cfDNS 5mC/5hmC Biomarkerek a Kemoterápiás Válasz Előrejelzésére Metastatikus Vastagbélrákban (EpiCORE)
Metasztatikus vastag- és végbélrákban a kemoterápia hatékonyságának előrejelzésére szolgáló cfDNS 5mC/5hmC-alapú epigenetikai biomarkercsoport fejlesztése
Az EpiCORE tanulmány célja, hogy a metasztatikus vastagbélrákban (mCRC) az elsővonalbeli kemoterápiára (FOLFOX vagy FOLFIRI) adott választ előre jelezni képes, cfDNS-alapú epigenetikai markereket azonosítson.
A 5-metilcitozin (5mC) és 5-hidroximetilcitozin (5hmC) profilozás integrálásával ez a tanulmány olyan nem-invazív biomarkercsoport létrehozására törekszik, amely képes megkülönböztetni a válaszadókat a nem válaszadóktól.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Részletes leírás
A FOLFOX (5-FU, leucovorin, oxaliplatin) és FOLFIRI (5-FU, leucovorin, irinotekán) többkomponensű kemoterápiás protokollok bevezetése ellenére a metastatikus vastagbélrák (mCRC) kezelési eredményei továbbra is jelentősen változatosak.
A jelenlegi prediktív biomarkerek, mint például a RAS/BRAF mutáció vagy a mikroszatellita instabilitás, nem képesek pontosan előre jelezni a citotoxikus kemoterápiára adott választ.
Újabb bizonyítékok arra utalnak, hogy a cfDNS metilációs (5mC) és hidroximetilációs (5hmC) minták tükrözik a tumor biológiáját és a gyógyszerérzékenységet, így ígéretes lehetőséget kínálnak a precíziós kemoterápiára.
Az EpiCORE tanulmány a genom-szintű 5mC/5hmC szekvenálást és célzott validációs teszteket integrálja a kemoterápiás hatékonyság epigenetikai meghatározóinak azonosítására és megerősítésére.
Felfedezési fázis: A first-line FOLFOX vagy FOLFIRI kezelésben részesült betegek cfDNS-ének genom-szintű 5mC/5hmC profilozása a kezelési válasszal összefüggő jelölt régiók azonosításáért.
Tanuló fázis: Célzott szekvenálás és modellépítés a jelölt lokuszok alapján.
Validációs fázis: qPCR-alapú tesztelés a finalizált EpiCORE panel prediktív pontosságának megerősítésére.
Ez a tanulmány célul tűzi ki egy robusztus cfDNS biomarker keretrendszer létrehozását a kemoterápiás válasz előrejelzésére és monitorozására mCRC-ben, hozzájárulva az egyéni terápiás döntéshozatalhoz.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Ajay Goel, PhD
- Telefonszám: 6263598111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Tanulmányi helyek
-
-
California
-
Duarte, California, Egyesült Államok, 91010
- Toborzás
- City of Hope Medical Center
-
Kapcsolatba lépni:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonszám: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevonási kritériumok:
- Hisztológiailag igazolt metastatikus kolorektális adenocarcinoma (mCRC).
- Első vonalbeli kemoterápia (FOLFOX vagy FOLFIRI) részesült.
- Kezelés előtti szérum vagy plazma minták rendelkezésre állása cfDNS 5mC/5hmC analízishez.
- Dokumentált radiológiai vagy klinikai válaszértékelés (RECIST 1.1 vagy PFS alapján).
- RAS/BRAF mutációs státusz rendelkezésre áll.
Kizárási kritériumok:
- Nem megfelelő cfDNS mennyiség vagy rossz DNS minőség.
- Nem adenocarcinoma hisztológia.
- Aktív gyulladásos vagy autoimmun betegség, amely megváltoztathatja a cfDNS metilációt.
- Egyidejű malignitás, amely szisztémás kezelést igényel.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Felfedező Kohorsz - PFS ≥ 12 hónap (Válaszadó)
Azok a mCRC-s betegek, akik első vonalú kemoterápia (FOLFOX vagy FOLFIRI) után legalább 12 hónapos progressziómentes túlélést értek el. cfDNS 5mC/5hmC szekvenálást végeztek az tartós válasz epigenetikai meghatározóinak azonosítására. |
A kezelés előtti plazmából származó cfDNS metiláció és hidroximetiláció genomszintű profilozása a kemoterápia hatékonyságához kapcsolódó molekuláris meghatározók azonosítására (PFS ≥ 12 hónap vs < 12 hónap).
|
|
Felfedező Kohorsz - PFS < 12 Hónap (Nem Válaszoló)
Páciensek, akiknél a progressziómentes túlélés < 12 hónap az első vonalú kemoterápia után. Válaszadókkal összehasonlítva az epigenetikai jellemzők azonosítása érdekében, amelyek a rezisztenciához kapcsolódnak. |
A kezelés előtti plazmából származó cfDNS metiláció és hidroximetiláció genomszintű profilozása a kemoterápia hatékonyságához kapcsolódó molekuláris meghatározók azonosítására (PFS ≥ 12 hónap vs < 12 hónap).
|
|
Képzési Kohorsz - PFS ≥ 12 Hónap (Válaszadó)
Független mCRC kohorsz hosszú PFS-vel (≥12 hónap).
Célzott szekvenálás (EpiCORE teszt) a prediktív markerek finomításához.
|
A cfDNS 5mC/5hmC markerek célzott validálása a felfedezési fázisból szekvenálás és qPCR alkalmazásával egy prediktív modell felépítéséhez és validálásához az elsővonalas kemoterápiás válaszra.
|
|
Képzési Kohorsz - PFS < 12 Hónap (Nem Válaszoló)
Független mRKK kohorsz rövid PFS (<12 hónap) mellett.
Célzott szekvenálás a rezisztenciához kapcsolódó markerek validálására.
|
A cfDNS 5mC/5hmC markerek célzott validálása a felfedezési fázisból szekvenálás és qPCR alkalmazásával egy prediktív modell felépítéséhez és validálásához az elsővonalas kemoterápiás válaszra.
|
|
Validációs Kohorsz - PFS ≥ 12 Hónap (Válaszadó)
A prediktív biomarker pontosságának megerősítésére független validációs kohorsz került elemzésre qPCR-alapú EpiCORE teszteléssel.
|
A cfDNS 5mC/5hmC markerek célzott validálása a felfedezési fázisból szekvenálás és qPCR alkalmazásával egy prediktív modell felépítéséhez és validálásához az elsővonalas kemoterápiás válaszra.
|
|
Validációs Kohorsz - PFS < 12 Hónap (Nem Válaszoló)
Független validációs kohorsz a rossz PFS-vel elemzve a specifikitás és a modell teljesítményének felmérésére.
|
A cfDNS 5mC/5hmC markerek célzott validálása a felfedezési fázisból szekvenálás és qPCR alkalmazásával egy prediktív modell felépítéséhez és validálásához az elsővonalas kemoterápiás válaszra.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Progressziómentes Túlélés (PFS)
Időkeret: Legfeljebb 36 hónap az első vonalbeli kemoterápia kezdetétől
|
A progressziómentes túlélés (PFS) azt az időtartamot jelöli, amely a elsővonalbeli kemoterápia (FOLFOX vagy FOLFIRI) megkezdésétől a dokumentált betegségprogresszió vagy bármilyen okból bekövetkezett halál időpontjáig tart, attól függően, hogy melyik következik be először. Az EpiCORE tanulmány elsődleges célja annak értékelése, hogy a cfDNS 5mC/5hmC-alapú biomarkerkritériumok (EpiCORE panel) összefüggést mutatnak-e a progressziómentes túlélés (PFS) különbségeivel a metastatikus vastagbélrákkal (mCRC) élő betegek között. |
Legfeljebb 36 hónap az első vonalbeli kemoterápia kezdetétől
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Összes túlélés (OS):
Időkeret: Legfeljebb 60 hónap az első vonalbeli kemoterápia megkezdésétől
|
Az idő a kemoterápia megkezdésétől bármely okból bekövetkezett halálig
|
Legfeljebb 60 hónap az első vonalbeli kemoterápia megkezdésétől
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 23228/EpiCORE
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
IPD terv leírása
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .