cfDNA 5mC/5hmC biomarkörer för att förutsäga kemoterapisvar vid metastaserad kolorektalcancer (EpiCORE)
6 juli 2026 uppdaterad av: City of Hope Medical Center
Utveckling av en cfDNA 5mC/5hmC-baserad epigenetisk biomarkörpanel för att förutsäga effektiviteten av kemoterapi vid metastaserad kolorektalcancer
EpiCORE-studien syftar till att identifiera cfDNA-baserade epigenetiska markörer som kan förutsäga svar på första linjens kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) vid metastaserande kolorektalcancer (mCRC).
Genom att integrera profilering av 5-metylcytosin (5mC) och 5-hydroxymetylcytosin (5hmC) strävar denna studie efter att etablera en icke-invasiv biomarkörpanel som kan skilja respondenter från icke-respondenter.
Studieöversikt
Status
Rekrytering
Betingelser
Detaljerad beskrivning
Trots införandet av multiagent-kemoteriregimer som FOLFOX (5-FU, leucovorin, oxaliplatin) och FOLFIRI (5-FU, leucovorin, irinotekan) förblir behandlingsresultaten vid metastaserande kolorektalcancer (mCRC) högst varierande.
Nuvarande prediktiva biomarkörer, såsom RAS/BRAF-mutation eller mikrosatellitinstabilitet, lyckas inte exakt förutsäga respons på cytotoxisk kemoterapi.
Ny forskning tyder på att cfDNA-metylerings- (5mC) och hydroxymetyleringsmönster (5hmC) återspeglar tumörbiologi och läkemedelskänslighet, vilket erbjuder en lovande väg för precisionskemoterapi.
EpiCORE-studien integrerar genombredds 5mC/5hmC-sekvensering och riktade valideringsanalyser för att identifiera och bekräfta epigenetiska bestämningsfaktorer för kemoterapieffekt.
Upptäcktsfas: Genombredds 5mC/5hmC-profilering av cfDNA från patienter behandlade med förstalinje FOLFOX eller FOLFIRI för att identifiera kandidatregioner associerade med behandlingsrespons.
Träningsfas: Riktad sekvensering och modellkonstruktion baserad på kandidatlokus.
Valideringsfas: qPCR-baserad testning för att bekräfta den slutliga EpiCORE-panelens prediktiva noggrannhet.
Denna studie syftar till att etablera ett robust cfDNA-biomarkörramverk för att förutsäga och övervaka kemoterapirespons vid mCRC, vilket bidrar till individualiserat terapeutiskt beslutsfattande.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Beräknad)
600
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studiekontakt
- Namn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 6263598111
- E-post: ajgoel@coh.org
Studieorter
-
-
California
-
Duarte, California, Förenta staterna, 91010
- Rekrytering
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-post: ajgoel@coh.org
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Nej
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
Patienter diagnostiserade med kolorektal adenocarcinom i stadium IV som fått första linjens FOLFOX- eller FOLFIRI-kemoterapi och har tillgängliga pre-behandlings serum- eller plasmaprov för cfDNA-analys.
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Histologiskt bekräftad metastatisk kolorektal adenocarcinom (mCRC).
- Har fått första linjens kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI).
- Tillgång till pre-behandlings serum- eller plasmaprov för cfDNA 5mC/5hmC-analys.
- Dokumenterad radiologisk eller klinisk responsutvärdering (RECIST 1.1 eller PFS-baserad).
- RAS/BRAF-mutationsstatus tillgänglig.
Exklusionskriterier:
- Otillräcklig cfDNA-utvinst eller dålig DNA-kvalitet.
- Icke-adenocarcinom histologi.
- Aktiv inflammatorisk eller autoimmun sjukdom som kan förändra cfDNA-metylering.
- Samtidig malignitet som kräver systemisk behandling.
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Upptäcktskohort - PFS ≥ 12 månader (Svarare)
Patienter med mCRC som uppnått progressionsfri överlevnad ≥ 12 månader efter första linjens kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI). cfDNA 5mC/5hmC-sekvensering utförd för att identifiera epigenetiska bestämningsfaktorer för långvarigt svar. |
Genomövergripande profilering av cfDNA-metylering och hydroximetylering från prebehandlingsplasma för att identifiera molekylära determinanter associerade med kemoterapieffektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Upptäcktskohort - PFS < 12 månader (Non-Responder)
Patienter med progressionsfri överlevnad < 12 månader efter första linjens kemoterapi. Jämfört med respondenter för att identifiera epigenetiska egenskaper associerade med resistens. |
Genomövergripande profilering av cfDNA-metylering och hydroximetylering från prebehandlingsplasma för att identifiera molekylära determinanter associerade med kemoterapieffektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Träningskohort - PFS ≥ 12 månader (Svarande)
Oberoende mCRC-kohort med lång PFS (≥12 mån).
Målinriktad sekvensering (EpiCORE-analys) för att förfina prediktiva markörer.
|
Målinriktad validering av cfDNA 5mC/5hmC-markörer från upptäcktsfasen med sekvensering och qPCR för att bygga och validera en prediktiv modell för förstalinje kemoterapirespons.
|
|
Träningskohort - PFS < 12 månader (Non-Responder)
Oberoende mCRC-kohort med kort PFS (<12 mån).
Målsekvensering för att validera resistensassocierade markörer.
|
Målinriktad validering av cfDNA 5mC/5hmC-markörer från upptäcktsfasen med sekvensering och qPCR för att bygga och validera en prediktiv modell för förstalinje kemoterapirespons.
|
|
Valideringskohort - PFS ≥ 12 Månader (Svarare)
Oberoende valideringskohort analyserad med qPCR-baserad EpiCORE-analys för att bekräfta biomarkörens prediktiva noggrannhet.
|
Målinriktad validering av cfDNA 5mC/5hmC-markörer från upptäcktsfasen med sekvensering och qPCR för att bygga och validera en prediktiv modell för förstalinje kemoterapirespons.
|
|
Valideringskohort - PFS < 12 månader (Icke-svarare)
Oberoende valideringskohort med dålig PFS analyserad för att bedöma specificitet och modellprestanda.
|
Målinriktad validering av cfDNA 5mC/5hmC-markörer från upptäcktsfasen med sekvensering och qPCR för att bygga och validera en prediktiv modell för förstalinje kemoterapirespons.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Progressionsfri överlevnad (PFS)
Tidsram: Upp till 36 månader från start av första linjens kemoterapi
|
Progressionsfri överlevnad (PFS) definieras som tiden från initiering av förstalinjeskemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) till datumet för dokumenterad sjukdomsprogression eller död från vilken orsak som helst, beroende på vilket som inträffar först. Det primära målet med EpiCORE-studien är att utvärdera om cfDNA 5mC/5hmC-baserade biomarkörprofiler (EpiCORE-panel) är associerade med skillnader i PFS bland patienter med metastaserad kolorektalcancer (mCRC). |
Upp till 36 månader från start av första linjens kemoterapi
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Totalöverlevnad (OS):
Tidsram: Upp till 60 månader från start av första linjens kemoterapi
|
Tid från kemoterapistart till död från vilken orsak som helst
|
Upp till 60 månader från start av första linjens kemoterapi
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationer och användbara länkar
Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.
Allmänna publikationer
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
21 juni 2024
Primärt slutförande (Beräknad)
18 juni 2028
Avslutad studie (Beräknad)
18 juni 2028
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
3 november 2025
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
3 november 2025
Första postat (Faktisk)
5 november 2025
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
7 juli 2026
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
6 juli 2026
Senast verifierad
1 juli 2026
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 23228/EpiCORE
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
NEJ
IPD-planbeskrivning
Data som samlats in för studien kommer att göras tillgänglig för andra, inklusive avidentifierade deltagardata, vid publicering, via ett undertecknat dataåtkomstavtal och efter forskarnas gottfinnande när det gäller godkännande av den föreslagna användningen av sådan data.
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .