cfDNA 5mC/5hmC biomarkører for å forutsi kjemoterapirespons ved metastatisk tykktarmskreft (EpiCORE)
6. juli 2026 oppdatert av: City of Hope Medical Center
Utvikling av et epigenetisk biomarkørpanel basert på cfDNA 5mC/5hmC for å forutsi kjemoterapiens effektivitet ved metastatisk tykktarmskreft
EpiCORE-studiet har som mål å identifisere cfDNA-baserte epigenetiske markører som kan forutsi respons på første-linje kjemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) ved metastatisk kolorektalkreft (mCRC).
Ved å integrere 5-metylcytosin (5mC) og 5-hydroksymetylcytosin (5hmC) profilering, søker denne studien å etablere en ikke-invasiv biomarkørpanel som kan skille respondenter fra ikke-respondenter.
Studieoversikt
Status
Rekruttering
Forhold
Detaljert beskrivelse
Til tross for innføringen av multiagent-kjemoterapiregimer som FOLFOX (5-FU, leukovorin, oksaliplatin) og FOLFIRI (5-FU, leukovorin, irinotekan), forblir behandlingsresultatene ved metastatisk kolorektalkreft (mCRC) svært variable.
Nåværende prediktive biomarkører, som RAS/BRAF-mutasjon eller mikrosatellitt-instabilitet, klarer ikke å nøyaktig forutsi respons på cytotoksisk kjemoterapi.
Ny forskning tyder på at cfDNA-metylerings- (5mC) og hydroksy-metyleringsmønstre (5hmC) reflekterer tumorbiologi og legemiddelfølsomhet, og tilbyr en lovende retning for presisjons-kjemoterapi.
EpiCORE-studien integrerer genomvid 5mC/5hmC-sekvensering og målrettede valideringsanalyser for å identifisere og bekrefte epigenetiske determinanter for kjemoterapieffekt.
Oppdagelsesfase: Genome-wide 5mC/5hmC-profilering av cfDNA fra pasienter behandlet med første-linjers FOLFOX eller FOLFIRI for å identifisere kandidatregioner assosiert med behandlingsrespons.
Treningfase: Målrettet sekvensering og modellkonstruksjon basert på kandidatloci.
Valideringsfase: qPCR-basert testing for å bekrefte prediktiv nøyaktighet av det ferdige EpiCORE-panelet.
Denne studien tar sikte på å etablere et robust cfDNA-biomarkørrammeverk for å forutsi og overvåke kjemoterapirespons i mCRC, og bidra til individualisert terapeutisk beslutningstaking.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
600
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
- Navn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 6263598111
- E-post: ajgoel@coh.org
Studiesteder
-
-
California
-
Duarte, California, Forente stater, 91010
- Rekruttering
- City of Hope Medical Center
-
Ta kontakt med:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-post: ajgoel@coh.org
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Nei
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Pasienter diagnostisert med stadium IV kolorektal adenokarcinom som har mottatt første-linje FOLFOX- eller FOLFIRI-kjemoterapi og har tilgjengelige pre-behandling serum- eller plasmaprøver for cfDNA-analyse.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Histologisk bekreftet metastatisk kolorektal adenokarcinom (mCRC).
- Har mottatt første-linjeskjemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI).
- Tilgjengelighet av pre-behandlings serum- eller plasmaprøver for cfDNA 5mC/5hmC-analyse.
- Dokumentert radiologisk eller klinisk responsvurdering (RECIST 1.1 eller PFS-basert).
- RAS/BRAF-mutasjonsstatus tilgjengelig.
Eksklusjonskriterier:
- Utilstrekkelig cfDNA-utbytte eller dårlig DNA-kvalitet.
- Ikke-adenokarcinom histologi.
- Aktiv inflammatorisk eller autoimmun sykdom som kan endre cfDNA-metrylering.
- Samtidig malignitet som krever systemisk behandling.
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Oppdagelseskohort - PFS ≥ 12 Måneder (Responder)
Pasienter med mCRC som oppnådde progresjonsfri overlevelse ≥ 12 måneder etter førstelinjekjemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI). cfDNA 5mC/5hmC-sekvensering utført for å identifisere epigenetiske determinanter for varig respons. |
Genomvidde profilering av cfDNA-metylering og hydroksymetylering fra pre-behandlingsplasma for å identifisere molekylære determinanter assosiert med kjemoterapi-effektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Oppdagelseskohort - PFS < 12 måneder (Ikke-svarer)
Pasienter med progresjonsfri overlevelse < 12 måneder etter første linje kjemoterapi. Sammenlignet med respondenter for å identifisere epigenetiske trekk assosiert med resistens. |
Genomvidde profilering av cfDNA-metylering og hydroksymetylering fra pre-behandlingsplasma for å identifisere molekylære determinanter assosiert med kjemoterapi-effektivitet (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Treningskohort - PFS ≥ 12 måneder (Responder)
Uavhengig mCRC-kohort med lang PFS (≥12 mnd).
Målt sekvensering (EpiCORE-analyse) for å avgrense prediktive markører.
|
Målinrett validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører fra oppdagelsesfasen ved bruk av sekvensering og qPCR for å bygge og validere en prediktiv modell for respons på første-linjeskjemoterapi.
|
|
Treningkohort - PFS < 12 måneder (Ikke-responder)
Uavhengig mCRC-kohorte med kort PFS (<12 mnd).
Målt sekvensering for å validere resistensassosierte markører.
|
Målinrett validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører fra oppdagelsesfasen ved bruk av sekvensering og qPCR for å bygge og validere en prediktiv modell for respons på første-linjeskjemoterapi.
|
|
Valideringskohort - PFS ≥ 12 måneder (Responder)
Uavhengig valideringskohort analysert med qPCR-basert EpiCORE-test for å bekrefte biomarkørers prediktive nøyaktighet.
|
Målinrett validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører fra oppdagelsesfasen ved bruk av sekvensering og qPCR for å bygge og validere en prediktiv modell for respons på første-linjeskjemoterapi.
|
|
Valideringskohort - PFS < 12 måneder (Ikke-svarer)
Uavhengig valideringskohort med dårlig PFS analysert for å vurdere spesifisitet og modellytelse.
|
Målinrett validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører fra oppdagelsesfasen ved bruk av sekvensering og qPCR for å bygge og validere en prediktiv modell for respons på første-linjeskjemoterapi.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Progressjonsfri overlevelse (PFS)
Tidsramme: Opptil 36 måneder fra start av første linje kjemoterapi
|
Progressjonsfri overlevelse (PFS) er definert som tiden fra starten av første linjes kjemoterapi (FOLFOX eller FOLFIRI) til datoen for dokumentert sykdomsprogresjon eller død fra hvilken som helst årsak, avhengig av hva som inntreffer først. Hovedmålet med EpiCORE-studien er å vurdere om cfDNA 5mC/5hmC-baserte biomarkørprofiler (EpiCORE-panelet) er assosiert med forskjeller i PFS blant pasienter med metastatisk kolorektalkreft (mCRC). |
Opptil 36 måneder fra start av første linje kjemoterapi
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet overlevelse (OS):
Tidsramme: Opptil 60 måneder fra starten av første linje kjemoterapi
|
Tid fra start av kjemoterapi til død fra enhver årsak
|
Opptil 60 måneder fra starten av første linje kjemoterapi
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikasjoner og nyttige lenker
Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.
Generelle publikasjoner
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
21. juni 2024
Primær fullføring (Antatt)
18. juni 2028
Studiet fullført (Antatt)
18. juni 2028
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
3. november 2025
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
3. november 2025
Først lagt ut (Faktiske)
5. november 2025
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
7. juli 2026
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
6. juli 2026
Sist bekreftet
1. juli 2026
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 23228/EpiCORE
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
IPD-planbeskrivelse
Data som samles inn for studien vil bli gjort tilgjengelig for andre, inkludert anonymiserte deltakerdata, ved publisering, via en signert datatilgangsavtale og etter forskernes skjønn ved godkjenning av den foreslåtte bruken av slike data.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .