cfDNA 5mC/5hmC Biomarkers om Chemotherapierespons te Voorspellen bij Metastatisch Colorectaal Carcinoom (EpiCORE)
Ontwikkeling van een cfDNA 5mC/5hmC-gebaseerd epigenetisch biomarkerpanel om de werkzaamheid van chemotherapie bij gemetastaseerd colorectaal kanker te voorspellen
De EpiCORE-studie heeft als doel cfDNA-gebaseerde epigenetische markers te identificeren die voorspellend zijn voor de respons op eerstelijnschemotherapie (FOLFOX of FOLFIRI) bij gemetastaseerd colorectaal carcinoom (mCRC).
Door integratie van 5-methylcytosine (5mC) en 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) profilering, tracht deze studie een niet-invasieve biomarkerpanel te ontwikkelen dat in staat is respondenten van niet-respondenten te onderscheiden.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Ondanks de introductie van multi-agent chemotherapieregimes zoals FOLFOX (5-FU, leucovorine, oxaliplatin) en FOLFIRI (5-FU, leucovorine, irinotecan), blijven de behandelresultaten bij gemetastaseerd colorectaal carcinoom (mCRC) zeer variabel.
Huidige voorspellende biomarkers, zoals RAS/BRAF-mutaties of microsatellietinstabiliteit, slagen er niet in om de respons op cytotoxische chemotherapie nauwkeurig te voorspellen.
Opkomend bewijs suggereert dat cfDNA-methylatie (5mC) en hydroxymethylatie (5hmC) patronen de tumorbiologie en geneesmiddelgevoeligheid weerspiegelen, wat een veelbelovende weg biedt voor precisiechemotherapie.
De EpiCORE-studie integreert genoombrede 5mC/5hmC-sequencing en gerichte validatietesten om epigenetische determinanten van chemotherapie-effectiviteit te identificeren en te bevestigen.
Ontdekkingsfase: Genoombrede 5mC/5hmC-profielbepaling van cfDNA van patiënten behandeld met eerstelijns FOLFOX of FOLFIRI om kandidaatregio's geassocieerd met behandelrespons te identificeren.
Trainingsfase: Gerichte sequencing en modelconstructie gebaseerd op kandidaatloci.
Validatiefase: qPCR-gebaseerde testen om de voorspellende nauwkeurigheid van het gefinaliseerde EpiCORE-panel te bevestigen.
Deze studie heeft tot doel een robuust cfDNA-biomarkerraamwerk op te zetten voor het voorspellen en monitoren van chemotherapierespons bij mCRC, wat bijdraagt aan geïndividualiseerde therapeutische besluitvorming.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Ajay Goel, PhD
- Telefoonnummer: 6263598111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Studie Locaties
-
-
California
-
Duarte, California, Verenigde Staten, 91010
- Werving
- City of Hope Medical Center
-
Contact:
- Ajay Goel, PhD
- Telefoonnummer: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Insluitingscriteria:
- Histologisch bevestigd gemetastaseerd colorectaal adenocarcinoom (mCRC).
- Eerstelijns chemotherapie (FOLFOX of FOLFIRI) ontvangen.
- Beschikbaarheid van pre-behandeling serum- of plasma-monsters voor cfDNA 5mC/5hmC-analyse.
- Gedocumenteerde radiologische of klinische responsbeoordeling (RECIST 1.1 of PFS-gebaseerd).
- RAS/BRAF-mutatiestatus beschikbaar.
Uitsluitingscriteria:
- Onvoldoende cfDNA-opbrengst of slechte DNA-kwaliteit.
- Niet-adenocarcinoom histologie.
- Actieve inflammatoire of auto-immuunziekte die cfDNA-methylering kan beïnvloeden.
- Gelijktijdige maligniteit die systemische therapie vereist.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ontdekkingscohort - PFS ≥ 12 Maanden (Responder)
Patiënten met mCRC die een progressievrije overleving van ≥ 12 maanden bereikten na eerstelijnschemotherapie (FOLFOX of FOLFIRI). cfDNA 5mC/5hmC-sequencing uitgevoerd om epigenetische determinanten van duurzame respons te identificeren. |
Genoombrede profilering van cfDNA-methylering en hydroxymethylering uit pre-behandelingsplasma om moleculaire determinanten geassocieerd met chemotherapie-effectiviteit te identificeren (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Ontdekkingscohort - PFS < 12 maanden (Non-Responder)
Patiënten met progressievrije overleving < 12 maanden na eerstelijns chemotherapie. Vergeleken met responders om epigenetische kenmerken geassocieerd met resistentie te identificeren. |
Genoombrede profilering van cfDNA-methylering en hydroxymethylering uit pre-behandelingsplasma om moleculaire determinanten geassocieerd met chemotherapie-effectiviteit te identificeren (PFS ≥ 12M vs < 12M).
|
|
Trainingscohort - PFS ≥ 12 Maanden (Responder)
Onafhankelijke mCRC-cohort met lange PFS (≥12M).
Gerichte sequencing (EpiCORE-test) om voorspellende markers te verfijnen.
|
Gerichte validatie van cfDNA 5mC/5hmC markers uit de ontdekkingsfase met behulp van sequencing en qPCR om een voorspellend model voor respons op eerstelijns chemotherapie op te bouwen en te valideren.
|
|
Trainingscohort - PFS < 12 maanden (Non-Responder)
Onafhankelijke mCRC-cohort met korte PFS (<12M).
Gerichte sequencing om resistentie-geassocieerde markers te valideren.
|
Gerichte validatie van cfDNA 5mC/5hmC markers uit de ontdekkingsfase met behulp van sequencing en qPCR om een voorspellend model voor respons op eerstelijns chemotherapie op te bouwen en te valideren.
|
|
Validatiecohort - PFS ≥ 12 Maanden (Responder)
Onafhankelijke validatiecohort geanalyseerd met op qPCR gebaseerde EpiCORE-test om de voorspellende nauwkeurigheid van de biomarker te bevestigen.
|
Gerichte validatie van cfDNA 5mC/5hmC markers uit de ontdekkingsfase met behulp van sequencing en qPCR om een voorspellend model voor respons op eerstelijns chemotherapie op te bouwen en te valideren.
|
|
Validatiecohort - PFS < 12 Maanden (Non-Responder)
Onafhankelijke validatiecohort met slechte PFS geanalyseerd om specificiteit en modelprestaties te beoordelen.
|
Gerichte validatie van cfDNA 5mC/5hmC markers uit de ontdekkingsfase met behulp van sequencing en qPCR om een voorspellend model voor respons op eerstelijns chemotherapie op te bouwen en te valideren.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Progressievrije Overleving (PFS)
Tijdsspanne: Tot 36 maanden vanaf de start van eerstelijns chemotherapie
|
Progressievrije overleving (PFS) wordt gedefinieerd als de tijd vanaf het starten van eerstelijns chemotherapie (FOLFOX of FOLFIRI) tot de datum van gedocumenteerde ziekteprogressie of overlijden door welke oorzaak dan ook, afhankelijk van wat zich het eerst voordoet. Het primaire doel van de EpiCORE-studie is om te evalueren of cfDNA 5mC/5hmC-gebaseerde biomarkerprofielen (EpiCORE-panel) geassocieerd zijn met verschillen in PFS bij patiënten met gemetastaseerd colorectaal carcinoom (mCRC). |
Tot 36 maanden vanaf de start van eerstelijns chemotherapie
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Algehele Overleving (OS):
Tijdsspanne: Tot 60 maanden vanaf de start van de eerstelijns chemotherapie
|
Tijd vanaf start chemotherapie tot overlijden door welke oorzaak dan ook
|
Tot 60 maanden vanaf de start van de eerstelijns chemotherapie
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 23228/EpiCORE
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .