Moderns gener och epimutationer: Beckwith-Wiedemanns syndrom och reproduktionsrisker
Rollen för gener med maternal effekt och epimutationer i Beckwith-Wiedemanns syndrom och ogynnsamma reproduktiva resultat
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Det första syftet med projektet är att definiera förekomsten av Maternal-Effect Gener (MEG) och specifikt av SCMC-patogena varianter som en orsak till skillnader i reproduktionsresultat i den infertila kvinnliga befolkningen och mödrar till BWS-barn. För detta syfte kommer tre kohorter av patienter att rekryteras: friska kvinnor med avkomma som drabbats av BWS och märklig reproduktionshistoria från vår population av kliniskt och molekylärt diagnostiserade BWS-familjer (Kohort 1), kvinnor under 35 år som genomgår ART för infertilitet (definierad som misslyckande att uppnå en graviditet efter 12 månader eller mer av regelbundna oskyddade samlag) och inte kunna få en levande födsel efter tre avslutade cykler eller efter överföring av minst 6 blastocyster (Kohort 2) och kvinnor under 35 år med RPL (Recurrent Pregnancy Loss) definieras som förlust av två eller flera graviditeter före 24 veckors graviditet) (Kohort 3).
För att identifiera patogena varianter kommer helexomsekvensering (WES) att utföras som det första tillvägagångssättet hos alla rekryterade patienter. WES-analys kommer att utföras efter olika steg. Först kommer utredarna att analysera olika undergrupper av gener, som tillhör:
- Maternal effektgener som SCMC-komponenter och andra relaterade gener;
- Gener som är väsentliga för mognad av oocyten och zygoteprogression genom de tidiga faserna av embryogenesen eller starkt uttryckta vid olika stadier av oocytmognad;
- Gener med kända och potentiella roller vid etablering och kontroll av genomisk prägling och involverade i DNA-metyleringsreaktioner.
Därefter kommer varianter med hög patogenicitetspoäng att analyseras, för att identifiera eventuella gener som kan vara associerade med fenomenet, men som inte tillhör de tidigare beskrivna kategorierna av gener. Slutligen kommer utredarna att genomföra en helgenomsekvenseringsanalys (WGS) på en utvald undergrupp av BWS-mödrar med speciella kliniska historier och negativ WES-analys, för att utforska alla icke-kodande och regulatoriska regioner som inte riktas mot WES.
Det andra syftet med detta projekt är att använda hel-genom-metyleringsanalys för att identifiera metyleringsförändringar hos kvinnor med reproduktionsproblem, inklusive de med avkommor som drabbats av BWS. Specifika arbetsuppgifter kommer att vara:
- Bestämning av helgenomets metylering av blodleukocyter i de kohorter av kvinnor som beskrivs i mål 1 och jämföra den med den för ett liknande antal köns- och åldersmatchade kontroller;
- Att bestämma helgenomets metylering av obefruktade oocyter härrörande från misslyckade ART-cykler av samma kohorter och jämföra den med kontrolloocyternas (härrörande från antingen donation för forskning eller offentliga datauppsättningar).
DNA-metylering kommer att bestämmas i blodleukocyter genom metyleringsarrayanalys och i obefruktade oocyter genom enkelcells bisulfitsekvensering (scBS-Seq).
Det tredje syftet med projektet är att bestämma de molekylära mekanismerna bakom kvinnlig infertilitet och intryckningsstörning associerad med skadliga SCMC-genvarianter genom att använda en musmodell. Specifika arbetsuppgifter kommer att vara:
- Bestämning av helgenommetylerings- och RNA-profilerna för Padi6 mut/mut-oocyterna och preimplantationsembryon erhållna efter IVF med vildtypspermier;
- Överföring av blastocyster härledda från IVF som beskrivs i a) till pseudogravida honor och analys av helgenomets DNA-metylering och RNA i de härledda embryona i mitten av graviditeten genom BS-seq och RNA-seq;
- Miniscreening av epigenetiska föreningar på 2-cells Padi6 mut/mut embryon. DNA-metylering och RNA-uttryck av musoocyter och embryon kommer att bestämmas av helgenom scBS-seq och scRNA-seq.
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Fas
- Inte tillämpbar
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Marco Reschini, MSc
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: marco.reschini@policlinico.mi.it
Studera Kontakt Backup
- Namn: Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
Studieorter
-
-
-
Milan, Italien, 20145
- Rekrytering
- Istituto Auxologico Italiano
-
Kontakt:
- Silvia Russo, Phd
- Telefonnummer: +393493237520
- E-post: s.russo@auxologico.it
-
Milan, Italien, 20122
- Rekrytering
- Fondazione IRCCS CA' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
-
Kontakt:
- Edgardo Somigliana, PhD
- Telefonnummer: +390255034303
- E-post: edgardo.somigliana@policlinico.mi.it
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Kohort 1: friska kvinnor med avkomma som drabbats av BWS och märklig reproduktionshistoria från vår population av kliniskt och molekylärt diagnostiserade BWS-familjer;
- Kohort 2: kvinnor under 35 år som genomgår ART för infertilitet (definierat som misslyckande att uppnå en graviditet efter 12 månader eller mer av regelbundna oskyddade samlag) och oförmögna att få en levande födsel efter tre avslutade cykler eller efter överföring av minst 6 blastocyster;
- Kohort 3: kvinnor under 35 år, med RPL (definierat som förlust av två eller flera graviditeter före 24 veckors graviditet).
Exklusions kriterier:
- förekomst av konventionella och molekylära karyotypförändringar
- förekomst av kända orsaker som kan leda till minskad fertilitet eller återkommande aborter: rubbningar i äggstockarna, såsom polycystiskt ovariesyndrom och andra follikulära störningar, störningar i det endokrina systemet som orsakar obalanser i reproduktionshormonnivåerna, autoimmuna tillstånd, manlig infertilitet, livmoder eller tubal dysfunktioner och missbildningar, trombofila eller okorrigerade sköldkörteldysfunktioner.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Primärt syfte: Grundläggande vetenskap
- Tilldelning: Icke-randomiserad
- Interventionsmodell: Parallellt uppdrag
- Maskning: Ingen (Open Label)
Vapen och interventioner
Deltagargrupp / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Experimentell: friska kvinnor med avkomma som drabbats av BWS
friska kvinnor med avkommor som drabbats av BWS och märklig reproduktionshistoria från vår population av kliniskt och molekylärt diagnostiserade BWS-familjer
|
Hel-exom-sekvensering kommer att utföras som den första metoden hos alla rekryterade patienter. Först kommer vi att analysera olika undergrupper av gener, som tillhör:
Därefter kommer varianter med hög patogenicitetspoäng att analyseras, för att identifiera eventuella gener som kan vara associerade med fenomenet, men som inte tillhör de tidigare beskrivna kategorierna av gener. Slutligen kommer vi att genomföra en helgenomsekvenseringsanalys (WGS) på en utvald undergrupp av BWS-mödrar med speciella kliniska historier och negativ WES-analys, för att utforska alla icke-kodande och regulatoriska regioner som inte är inriktade på WES.
En hel-genommetyleringsanalys kommer att utföras för att identifiera metyleringsförändringar hos kvinnor med reproduktionsproblem, inklusive de med avkomma som drabbats av BWS
|
|
Experimentell: kvinnor under 35 år som genomgår ART
kvinnor under 35 som genomgår ART för infertilitet (definierat som misslyckande att uppnå en graviditet efter 12 månader eller mer av regelbundna oskyddade samlag) och inte kan få en levande födsel efter tre avslutade cykler eller efter överföring av minst 6 blastocyster
|
Hel-exom-sekvensering kommer att utföras som den första metoden hos alla rekryterade patienter. Först kommer vi att analysera olika undergrupper av gener, som tillhör:
Därefter kommer varianter med hög patogenicitetspoäng att analyseras, för att identifiera eventuella gener som kan vara associerade med fenomenet, men som inte tillhör de tidigare beskrivna kategorierna av gener. Slutligen kommer vi att genomföra en helgenomsekvenseringsanalys (WGS) på en utvald undergrupp av BWS-mödrar med speciella kliniska historier och negativ WES-analys, för att utforska alla icke-kodande och regulatoriska regioner som inte är inriktade på WES.
En hel-genommetyleringsanalys kommer att utföras för att identifiera metyleringsförändringar hos kvinnor med reproduktionsproblem, inklusive de med avkomma som drabbats av BWS
|
|
Experimentell: kvinnor under 35 år, med RPL
kvinnor under 35 år, med RPL (definieras som förlust av två eller flera graviditeter före 24 veckors graviditet)
|
Hel-exom-sekvensering kommer att utföras som den första metoden hos alla rekryterade patienter. Först kommer vi att analysera olika undergrupper av gener, som tillhör:
Därefter kommer varianter med hög patogenicitetspoäng att analyseras, för att identifiera eventuella gener som kan vara associerade med fenomenet, men som inte tillhör de tidigare beskrivna kategorierna av gener. Slutligen kommer vi att genomföra en helgenomsekvenseringsanalys (WGS) på en utvald undergrupp av BWS-mödrar med speciella kliniska historier och negativ WES-analys, för att utforska alla icke-kodande och regulatoriska regioner som inte är inriktade på WES.
En hel-genommetyleringsanalys kommer att utföras för att identifiera metyleringsförändringar hos kvinnor med reproduktionsproblem, inklusive de med avkomma som drabbats av BWS
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
MEG-incidens
Tidsram: WES vid specifika gener i alla kohorter och SNP-array kommer att utföras efter registrering och kommer att slutföras inom månad 17. Den sista delen relaterad till WGS på en utvald undergrupp av BWS-mödrar kommer att utföras från 16 till månad 20
|
Förekomst av MEG, särskilt patogenetiska varianter av SCMC, i infertil kvinnlig befolkning och mödrar till barn som drabbats av BWS
|
WES vid specifika gener i alla kohorter och SNP-array kommer att utföras efter registrering och kommer att slutföras inom månad 17. Den sista delen relaterad till WGS på en utvald undergrupp av BWS-mödrar kommer att utföras från 16 till månad 20
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Jämför DNA-metylering
Tidsram: Samlade prover kommer att utvärderas för helgenommetylering inom månad 20
|
Helgenom-DNA-metylering av blodleukocyter från kohorter av kvinnor med reproduktionsproblem, inklusive de med avkomma som drabbats av BWS och jämför det med ett liknande antal köns- och åldersmatchade kontroller. Bioinformatikanalys kommer att användas för att sluta sig till differentiellt metylerade regioner från metyleringsdata och för att klassificera kvinnors status baserat på metyleringsprofiler. På grund av den komplexa fördelning som är förknippad med metyleringsprofiler för hela genomet, kan dimensionsreduktionstekniker (t. PCA,MDS) och klustringsmetoder (både hierarkiska och centroidbaserade) kommer att användas för att bedöma betydelsen av specifika regioner (t.ex. präglade loci) för att skilja prioriterade kvinnor från kontroller enligt deras metyleringsprofiler. med reproduktionsproblem inklusive de med avkomma som påverkats av BWS |
Samlade prover kommer att utvärderas för helgenommetylering inom månad 20
|
Samarbetspartners och utredare
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Edgardo Somigliana, PhD, Fondazione IRCCS Ca' Granda, Ospedale Maggiore Policlinico
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- PNRR-MR1-2022-12376622
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .