cfDNA 5mC/5hmC biomarkkerit kemoterapian vastauksen ennustamiseen etäpesäkkeisessä paksusuolen syövässä (EpiCORE)
maanantai 3. marraskuuta 2025 päivittänyt: City of Hope Medical Center
Kehitys cfDNA 5mC/5hmC-pohjaisesta epigeneettisestä biomarkkeripaneelista kemoterapian tehon ennustamiseksi etäpesäkkeistä levänneessä paksusuolen syövässä
EpiCORE-tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa cfDNA-pohjaiset epigeneettiset merkit, jotka ennustavat vastetta ensimmäisen linjan kemoterapiaan (FOLFOX tai FOLFIRI) etäpesäkkeisessä paksusuolen syövässä (mCRC).
Integroimalla 5-metyylisytosiinin (5mC) ja 5-hydroksimetyylisytosiinin (5hmC) profilointi tämä tutkimus pyrkii luomaan ei-invasiivisen biomarkkeripaneelin, joka kykenee erottamaan vastaajia ei-vastaajista.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Huolimatta monilääkekemoterapiaregimien, kuten FOLFOX (5-FU, leukovoriini, oksaliplatiini) ja FOLFIRI (5-FU, leukovoriini, irinotekaani), käyttöönotosta, etäpesäkkeisen paksusuolen syövän (mCRC) hoidon tulokset vaihtelevat edelleen suuresti.
Nykyiset ennustavat biomarkkerit, kuten RAS/BRAF-mutaatiot tai mikrosatelliitti-epästabiilisuus, eivät pysty ennustamaan tarkasti vastetta sytotoksiseen kemoterapiaan.
Kasvava näyttö viittaa siihen, että cfDNA-metylaation (5mC) ja hydroksimetylaation (5hmC) mallit heijastavat kasvainbiologiaa ja lääkeherkkyyttä, tarjoten lupaavan tien tarkkuuskemoterapialle.
EpiCORE-tutkimus yhdistää genomilaajuiset 5mC/5hmC-sekvensoinnit ja kohdennetut validointimenetelmät tunnistaakseen ja vahvistaakseen kemoterapian tehon epigenettiset määrääjät.
Löytövaihe: Genomilaajuinen 5mC/5hmC-profilointi cfDNA:sta potilailta, joita hoidettiin ensimmäisen linjan FOLFOX- tai FOLFIRI-kemoterapialla, tunnistaakseen hoidon vastaukseen liittyvät kandidaattialueet.
Koulutusvaihe: Kohdennettu sekvensointi ja mallin rakentaminen kandidaattialueiden perusteella.
Validointivaihe: qPCR-pohjainen testaus vahvistaakseen valmiin EpiCORE-paneelin ennustetarkkuuden.
Tämän tutkimuksen tavoitteena on luoda vankka cfDNA-biomarkkerikehys etäpesäkkeisen paksusuolen syövän kemoterapiavasteen ennustamiseen ja seurantaan, edistäen yksilöllistä terapiapäätöksentekoa.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
600
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Ajay Goel, PhD
- Puhelinnumero: 6263598111
- Sähköposti: ajgoel@coh.org
Opiskelupaikat
-
-
California
-
Duarte, California, Yhdysvallat, 91010
- Rekrytointi
- City of Hope Medical center
-
Ottaa yhteyttä:
- Ajay Goel, PhD
- Puhelinnumero: 626-218-3452
- Sähköposti: AJGOEL@COH.ORG
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Potilaat, joilla on diagnosoitu IV-vaiheen kolorektaaliadenokarsinooma, jotka saivat ensimmäisen linjan FOLFOX- tai FOLFIRI-kemoterapiaa ja joilla on saatavilla ennen hoitoa otetut seerumi- tai plasmanäytteet cfDNA-analyysiä varten.
Kuvaus
Osallistumiskriteerit:
- Histologisesti vahvistettu etäpesäkkeinen kolorektaaliadenokarsinooma (mCRC).
- Saanut ensimmäisen linjan kemoterapiaa (FOLFOX tai FOLFIRI).
- Ennen hoitoa otettujen seerumi- tai plasmanäytteiden saatavuus cfDNA 5mC/5hmC-analyysiä varten.
- Dokumentoitu radiologinen tai kliininen vastearviointi (RECIST 1.1 tai PFS-pohjainen).
- RAS/BRAF-mutaatiotila saatavilla.
Poissulkemiskriteerit:
- Riittämätön cfDNA-tuotto tai huono DNA-laatu.
- Ei-adenokarsinooma histologia.
- Aktiivinen tulehduksellinen tai autoimmuunisairaus, joka voi muuttaa cfDNA-metylaatiota.
- Samanaikainen maligniteetti, joka vaatii systemaattista hoitoa.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Tutkimuskohortti - PFS ≥ 12 kuukautta (Vastaaja)
Potilailla, joilla on mCRC ja jotka saavuttivat etenevä tauti vapaana selviytymisen ≥ 12 kuukautta ensimmäisen linjan kemoterapian (FOLFOX tai FOLFIRI) jälkeen. cfDNA 5mC/5hmC sekvensointi suoritettiin tunnistamaan kestävän vastemuutoksen epigeneettiset tekijät. |
Genominlaajuinen cfDNA-metylaation ja hydroksimetylaation profilointi esihoidon plasmasta tunnistamaan kemoterapian tehoon liittyviä molekyylitason tekijöitä (PFS ≥ 12 kk vs < 12 kk).
|
|
Tutkimuskohortti - PFS < 12 kuukautta (Ei-vastaaja)
Potilaat, joiden tauti ei ole edennyt alle 12 kuukauden kuluttua ensimmäisen linjan kemoterapiasta. Verrattu vastaajiin tunnistaakseen vastustuskykyyn liittyviä epigeneettisiä piirteitä. |
Genominlaajuinen cfDNA-metylaation ja hydroksimetylaation profilointi esihoidon plasmasta tunnistamaan kemoterapian tehoon liittyviä molekyylitason tekijöitä (PFS ≥ 12 kk vs < 12 kk).
|
|
Koulutuskohortti - PFS ≥ 12 kuukautta (Vastaaja)
Riippumaton mCRC-kohortti pitkällä PFS:llä (≥12 kk).
Kohdennettu sekvensointi (EpiCORE-testi) ennustavien markkerien tarkentamiseksi.
|
Kohdennettu validaatio cfDNA 5mC/5hmC-merkkiaineista löytövaiheesta sekvensoinnilla ja qPCR:llä ennustavan mallin rakentamiseksi ja validoimiseksi ensimmäisen linjan kemoterapiavasteen ennustamiseksi.
|
|
Koulutusjoukkue - PFS < 12 kuukautta (ei-vastaaja)
Riippumaton mCRC-kohortti lyhyellä PFS:llä (<12 kk).
Kohdennettu sekvensointi resistenssiin liittyvien merkkiaineiden validoimiseksi.
|
Kohdennettu validaatio cfDNA 5mC/5hmC-merkkiaineista löytövaiheesta sekvensoinnilla ja qPCR:llä ennustavan mallin rakentamiseksi ja validoimiseksi ensimmäisen linjan kemoterapiavasteen ennustamiseksi.
|
|
Validaatiokohortti - PFS ≥ 12 Kuukautta (Vastaaja)
Riippumaton validointikohortti analysoitiin qPCR-pohjaisella EpiCORE-testillä vahvistamaan biomarkkerin ennustetarkkuus.
|
Kohdennettu validaatio cfDNA 5mC/5hmC-merkkiaineista löytövaiheesta sekvensoinnilla ja qPCR:llä ennustavan mallin rakentamiseksi ja validoimiseksi ensimmäisen linjan kemoterapiavasteen ennustamiseksi.
|
|
Validointikohortti - PFS < 12 kuukautta (ei-vastaaja)
Itsenäinen validointikohortti huonolla PFS:llä analysoitiin spesifisyyden ja mallin suorituskyvyn arvioimiseksi.
|
Kohdennettu validaatio cfDNA 5mC/5hmC-merkkiaineista löytövaiheesta sekvensoinnilla ja qPCR:llä ennustavan mallin rakentamiseksi ja validoimiseksi ensimmäisen linjan kemoterapiavasteen ennustamiseksi.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tautitaipumattomuusajan (PFS)
Aikaikkuna: Enintään 36 kuukautta ensimmäisen linjan kemoterapian aloittamisesta
|
Tautiin liittymätön elossaolo (PFS) määritellään ajanjaksona ensimmäisen linjan kemoterapian (FOLFOX tai FOLFIRI) aloittamisesta dokumentoituun taudin etenemiseen tai kuolemaan mistä tahansa syystä, kumpi tapahtuu ensin. EpiCORE-tutkimuksen päätavoitteena on arvioida, ovatko cfDNA 5mC/5hmC-pohjaiset biomarkkeriprofiilit (EpiCORE-paneeli) yhteydessä PFS-erioihin potilailla, joilla on etäpesäkkeinen paksu- ja peräsuolensyöpä (mCRC). |
Enintään 36 kuukautta ensimmäisen linjan kemoterapian aloittamisesta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kokonaiselossaolo (OS):
Aikaikkuna: Enintään 60 kuukautta ensimmäisen linjan kemoterapian aloittamisesta
|
Aika kemoterapian aloittamisesta kuolemaan mihin tahansa syyhyn
|
Enintään 60 kuukautta ensimmäisen linjan kemoterapian aloittamisesta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical center
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Perjantai 21. kesäkuuta 2024
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Torstai 18. kesäkuuta 2026
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Torstai 18. kesäkuuta 2026
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 3. marraskuuta 2025
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 3. marraskuuta 2025
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Keskiviikko 5. marraskuuta 2025
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvioitu)
Keskiviikko 5. marraskuuta 2025
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 3. marraskuuta 2025
Viimeksi vahvistettu
Lauantai 1. marraskuuta 2025
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 23228/EpiCORE
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
IPD-suunnitelman kuvaus
Tutkimusta varten kerättyjä tietoja, mukaan lukien anonymisoituja osallistujien tietoja, saatetaan muiden käyttöön julkaisun yhteydessä allekirjoitetun tietojen käyttösopimuksen kautta ja tutkijoiden harkinnan mukaan hyväksynnän perusteella ehdotetulle tiedon käytölle.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset CRC (kolorektaalisyöpä)
-
Hansoh BioMedical R&D CompanyRekrytointi
-
Shanghai Henlius BiotechEi vielä rekrytointia
-
Motus GI Medical Technologies LtdValmis
-
Motus GI Medical Technologies LtdValmis
-
National Cancer Institute (NCI)RekrytointiStage III Sinonasal Cancer AJCC v8 | Stage IVA Sinonasal Cancer AJCC v8 | Vaihe IVB Sinonasal Cancer AJCC v8 | Sinonasaalinen okasolusyöpäYhdysvallat
-
NGM Biopharmaceuticals, IncPeruutettu
-
Motus GI Medical Technologies LtdLopetettu
-
Chang Gung Memorial HospitalFBD Biologics LimitedRekrytointi
-
Chinese University of Hong KongPeruutettu
-
Motus GI Medical Technologies LtdValmis
Kliiniset tutkimukset cfDNA 5mC/5hmC Sekvensointi (EpiCORE Discovery Phase)
-
City of Hope Medical CenterRekrytointiCRC (kolorektaalisyöpä)Yhdysvallat