Genes maternos e epimutações: síndrome de Beckwith-Wiedemann e riscos reprodutivos
Papel dos genes de efeito materno e epimutações na síndrome de Beckwith-Wiedemann e resultados reprodutivos adversos
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
O primeiro objetivo do projeto é definir a incidência de Genes de Efeito Materno (MEGs) e especificamente de variantes patogênicas de SCMC como causa de diferenças nos resultados reprodutivos na população feminina infértil e mães de crianças com BWS. Para este objetivo, serão recrutadas três coortes de pacientes: mulheres saudáveis com filhos afetados por BWS e história reprodutiva peculiar da nossa população de famílias de BWS com diagnóstico clínico e molecular (Coorte 1), mulheres com menos de 35 anos submetidas a TARV para infertilidade (definida como falha em conseguir uma gravidez após 12 meses ou mais de relações sexuais regulares desprotegidas) e incapaz de obter um nascimento vivo após três ciclos completos ou após a transferência de pelo menos 6 blastocistos (Coorte 2), e mulheres com menos de 35 anos, com RPL (Perda de Gravidez Recorrente definida como a perda de duas ou mais gestações antes de 24 semanas de gestação) (Coorte 3).
Para identificar variantes patogênicas, o sequenciamento do exoma completo (WES) será realizado como primeira abordagem em todos os pacientes recrutados. A análise WES será realizada seguindo várias etapas. Primeiro, os investigadores irão analisar diferentes subconjuntos de genes, pertencentes a:
- Genes de efeito materno como componentes de SCMC e outros genes relacionados;
- Genes essenciais na maturação do oócito e na progressão do zigoto nas fases iniciais da embriogênese ou altamente expressos em diferentes estágios da maturação do oócito;
- Genes com papéis conhecidos e potenciais no estabelecimento e controle da impressão genômica e envolvidos em reações de metilação do DNA.
Posteriormente, serão analisadas variantes com alto escore de patogenicidade, para identificar quaisquer genes que possam estar associados ao fenômeno, mas que não pertençam às categorias de genes descritas anteriormente. Finalmente, os investigadores conduzirão uma análise de sequenciamento do genoma completo (WGS) em um subgrupo selecionado de mães BWS com histórias clínicas peculiares e análise WES negativa, para explorar todas as regiões regulatórias e não codificantes não visadas pelo WES.
O segundo objetivo deste projeto é empregar a análise de metilação do genoma completo para identificar alterações de metilação em mulheres com problemas reprodutivos, incluindo aquelas com descendentes afetados por BWS. As tarefas específicas serão:
- Determinar a metilação do genoma completo dos leucócitos sanguíneos das coortes de mulheres descritas no Objetivo 1 e compará-la com a de um número semelhante de controles pareados por sexo e idade;
- Determinar a metilação do genoma completo de oócitos não fertilizados derivados de ciclos de TARV malsucedidos das mesmas coortes e compará-la com a de oócitos de controle (derivados de doação para pesquisa ou conjuntos de dados públicos).
A metilação do DNA será determinada em leucócitos sanguíneos por análise de arranjo de metilação e em oócitos não fertilizados por sequenciamento de bissulfito de célula única (scBS-Seq).
O terceiro objetivo do projeto é determinar os mecanismos moleculares subjacentes à infertilidade feminina e ao distúrbio de imprinting associado a variantes prejudiciais do gene SCMC, empregando um modelo de camundongo. As tarefas específicas serão:
- Determinação da metilação do genoma completo e perfis de RNA dos oócitos Padi6 mut/mut e embriões pré-implantação obtidos após fertilização in vitro com espermatozóides de tipo selvagem;
- Transferência dos blastocistos derivados da fertilização in vitro descrita em a) para mulheres pseudográvidas e análise da metilação do DNA do genoma completo e RNA nos embriões derivados de meia gestação por BS-seq e RNA-seq;
- Mini-triagem de compostos epigenéticos nos embriões Padi6 mut/mut de 2 células. A metilação do DNA e a expressão do RNA dos oócitos e embriões de camundongos serão determinadas por scBS-seq e scRNA-seq do genoma completo.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Marco Reschini, MSc
- Número de telefone: +390255034303
- E-mail: marco.reschini@policlinico.mi.it
Estude backup de contato
- Nome: Edgardo Somigliana, PhD
- Número de telefone: +390255034303
- E-mail: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
Locais de estudo
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Milan, Itália, 20145
- Recrutamento
- Istituto Auxologico Italiano
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Contato:
- Silvia Russo, Phd
- Número de telefone: +393493237520
- E-mail: s.russo@auxologico.it
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Milan, Itália, 20122
- Recrutamento
- Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
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Contato:
- Edgardo Somigliana, PhD
- Número de telefone: +390255034303
- E-mail: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critério de inclusão:
- Coorte 1: mulheres saudáveis com descendentes afetados por SBW e história reprodutiva peculiar de nossa população de famílias de SBW com diagnóstico clínico e molecular;
- Coorte 2: mulheres com menos de 35 anos submetidas a TARV para infertilidade (definida como incapacidade de engravidar após 12 meses ou mais de relações sexuais regulares desprotegidas) e incapazes de obter um nado vivo após três ciclos completos ou após a transferência de pelo menos 6 blastocistos;
- Coorte 3: mulheres com menos de 35 anos, com RPL (definida como a perda de duas ou mais gestações antes de 24 semanas de gestação).
Critério de exclusão:
- presença de alterações cariotípicas convencionais e moleculares
- ocorrência de causas conhecidas que podem levar à diminuição da fertilidade ou abortos recorrentes: distúrbios dos ovários, como síndrome do ovário policístico e outros distúrbios foliculares, distúrbios do sistema endócrino que causam desequilíbrios nos níveis de hormônios reprodutivos, doenças autoimunes, infertilidade masculina, problemas uterinos ou tubários disfunções e malformações, disfunções tireoidianas trombofílicas ou não corrigidas.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Ciência básica
- Alocação: Não randomizado
- Modelo Intervencional: Atribuição Paralela
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
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Experimental: mulheres saudáveis com filhos afetados pela SBW
mulheres saudáveis com descendentes afetados por BWS e história reprodutiva peculiar de nossa população de famílias de BWS com diagnóstico clínico e molecular
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O sequenciamento do exoma completo será realizado como primeira abordagem em todos os pacientes recrutados. Primeiro, analisaremos diferentes subconjuntos de genes, pertencentes a:
Posteriormente, serão analisadas variantes com alto escore de patogenicidade, para identificar quaisquer genes que possam estar associados ao fenômeno, mas que não pertençam às categorias de genes descritas anteriormente. Finalmente, conduziremos uma análise de sequenciamento do genoma completo (WGS) em um subgrupo selecionado de mães BWS com histórias clínicas peculiares e análise WES negativa, para explorar todas as regiões não codificantes e regulatórias não visadas pelo WES.
Uma análise de metilação do genoma completo será realizada para identificar alterações de metilação em mulheres com problemas reprodutivos, incluindo aquelas com descendentes afetados por BWS
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Experimental: mulheres com menos de 35 anos submetidas a TARV
mulheres com menos de 35 anos submetidas a TARV para infertilidade (definida como incapacidade de engravidar após 12 meses ou mais de relações sexuais regulares desprotegidas) e incapazes de obter um nascimento vivo após três ciclos completos ou após a transferência de pelo menos 6 blastocistos
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O sequenciamento do exoma completo será realizado como primeira abordagem em todos os pacientes recrutados. Primeiro, analisaremos diferentes subconjuntos de genes, pertencentes a:
Posteriormente, serão analisadas variantes com alto escore de patogenicidade, para identificar quaisquer genes que possam estar associados ao fenômeno, mas que não pertençam às categorias de genes descritas anteriormente. Finalmente, conduziremos uma análise de sequenciamento do genoma completo (WGS) em um subgrupo selecionado de mães BWS com histórias clínicas peculiares e análise WES negativa, para explorar todas as regiões não codificantes e regulatórias não visadas pelo WES.
Uma análise de metilação do genoma completo será realizada para identificar alterações de metilação em mulheres com problemas reprodutivos, incluindo aquelas com descendentes afetados por BWS
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Experimental: mulheres com menos de 35 anos, com RPL
mulheres com menos de 35 anos, com RPL (definida como a perda de duas ou mais gestações antes de 24 semanas de gestação)
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O sequenciamento do exoma completo será realizado como primeira abordagem em todos os pacientes recrutados. Primeiro, analisaremos diferentes subconjuntos de genes, pertencentes a:
Posteriormente, serão analisadas variantes com alto escore de patogenicidade, para identificar quaisquer genes que possam estar associados ao fenômeno, mas que não pertençam às categorias de genes descritas anteriormente. Finalmente, conduziremos uma análise de sequenciamento do genoma completo (WGS) em um subgrupo selecionado de mães BWS com histórias clínicas peculiares e análise WES negativa, para explorar todas as regiões não codificantes e regulatórias não visadas pelo WES.
Uma análise de metilação do genoma completo será realizada para identificar alterações de metilação em mulheres com problemas reprodutivos, incluindo aquelas com descendentes afetados por BWS
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Incidência de MEG
Prazo: WES em genes específicos em todas as coortes e matriz SNP será realizada após a inscrição e será finalizada no mês 17. A última parte relacionada ao WGS em um subgrupo selecionado de mães BWS será realizada do 16º ao 20º mês
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Incidência de MEGs, particularmente variantes patogenéticas de SCMC, na população feminina infértil e mães de crianças afetadas por SBW
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WES em genes específicos em todas as coortes e matriz SNP será realizada após a inscrição e será finalizada no mês 17. A última parte relacionada ao WGS em um subgrupo selecionado de mães BWS será realizada do 16º ao 20º mês
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Compare a metilação do DNA
Prazo: as amostras coletadas serão avaliadas quanto à metilação do genoma completo no mês 20
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Metilação do DNA do genoma completo de leucócitos sanguíneos de coortes de mulheres com problemas reprodutivos, incluindo aquelas com descendentes afetados por BWS e comparação com um número semelhante de controles pareados por sexo e idade. A análise de bioinformática será usada para inferir regiões diferencialmente metiladas a partir de dados de metilação e para classificar o status das mulheres com base em perfis de metilação. Devido à distribuição complexa associada aos perfis de metilação do genoma completo, técnicas de redução de dimensionalidade (por exemplo PCA,MDS) e métodos de agrupamento (hierárquicos e centróides) serão usados para avaliar a importância de regiões específicas (por exemplo, loci impressos) para discriminar mulheres priorizadas dos controles de acordo com seus perfis de metilação. com problemas reprodutivos, incluindo aqueles com descendentes afetados pela BWS |
as amostras coletadas serão avaliadas quanto à metilação do genoma completo no mês 20
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Colaboradores e Investigadores
Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Edgardo Somigliana, PhD, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- PNRR-MR1-2022-12376622
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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