循环肿瘤DNA 5mC/5hmC生物标志物预测转移性结直肠癌化疗疗效 (EpiCORE)
开发基于cfDNA 5mC/5hmC的表观遗传生物标志物组合以预测转移性结直肠癌化疗疗效
EpiCORE研究旨在识别基于cfDNA的表观遗传标记,这些标记可预测转移性结直肠癌(mCRC)患者对一线化疗(FOLFOX或FOLFIRI)的反应。
通过整合5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)分析,本研究致力于建立一个能够区分应答者与非应答者的无创生物标志物组合。
研究概览
详细说明
尽管引入了FOLFOX(5-氟尿嘧啶、亚叶酸、奥沙利铂)和FOLFIRI(5-氟尿嘧啶、亚叶酸、伊立替康)等多药化疗方案,转移性结直肠癌(mCRC)的治疗效果仍存在显著差异。
现有的预测性生物标志物,如RAS/BRAF突变或微卫星不稳定性,均无法准确预测对细胞毒性化疗的反应。
最新证据表明,cfDNA甲基化(5mC)和羟甲基化(5hmC)模式能反映肿瘤生物学特性及药物敏感性,为精准化疗提供了新途径。
EpiCORE研究整合全基因组5mC/5hmC测序与靶向验证实验,旨在识别和确认化疗疗效的表观遗传学决定因素。
发现阶段:对接受一线FOLFOX或FOLFIRI治疗患者的cfDNA进行全基因组5mC/5hmC图谱分析,识别与治疗反应相关的候选区域。
训练阶段:基于候选位点进行靶向测序和模型构建。
验证阶段:通过qPCR检测确认最终EpiCORE检测组合的预测准确性。
本研究致力于建立可靠的cfDNA生物标志物框架,用于预测和监测mCRC化疗反应,为个体化治疗决策提供支持。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Ajay Goel, PhD
- 电话号码:6263598111
- 邮箱:ajgoel@coh.org
学习地点
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California
-
Duarte、California、美国、91010
- 招聘中
- City of Hope Medical Center
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接触:
- Ajay Goel, PhD
- 电话号码:626-218-3452
- 邮箱:ajgoel@coh.org
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 经组织学确认的转移性结直肠腺癌(mCRC)。
- 已接受一线化疗(FOLFOX或FOLFIRI方案)。
- 可获得治疗前血清或血浆样本用于cfDNA 5mC/5hmC分析。
- 具有影像学或临床疗效评估记录(基于RECIST 1.1标准或无进展生存期)。
- 可获得RAS/BRAF基因突变状态。
排除标准:
- cfDNA产量不足或DNA质量差。
- 非腺癌组织学类型。
- 可能改变cfDNA甲基化水平的活动性炎症或自身免疫性疾病。
- 需要全身治疗的并发恶性肿瘤。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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探索队列 - 无进展生存期 ≥ 12 个月(应答者)
首次化疗(FOLFOX或FOLFIRI方案)后实现无进展生存期≥12个月的转移性结直肠癌患者。 通过cfDNA 5mC/5hmC测序识别持久疗效的表观遗传学决定因素。 |
通过预处理血浆中cfDNA的全基因组甲基化与羟甲基化谱分析,鉴定与化疗疗效相关的分子决定因素(无进展生存期PFS≥12个月对比<12个月)。
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探索队列 - 无进展生存期 < 12个月(无应答者)
一线化疗后无进展生存期<12个月的患者。 与应答者进行比较,以识别与耐药性相关的表观遗传学特征。 |
通过预处理血浆中cfDNA的全基因组甲基化与羟甲基化谱分析,鉴定与化疗疗效相关的分子决定因素(无进展生存期PFS≥12个月对比<12个月)。
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训练队列 - 无进展生存期≥12个月(应答者)
具有长期无进展生存期(PFS≥12个月)的独立转移性结直肠癌队列。
采用靶向测序(EpiCORE检测)以优化预测标志物。
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对发现阶段获取的cfDNA 5mC/5hmC标志物进行靶向验证,采用测序和qPCR技术构建并验证一线化疗反应预测模型。
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训练队列 - 无进展生存期 < 12个月(无应答者)
独立转移性结直肠癌队列,短无进展生存期(<12个月)。
采用靶向测序验证耐药相关标志物。
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对发现阶段获取的cfDNA 5mC/5hmC标志物进行靶向验证,采用测序和qPCR技术构建并验证一线化疗反应预测模型。
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验证队列 - 无进展生存期 ≥ 12 个月(应答者)
采用基于qPCR的EpiCORE检测方法对独立验证队列进行分析,以确认生物标志物的预测准确性。
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对发现阶段获取的cfDNA 5mC/5hmC标志物进行靶向验证,采用测序和qPCR技术构建并验证一线化疗反应预测模型。
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验证队列 - 无进展生存期 < 12个月(无应答者)
对预后不良的独立验证队列进行无进展生存期分析,以评估模型的特异性和性能表现。
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对发现阶段获取的cfDNA 5mC/5hmC标志物进行靶向验证,采用测序和qPCR技术构建并验证一线化疗反应预测模型。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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无进展生存期 (PFS)
大体时间:自一线化疗开始起最长36个月
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无进展生存期(PFS)定义为从开始一线化疗(FOLFOX或FOLFIRI方案)至记录到疾病进展或任何原因导致死亡的日期,以先发生者为准。 EpiCORE研究的主要目的是评估基于cfDNA 5mC/5hmC的生物标志物谱(EpiCORE检测组合)是否与转移性结直肠癌(mCRC)患者的无进展生存期差异存在关联。 |
自一线化疗开始起最长36个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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总生存期(OS):
大体时间:从一线化疗开始最长60个月
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从化疗开始至全因死亡的时间
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从一线化疗开始最长60个月
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Ajay Goel, PhD、City of Hope Medical Center
出版物和有用的链接
一般刊物
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研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
与本研究相关的术语
其他研究编号
- 23228/EpiCORE
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)?
IPD 计划说明
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
研究美国 FDA 监管的设备产品
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