Biomarcadores de cfDNA 5mC/5hmC para Prever a Resposta à Quimioterapia no Cancro Colorretal Metastático (EpiCORE)
3 de novembro de 2025 atualizado por: City of Hope Medical Center
Desenvolvimento de um Painel de Biomarcadores Epigenéticos baseado em cfDNA 5mC/5hmC para Prever a Eficácia da Quimioterapia no Cancro Colorretal Metastático
O estudo EpiCORE visa identificar marcadores epigenéticos baseados em cfDNA preditivos de resposta à quimioterapia de primeira linha (FOLFOX ou FOLFIRI) no cancro colorretal metastático (mCRC).
Ao integrar a caracterização de 5-metilcitosina (5mC) e 5-hidroximetilcitosina (5hmC), este estudo procura estabelecer um painel de biomarcadores não invasivo capaz de distinguir respondedores de não respondedores.
Visão geral do estudo
Status
Recrutamento
Condições
Descrição detalhada
Apesar da introdução de regimes de quimioterapia multiagente, como FOLFOX (5-FU, leucovorina, oxaliplatina) e FOLFIRI (5-FU, leucovorina, irinotecano), os resultados do tratamento no cancro colorretal metastático (mCRC) permanecem altamente variáveis.
Os biomarcadores preditivos atuais, como a mutação RAS/BRAF ou instabilidade de microssatélites, não conseguem prever com precisão a resposta à quimioterapia citotóxica.
Evidências emergentes sugerem que os padrões de metilação (5mC) e hidroximetilação (5hmC) do ADNlc refletem a biologia tumoral e a sensibilidade aos fármacos, oferecendo uma via promissora para a quimioterapia de precisão.
O estudo EpiCORE integra sequenciação genómica completa de 5mC/5hmC e ensaios de validação dirigida para identificar e confirmar determinantes epigenéticos da eficácia da quimioterapia.
Fase de descoberta: Perfis genómicos completos de 5mC/5hmC do ADNlc de pacientes tratados com FOLFOX ou FOLFIRI em primeira linha para identificar regiões candidatas associadas à resposta ao tratamento.
Fase de treino: Sequenciação dirigida e construção de modelos baseada em loci candidatos.
Fase de validação: Testes baseados em qPCR para confirmar a precisão preditiva do painel EpiCORE finalizado.
Este estudo visa estabelecer uma estrutura robusta de biomarcadores de ADNlc para prever e monitorizar a resposta à quimioterapia no mCRC, contribuindo para a tomada de decisão terapêutica individualizada.
Tipo de estudo
Observacional
Inscrição (Estimado)
600
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Contato de estudo
- Nome: Ajay Goel, PhD
- Número de telefone: 6263598111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Locais de estudo
-
-
California
-
Duarte, California, Estados Unidos, 91010
- Recrutamento
- City of Hope Medical center
-
Contato:
- Ajay Goel, PhD
- Número de telefone: 626-218-3452
- E-mail: AJGOEL@COH.ORG
-
-
Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Não
Método de amostragem
Amostra Não Probabilística
População do estudo
Doentes diagnosticados com adenocarcinoma colorretal em Estádio IV que receberam quimioterapia de primeira linha com FOLFOX ou FOLFIRI e têm amostras de soro ou plasma pré-tratamento disponíveis para análise de ADNlc.
Descrição
Critérios de Inclusão:
- Adenocarcinoma colorretal metastático confirmado histologicamente (mCRC).
- Recebeu quimioterapia de primeira linha (FOLFOX ou FOLFIRI).
- Disponibilidade de amostras de soro ou plasma pré-tratamento para análise de cfDNA 5mC/5hmC.
- Avaliação de resposta radiológica ou clínica documentada (RECIST 1.1 ou baseada em PFS).
- Estado da mutação RAS/BRAF disponível.
Critérios de Exclusão:
- Rendimento inadequado de cfDNA ou má qualidade do ADN.
- Histologia não adenocarcinomatosa.
- Doença inflamatória ou autoimune ativa que possa alterar a metilação do cfDNA.
- Neoplasia maligna concomitante que requeira terapia sistémica.
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
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Cohorte de Descoberta - PFS ≥ 12 Meses (Respondedor)
Pacientes com CCRm que alcançaram sobrevivência livre de progressão ≥ 12 meses após quimioterapia de primeira linha (FOLFOX ou FOLFIRI). Sequenciação de cfDNA 5mC/5hmC realizada para identificar determinantes epigenéticos de resposta duradoura. |
Perfilamento de todo o genoma da metilação e hidroximetilação do cfDNA a partir de plasma pré-tratamento para identificar determinantes moleculares associados à eficácia da quimioterapia (PFS ≥ 12M vs < 12M).
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Cohorte de Descoberta - PFS < 12 Meses (Não-Respondedor)
Doentes com sobrevivência livre de progressão < 12 meses após quimioterapia de primeira linha. Comparado com respondedores para identificar características epigenéticas associadas à resistência. |
Perfilamento de todo o genoma da metilação e hidroximetilação do cfDNA a partir de plasma pré-tratamento para identificar determinantes moleculares associados à eficácia da quimioterapia (PFS ≥ 12M vs < 12M).
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Cohorte de Treino - SLP ≥ 12 Meses (Respondedor)
Cohorte independente de CCRm com PFS longo (≥12M).
Sequenciação direcionada (ensaio EpiCORE) para refinar marcadores preditivos.
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Validação direcionada de marcadores cfDNA 5mC/5hmC da fase de descoberta utilizando sequenciação e qPCR para construir e validar um modelo preditivo de resposta à quimioterapia de primeira linha.
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Cohorte de Treino - SLP < 12 Meses (Não-Respondedor)
Cohorte independente de CCRm com PFS curto (<12M).
Sequenciação direcionada para validar marcadores associados à resistência.
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Validação direcionada de marcadores cfDNA 5mC/5hmC da fase de descoberta utilizando sequenciação e qPCR para construir e validar um modelo preditivo de resposta à quimioterapia de primeira linha.
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Cohorte de Validação - PFS ≥ 12 Meses (Respondedor)
Cohorte de validação independente analisada com o ensaio EpiCORE baseado em qPCR para confirmar a precisão preditiva do biomarcador.
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Validação direcionada de marcadores cfDNA 5mC/5hmC da fase de descoberta utilizando sequenciação e qPCR para construir e validar um modelo preditivo de resposta à quimioterapia de primeira linha.
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Cohorte de Validação - PFS < 12 Meses (Não-respondente)
Cohorte de validação independente com PFS deficiente analisada para avaliar a especificidade e o desempenho do modelo.
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Validação direcionada de marcadores cfDNA 5mC/5hmC da fase de descoberta utilizando sequenciação e qPCR para construir e validar um modelo preditivo de resposta à quimioterapia de primeira linha.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Sobrevivência Livre de Progressão (SLP)
Prazo: Até 36 meses após o início da quimioterapia de primeira linha
|
A sobrevivência livre de progressão (PFS) é definida como o tempo desde o início da quimioterapia de primeira linha (FOLFOX ou FOLFIRI) até à data de progressão documentada da doença ou morte por qualquer causa, o que ocorrer primeiro. O objetivo principal do estudo EpiCORE é avaliar se os perfis de biomarcadores baseados em cfDNA 5mC/5hmC (painel EpiCORE) estão associados a diferenças na PFS entre doentes com cancro colorretal metastático (mCRC). |
Até 36 meses após o início da quimioterapia de primeira linha
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Sobrevivência Global (OS):
Prazo: Até 60 meses após o início da quimioterapia de primeira linha
|
Tempo desde o início da quimioterapia até à morte por qualquer causa
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Até 60 meses após o início da quimioterapia de primeira linha
|
Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
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Investigadores
- Investigador principal: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical center
Publicações e links úteis
A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.
Publicações Gerais
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
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- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
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- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
21 de junho de 2024
Conclusão Primária (Estimado)
18 de junho de 2026
Conclusão do estudo (Estimado)
18 de junho de 2026
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
3 de novembro de 2025
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
3 de novembro de 2025
Primeira postagem (Estimado)
5 de novembro de 2025
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Estimado)
5 de novembro de 2025
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
3 de novembro de 2025
Última verificação
1 de novembro de 2025
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 23228/EpiCORE
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Descrição do plano IPD
Os dados recolhidos para o estudo serão disponibilizados a terceiros, incluindo dados de participantes anonimizados, na data de publicação, através de um acordo de acesso a dados assinado e mediante a aprovação discricionária dos investigadores sobre a utilização proposta desses dados.
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .
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