu jest określenie częstości występowania genów wpływających na matkę (MEG), a w szczególności wariantów patogennych SCMC, jako przyczyny różnic w wynikach reprodukcyjnych w populacji niepłodnych kobiet i matek dzieci z BWS. W tym celu zostaną zrekrutowane trzy kohorty pacjentek: zdrowe kobiety z potomstwem dotkniętym BWS i szczególną historią reprodukcyjną z naszej populacji rodzin z BWS zdiagnozowanych klinicznie i molekularnie (kohorta 1), kobiety poniżej 35. roku życia poddawane terapii ART z powodu niepłodności (definiowanej jako brak zajść w ciążę po 12 miesiącach regularnych stosunków płciowych bez zabezpieczenia) i nie mogą urodzić żywego dziecka po trzech pełnych cyklach lub po transferze co najmniej 6 blastocyst (kohorta 2) oraz kobiety poniżej 35. roku życia z RPL (nawracającą utratą ciąży) definiowana jako utrata dwóch lub więcej ciąż przed 24 tygodniem ciąży) (Kohorta 3).

W celu zidentyfikowania wariantów patogennych w pierwszej kolejności u wszystkich zakwalifikowanych pacjentów przeprowadzone zostanie sekwencjonowanie całego egzomu (WES). Analiza WES zostanie przeprowadzona w kilku etapach. W pierwszej kolejności badacze przeanalizują różne podzbiory genów, należące do:

  1. Geny skutku matczynego jako składniki SCMC i inne powiązane geny;
  2. Geny niezbędne w dojrzewaniu oocytu i progresji zygoty we wczesnych fazach embriogenezy lub ulegające silnej ekspresji na różnych etapach dojrzewania oocytu;
  3. Geny o znanej i potencjalnej roli w tworzeniu i kontroli imprintingu genomowego oraz biorące udział w reakcjach metylacji DNA.

Następnie przeanalizowane zostaną warianty o wysokim wskaźniku patogeniczności, aby zidentyfikować geny, które mogą być powiązane z danym zjawiskiem, ale nie należą do wcześniej opisanych kategorii genów. Na koniec badacze przeprowadzą analizę sekwencjonowania całego genomu (WGS) na wybranej podgrupie matek BWS z osobliwą historią kliniczną i negatywną analizą WES, aby zbadać wszystkie regiony niekodujące i regulacyjne, które nie są objęte analizą WES.

Drugim celem tego projektu jest wykorzystanie analizy metylacji całego genomu w celu zidentyfikowania zmian w metylacji u kobiet z problemami rozrodczymi, w tym u kobiet, których potomstwo dotknięte jest BWS. Konkretnymi zadaniami będą:

  1. Określenie metylacji całego genomu leukocytów we krwi w kohortach kobiet opisanych w Celu 1 i porównanie jej z grupą kontrolną o podobnej liczbie dobranych pod względem płci i wieku;
  2. Określenie metylacji całego genomu niezapłodnionych oocytów pochodzących z nieudanych cykli ART tej samej kohorty i porównanie jej z metylacją oocytów kontrolnych (pochodzących z darowizny na cele badawcze lub publicznych zbiorów danych).

Metylacja DNA zostanie określona w leukocytach krwi za pomocą analizy macierzy metylacji, a w niezapłodnionych oocytach za pomocą sekwencjonowania wodorosiarczynem pojedynczych komórek (scBS-Seq).

Trzecim celem projektu jest określenie mechanizmów molekularnych leżących u podstaw niepłodności u kobiet i zaburzeń wdrukowania związanych z uszkodzeniem wariantów genu SCMC za pomocą modelu mysiego. Konkretnymi zadaniami będą:

  1. Określenie profili metylacji całego genomu i RNA oocytów mut/mut Padi6 oraz zarodków przedimplantacyjnych uzyskanych po zapłodnieniu in vitro z plemnikami typu dzikiego;
  2. Przeniesienie blastocyst pochodzących z zapłodnienia in vitro opisanego w a) do samic w ciąży rzekomej i analiza metylacji DNA i RNA całego genomu w uzyskanych zarodkach w połowie ciąży metodą BS-seq i RNA-seq;
  3. Mini-screening związków epigenetycznych na 2-komórkowych zarodkach mut/mut Padi6. Metylację DNA i ekspresję RNA mysich oocytów i zarodków określa się za pomocą scBS-seq i scRNA-seq całego genomu.

Typ studiów

Interwencyjne

Zapisy (Szacowany)

208

Faza

  • Nie dotyczy

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

Lokalizacje studiów

  • Włochy
      • Milan, Włochy, 20145
        • Rekrutacyjny
        • Istituto Auxologico Italiano
        • Kontakt:
      • Milan, Włochy, 20122
        • Rekrutacyjny
        • Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
        • Kontakt:

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Kohorta 1: zdrowe kobiety z potomstwem dotkniętym BWS i szczególną historią reprodukcyjną z naszej populacji rodzin BWS zdiagnozowanych klinicznie i molekularnie;
  • Kohorta 2: kobiety poniżej 35. roku życia poddane ART z powodu niepłodności (definiowanej jako niemożność zajścia w ciążę po 12 miesiącach regularnego współżycia bez zabezpieczenia) i niezdolność do urodzenia żywego dziecka po trzech pełnych cyklach lub po transferze co najmniej 6 blastocyst;
  • Kohorta 3: kobiety poniżej 35. roku życia z RPL (definiowanym jako utrata dwóch lub więcej ciąż przed 24 tygodniem ciąży).

Kryteria wyłączenia:

  • obecność konwencjonalnych i molekularnych zmian kariotypu
  • wystąpienie znanych przyczyn, które mogą prowadzić do zmniejszenia płodności lub nawracających poronień: choroby jajników, takie jak zespół policystycznych jajników i inne zaburzenia pęcherzykowe, zaburzenia układu hormonalnego powodujące zaburzenie równowagi poziomu hormonów rozrodczych, choroby autoimmunologiczne, niepłodność męska, niepłodność macicy lub jajowodów dysfunkcje i wady rozwojowe, zakrzepowe lub nieskorygowane dysfunkcje tarczycy.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Główny cel: Podstawowa nauka
  • Przydział: Nielosowe
  • Model interwencyjny: Przydział równoległy
  • Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)

Broń i interwencje

Grupa uczestników / Arm
Interwencja / Leczenie
Eksperymentalny: zdrowe kobiety posiadające potomstwo dotknięte BWS
zdrowe kobiety z potomstwem dotkniętym BWS i szczególną historią reprodukcyjną z naszej populacji rodzin BWS zdiagnozowanych klinicznie i molekularnie
Genetyczny: Analiza WES

Sekwencjonowanie całego egzomu zostanie przeprowadzone jako pierwsze podejście u wszystkich zrekrutowanych pacjentów. Najpierw przeanalizujemy różne podzbiory genów, należące do:

  1. Geny skutku matczynego jako składniki SCMC i inne powiązane geny;
  2. Geny niezbędne w dojrzewaniu oocytu i progresji zygoty we wczesnych fazach embriogenezy lub ulegające silnej ekspresji na różnych etapach dojrzewania oocytu;
  3. Geny o znanej i potencjalnej roli w tworzeniu i kontroli imprintingu genomowego oraz biorące udział w reakcjach metylacji DNA.

Następnie przeanalizowane zostaną warianty o wysokim wskaźniku patogeniczności, aby zidentyfikować geny, które mogą być powiązane z danym zjawiskiem, ale nie należą do wcześniej opisanych kategorii genów. Na koniec przeprowadzimy analizę sekwencjonowania całego genomu (WGS) na wybranej podgrupie matek BWS z osobliwą historią kliniczną i negatywną analizą WES, aby zbadać wszystkie regiony niekodujące i regulacyjne, które nie są objęte WES.

Genetyczny: analiza metylacji całego genomu
Przeprowadzona zostanie analiza metylacji całego genomu w celu zidentyfikowania zmian w metylacji u kobiet z problemami rozrodczymi, w tym u kobiet z potomstwem dotkniętym BWS
Eksperymentalny: kobiety poniżej 35. roku życia poddawane zabiegowi ART
kobiety poniżej 35. roku życia poddawane terapii ART z powodu niepłodności (definiowanej jako niemożność zajścia w ciążę po 12 miesiącach regularnego współżycia bez zabezpieczenia) i niezdolność do urodzenia żywego dziecka po trzech pełnych cyklach lub po transferze co najmniej 6 blastocyst
Genetyczny: Analiza WES

Sekwencjonowanie całego egzomu zostanie przeprowadzone jako pierwsze podejście u wszystkich zrekrutowanych pacjentów. Najpierw przeanalizujemy różne podzbiory genów, należące do:

  1. Geny skutku matczynego jako składniki SCMC i inne powiązane geny;
  2. Geny niezbędne w dojrzewaniu oocytu i progresji zygoty we wczesnych fazach embriogenezy lub ulegające silnej ekspresji na różnych etapach dojrzewania oocytu;
  3. Geny o znanej i potencjalnej roli w tworzeniu i kontroli imprintingu genomowego oraz biorące udział w reakcjach metylacji DNA.

Następnie przeanalizowane zostaną warianty o wysokim wskaźniku patogeniczności, aby zidentyfikować geny, które mogą być powiązane z danym zjawiskiem, ale nie należą do wcześniej opisanych kategorii genów. Na koniec przeprowadzimy analizę sekwencjonowania całego genomu (WGS) na wybranej podgrupie matek BWS z osobliwą historią kliniczną i negatywną analizą WES, aby zbadać wszystkie regiony niekodujące i regulacyjne, które nie są objęte WES.

Genetyczny: analiza metylacji całego genomu
Przeprowadzona zostanie analiza metylacji całego genomu w celu zidentyfikowania zmian w metylacji u kobiet z problemami rozrodczymi, w tym u kobiet z potomstwem dotkniętym BWS
Eksperymentalny: kobiety poniżej 35. roku życia z RPL
kobiety poniżej 35. roku życia z RPL (definiowanym jako utrata dwóch lub więcej ciąż przed 24. tygodniem ciąży)
Genetyczny: Analiza WES

Sekwencjonowanie całego egzomu zostanie przeprowadzone jako pierwsze podejście u wszystkich zrekrutowanych pacjentów. Najpierw przeanalizujemy różne podzbiory genów, należące do:

  1. Geny skutku matczynego jako składniki SCMC i inne powiązane geny;
  2. Geny niezbędne w dojrzewaniu oocytu i progresji zygoty we wczesnych fazach embriogenezy lub ulegające silnej ekspresji na różnych etapach dojrzewania oocytu;
  3. Geny o znanej i potencjalnej roli w tworzeniu i kontroli imprintingu genomowego oraz biorące udział w reakcjach metylacji DNA.

Następnie przeanalizowane zostaną warianty o wysokim wskaźniku patogeniczności, aby zidentyfikować geny, które mogą być powiązane z danym zjawiskiem, ale nie należą do wcześniej opisanych kategorii genów. Na koniec przeprowadzimy analizę sekwencjonowania całego genomu (WGS) na wybranej podgrupie matek BWS z osobliwą historią kliniczną i negatywną analizą WES, aby zbadać wszystkie regiony niekodujące i regulacyjne, które nie są objęte WES.

Genetyczny: analiza metylacji całego genomu
Przeprowadzona zostanie analiza metylacji całego genomu w celu zidentyfikowania zmian w metylacji u kobiet z problemami rozrodczymi, w tym u kobiet z potomstwem dotkniętym BWS

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Przypadek MEG
Ramy czasowe: WES dla określonych genów we wszystkich kohortach i tablica SNP zostanie przeprowadzona po rejestracji i zostanie sfinalizowana w ciągu 17 miesięcy. Ostatnia część dotycząca WGS na wybranej podgrupie matek BWS zostanie przeprowadzona od 16 do 20 miesiąca
Częstość występowania MEG, zwłaszcza patogenetycznych wariantów SCMC, w populacji niepłodnych kobiet i matek dzieci dotkniętych BWS
WES dla określonych genów we wszystkich kohortach i tablica SNP zostanie przeprowadzona po rejestracji i zostanie sfinalizowana w ciągu 17 miesięcy. Ostatnia część dotycząca WGS na wybranej podgrupie matek BWS zostanie przeprowadzona od 16 do 20 miesiąca

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Porównaj metylację DNA
Ramy czasowe: zebrane próbki zostaną ocenione pod kątem metylacji całego genomu w ciągu 20 miesięcy

Metylacja DNA całego genomu leukocytów krwi kohort kobiet z problemami rozrodczymi, w tym kobiet z potomstwem dotkniętym BWS, i porównanie jej z podobną liczbą kontroli dobranych pod względem płci i wieku. Analiza bioinformatyczna zostanie wykorzystana do wywnioskowania o regionach o zróżnicowanej metylacji na podstawie danych dotyczących metylacji oraz do klasyfikacji statusu kobiet na podstawie profili metylacji. Ze względu na złożoną dystrybucję związaną z profilami metylacji całego genomu, techniki redukcji wymiarów (np. PCA,MDS) oraz metody grupowania (zarówno hierarchiczne, jak i centroidalne) zostaną wykorzystane do oceny znaczenia poszczególnych regionów (np. odciśnięte loci) w celu odróżnienia kobiet priorytetowych od kontroli zgodnie z ich profilami metylacji.

z problemami rozrodczymi, w tym te, których potomstwo dotknięte jest BWS
zebrane próbki zostaną ocenione pod kątem metylacji całego genomu w ciągu 20 miesięcy

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico

Współpracownicy

Federico II University
Istituto Auxologico Italiano
University of Campania Luigi Vanvitelli

Śledczy

  • Główny śledczy: Edgardo Somigliana, PhD, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

19 maja 2023

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

1 grudnia 2025

Ukończenie studiów (Szacowany)

1 stycznia 2026

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

20 marca 2024

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

28 marca 2024

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

4 kwietnia 2024

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

2 maja 2025

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

29 kwietnia 2025

Ostatnia weryfikacja

1 stycznia 2025

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • PNRR-MR1-2022-12376622

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Zespół Beckwitha-Wiedemanna

Badania kliniczne na Analiza WES

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Armenia

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

Subskrybuj