- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT07224815
cfDNA 5mC/5hmC-biomarkører til at forudsige kemoterapiens respons ved metastatisk kolorektal cancer (EpiCORE)
Udvikling af et cfDNA 5mC/5hmC-baseret epigenetisk biomarkørpanel til at forudsige kemoterapi-effektivitet ved metastatisk kolorektalkræft
EpiCORE-studiet har til formål at identificere cfDNA-baserede epigenetiske markører, der kan forudsige respons på første-linjes kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) ved metastatisk kolorektal cancer (mCRC).
Ved at integrere 5-methylcytosin (5mC) og 5-hydroxymethylcytosin (5hmC) profilering sigter denne studie efter at etablere en ikke-invasiv biomarkørpanel, der kan skelne respondenter fra ikke-respondenter.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
På trods af introduktionen af multi-agent kemoterapiregimer såsom FOLFOX (5-FU, leucovorin, oxaliplatin) og FOLFIRI (5-FU, leucovorin, irinotecan) forbliver behandlingsresultaterne ved metastatisk kolorektal cancer (mCRC) meget variable.
Nuværende prædiktive biomarkører, såsom RAS/BRAF-mutation eller mikrosatellitinstabilitet, formår ikke præcist at forudsige respons på cytotoksisk kemoterapi.
Ny evidence tyder på, at cfDNA-methylerings- (5mC) og hydroxymethyleringsmønstre (5hmC) afspejler tumorbiologi og lægemiddelfølsomhed, hvilket udgør en lovende vej for præcisionskemoterapi.
EpiCORE-studiet integrerer genome-wide 5mC/5hmC-sekventering og målrettede valideringsassays for at identificere og bekraefte epigenetiske determinanter for kemoterapiens effekt.
Opdagelsesfase: Genome-wide 5mC/5hmC-profiling af cfDNA fra patienter behandlet med første-linjes FOLFOX eller FOLFIRI for at identificere kandidatområder associeret med behandlingsrespons.
Træningsfase: Målrettet sekventering og modelkonstruktion baseret på kandidatloci.
Valideringsfase: qPCR-baseret testning for at bekræfte den prædiktive nøjagtighed af det endelige EpiCORE-panel.
Dette studie sigter mod at etablere en robust cfDNA-biomarkørramme for at forudsige og overvåge kemoterapirespons ved mCRC, hvilket bidrager til individuel terapeutisk beslutningstagning.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 6263598111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Studiesteder
-
-
California
-
Duarte, California, Forenede Stater, 91010
- Rekruttering
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Histologisk bekræftet metastatisk kolorektal adenokarcinom (mCRC).
- Har modtaget første-linjes kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI).
- Tilgængelighed af præ-behandlings serum- eller plasmaprøver til cfDNA 5mC/5hmC-analyse.
- Dokumenteret radiologisk eller klinisk responsvurdering (RECIST 1.1 eller PFS-baseret).
- RAS/BRAF-mutationsstatus tilgængelig.
Eksklusionskriterier:
- Utilstrækkelig cfDNA-udbytte eller dårlig DNA-kvalitet.
- Ikke-adenokarcinom histologi.
- Aktiv inflammatorisk eller autoimmun sygdom, der kan ændre cfDNA-methylering.
- Samtidig malignitet, der kræver systemisk behandling.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Discovery-kohorte - PFS ≥ 12 måneder (Responder)
Patienter med mCRC, der opnåede progressionsfri overlevelse ≥ 12 måneder efter første linjes kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI). cfDNA 5mC/5hmC-sekventering udført for at identificere epigenetiske determinanter for vedvarende respons. |
Genomomspændende profilering af cfDNA-methylering og hydroxymethylering fra præbehandlingsplasma for at identificere molekylære determinanter associeret med kemoterapiens effektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Opdagelseskohort - PFS < 12 måneder (Ikke-svarer)
Patienter med progressionsfri overlevelse < 12 måneder efter første linjes kemoterapi. Sammenlignet med respondenter for at identificere epigenetiske træk associeret med resistens. |
Genomomspændende profilering af cfDNA-methylering og hydroxymethylering fra præbehandlingsplasma for at identificere molekylære determinanter associeret med kemoterapiens effektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Træningskohorte - PFS ≥ 12 måneder (Responder)
Uafhængig mCRC-kohorte med lang PFS (≥12 mdr.).
Målt sekventering (EpiCORE-test) til forfinelse af prædiktive markører.
|
Målrettet validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører fra opdagelsesfasen ved brug af sekventering og qPCR til at bygge og validere en prædiktiv model for første-linje kemoterapirespons.
|
|
Træningskohorte - PFS < 12 måneder (Non-Responder)
Uafhængig mCRC-kohorte med kort PFS (<12 mdr.).
Målsat sekventering til validering af resistens-associerede markører.
|
Målrettet validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører fra opdagelsesfasen ved brug af sekventering og qPCR til at bygge og validere en prædiktiv model for første-linje kemoterapirespons.
|
|
Valideringskohort - PFS ≥ 12 måneder (Responder)
Uafhængig valideringskohorte analyseret med qPCR-baseret EpiCORE-test for at bekræfte biomarkørens prædiktive nøjagtighed.
|
Målrettet validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører fra opdagelsesfasen ved brug af sekventering og qPCR til at bygge og validere en prædiktiv model for første-linje kemoterapirespons.
|
|
Valideringskohort - PFS < 12 måneder (Non-Responder)
Uafhængig valideringskohorte med dårlig PFS analyseret for at vurdere specificitet og modelydelse.
|
Målrettet validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører fra opdagelsesfasen ved brug af sekventering og qPCR til at bygge og validere en prædiktiv model for første-linje kemoterapirespons.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Progressionsfri overlevelse (PFS)
Tidsramme: Op til 36 måneder fra starten af første-linje kemoterapi
|
Progressionfri overlevelse (PFS) defineres som tiden fra starten af første-linje kemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) til datoen for dokumenteret sygdomsprogression eller død af enhver årsag, alt efter hvad der indtræffer først. Den primære målsetning med EpiCORE-studiet er at evaluere, om cfDNA 5mC/5hmC-baserede biomarkørprofiler (EpiCORE-panelet) er associeret med forskelle i PFS blandt patienter med metastatisk kolorektal cancer (mCRC). |
Op til 36 måneder fra starten af første-linje kemoterapi
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet overlevelse (OS):
Tidsramme: Op til 60 måneder fra starten af første-linje kemoterapi
|
Tid fra kemoterapi-start til død af enhver årsag
|
Op til 60 måneder fra starten af første-linje kemoterapi
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 23228/EpiCORE
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med CRC (kolorektal cancer)
-
Stingray TherapeuticsRekrutteringRefractory Metastatic Microsatellite Stabil Colorectal Cancer (MSS-CRC)Forenede Stater
-
Hansoh BioMedical R&D CompanyRekruttering
-
Shanghai Henlius BiotechIkke rekrutterer endnu
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
NGM Biopharmaceuticals, IncTrukket tilbage
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
Chang Gung Memorial HospitalFBD Biologics LimitedRekruttering
-
Chinese University of Hong KongTrukket tilbage
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
Kliniske forsøg med cfDNA 5mC/5hmC-sekventering (EpiCORE opdagelsesfase)
-
City of Hope Medical CenterRekrutteringCRC (kolorektal cancer)Forenede Stater