Maternelle gener og epimutationer: Beckwith-Wiedemanns syndrom og reproduktive risici

Hel-eksom-sekventering vil blive udført som den første tilgang hos alle de rekrutterede patienter. Først vil vi analysere forskellige undergrupper af gener, der tilhører:

1. Maternelle virkningsgener som SCMC-komponenter og andre relaterede gener;
2. Gener, der er essentielle i modningen af ​​oocyten og zygoteprogression gennem de tidlige faser af embryogenesen eller stærkt udtrykt på forskellige stadier af oocytmodningen;
3. Gener med kendte og potentielle roller i etablering og kontrol af genomisk prægning og involveret i DNA-methyleringsreaktioner.

Efterfølgende vil varianter med en høj patogenicitetsscore blive analyseret, for at identificere eventuelle gener, der kan være forbundet med fænomenet, men som ikke hører til de tidligere beskrevne kategorier af gener. Endelig vil vi udføre en hel genomsekventeringsanalyse (WGS) på en udvalgt undergruppe af BWS-mødre med ejendommelige kliniske historier og negativ WES-analyse for at udforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regioner, der ikke er målrettet af WES.

Hel-eksom-sekventering vil blive udført som den første tilgang hos alle de rekrutterede patienter. Først vil vi analysere forskellige undergrupper af gener, der tilhører:

1. Maternelle virkningsgener som SCMC-komponenter og andre relaterede gener;
2. Gener, der er essentielle i modningen af ​​oocyten og zygoteprogression gennem de tidlige faser af embryogenesen eller stærkt udtrykt på forskellige stadier af oocytmodningen;
3. Gener med kendte og potentielle roller i etablering og kontrol af genomisk prægning og involveret i DNA-methyleringsreaktioner.

Efterfølgende vil varianter med en høj patogenicitetsscore blive analyseret, for at identificere eventuelle gener, der kan være forbundet med fænomenet, men som ikke hører til de tidligere beskrevne kategorier af gener. Endelig vil vi udføre en hel genomsekventeringsanalyse (WGS) på en udvalgt undergruppe af BWS-mødre med ejendommelige kliniske historier og negativ WES-analyse for at udforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regioner, der ikke er målrettet af WES.

Hel-eksom-sekventering vil blive udført som den første tilgang hos alle de rekrutterede patienter. Først vil vi analysere forskellige undergrupper af gener, der tilhører:

1. Maternelle virkningsgener som SCMC-komponenter og andre relaterede gener;
2. Gener, der er essentielle i modningen af ​​oocyten og zygoteprogression gennem de tidlige faser af embryogenesen eller stærkt udtrykt på forskellige stadier af oocytmodningen;
3. Gener med kendte og potentielle roller i etablering og kontrol af genomisk prægning og involveret i DNA-methyleringsreaktioner.

Efterfølgende vil varianter med en høj patogenicitetsscore blive analyseret, for at identificere eventuelle gener, der kan være forbundet med fænomenet, men som ikke hører til de tidligere beskrevne kategorier af gener. Endelig vil vi udføre en hel genomsekventeringsanalyse (WGS) på en udvalgt undergruppe af BWS-mødre med ejendommelige kliniske historier og negativ WES-analyse for at udforske alle de ikke-kodende og regulatoriske regioner, der ikke er målrettet af WES.

Helgenom-DNA-methylering af blodleukocytter fra kohorter af kvinder med reproduktionsproblemer, herunder dem med afkom påvirket af BWS og sammenligne det med et tilsvarende antal køns- og aldersmatchede kontroller. Bioinformatikanalyse vil blive brugt til at udlede differentielt methylerede regioner fra methyleringsdata og til at klassificere kvindestatus baseret på methyleringsprofiler. På grund af den komplekse fordeling, der er forbundet med helgenommethyleringsprofiler, kan dimensionsreduktionsteknikker (f. PCA,MDS) og klyngemetoder (både hierarkiske og centroidbaserede) vil blive brugt til at vurdere betydningen af ​​specifikke regioner (f.eks. indprintede loci) for at skelne prioriterede kvinder fra kontroller i henhold til deres methyleringsprofiler.

med reproduktionsproblemer, herunder dem med afkom, der er ramt af BWS