Биомаркеры 5-метилцитозина/5-гидроксиметилцитозина в циркулирующей ДНК для прогнозирования ответа на химиотерапию при метастатическом колоректальном раке (EpiCORE)
6 июля 2026 г. обновлено: City of Hope Medical Center
Разработка панели эпигенетических биомаркеров на основе 5mC/5hmC cfDNA для прогнозирования эффективности химиотерапии при метастатическом колоректальном раке
Исследование EpiCORE направлено на идентификацию эпигенетических маркеров на основе cfDNA, предсказывающих ответ на химиотерапию первой линии (FOLFOX или FOLFIRI) при метастатическом колоректальном раке (mCRC).
Интегрируя профилирование 5-метилцитозина (5mC) и 5-гидроксиметилцитозина (5hmC), это исследование стремится создать неинвазивную панель биомаркеров, способную отличать респондеров от нереспондеров.
Обзор исследования
Статус
Рекрутинг
Условия
Подробное описание
Несмотря на внедрение многокомпонентных режимов химиотерапии, таких как FOLFOX (5-ФУ, лейковорин, оксалиплатин) и FOLFIRI (5-ФУ, лейковорин, иринотекан), результаты лечения метастатического колоректального рака (мКРР) остаются крайне вариабельными.
Современные предиктивные биомаркеры, такие как мутации RAS/BRAF или микросателлитная нестабильность, не позволяют точно прогнозировать ответ на цитотоксическую химиотерапию.
Появляющиеся данные свидетельствуют о том, что паттерны метилирования (5mC) и гидроксиметилирования (5hmC) цфДНК отражают биологию опухоли и чувствительность к лекарствам, открывая перспективное направление для прецизионной химиотерапии.
Исследование EpiCORE интегрирует полногеномное секвенирование 5mC/5hmC и таргетные валидационные анализы для идентификации и подтверждения эпигенетических детерминант эффективности химиотерапии.
Фаза открытия: Полногеномное профилирование 5mC/5hmC цфДНК пациентов, получавших терапию первой линии FOLFOX или FOLFIRI, для выявления кандидатных регионов, ассоциированных с ответом на лечение.
Фаза обучения: Таргетное секвенирование и построение модели на основе кандидатных локусов.
Фаза валидации: Тестирование на основе ПЦР в реальном времени для подтверждения прогностической точности финализированной панели EpiCORE.
Данное исследование направлено на создание надежной системы биомаркеров цфДНК для прогнозирования и мониторинга ответа на химиотерапию при мКРР, способствуя индивидуализированному принятию терапевтических решений.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
600
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Ajay Goel, PhD
- Номер телефона: 6263598111
- Электронная почта: ajgoel@coh.org
Места учебы
-
-
California
-
Duarte, California, Соединенные Штаты, 91010
- Рекрутинг
- City of Hope Medical Center
-
Контакт:
- Ajay Goel, PhD
- Номер телефона: 626-218-3452
- Электронная почта: ajgoel@coh.org
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты с диагнозом аденокарциномы толстой кишки IV стадии, которые получали химиотерапию первой линии FOLFOX или FOLFIRI и имели доступные предлечебные образцы сыворотки или плазмы для анализа цфДНК.
Описание
Критерии включения:
- Гистологически подтвержденная метастатическая аденокарцинома толстой кишки (mCRC).
- Получение химиотерапии первой линии (FOLFOX или FOLFIRI).
- Наличие предлечебных образцов сыворотки или плазмы для анализа cfDNA 5mC/5hmC.
- Документированная рентгенологическая или клиническая оценка ответа (RECIST 1.1 или на основе PFS).
- Доступный статус мутации RAS/BRAF.
Критерии исключения:
- Недостаточный выход cfDNA или плохое качество ДНК.
- Неаденокарциномная гистология.
- Активное воспалительное или аутоиммунное заболевание, которое может изменить метилирование cfDNA.
- Сопутствующее злокачественное новообразование, требующее системной терапии.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Когорта открытия - БПВ ≥ 12 месяцев (Ответившие)
Пациенты с метастатическим колоректальным раком (мКРР), достигшие беспрогрессивной выживаемости ≥ 12 месяцев после химиотерапии первой линии (FOLFOX или FOLFIRI). Проведено секвенирование 5mC/5hmC cfDNA для выявления эпигенетических детерминант устойчивого ответа. |
Геномное профилирование метилирования и гидроксиметилирования cfDNA из плазмы до лечения для выявления молекулярных детерминант, связанных с эффективностью химиотерапии (ВБП ≥ 12 мес. против < 12 мес.).
|
|
Когорта открытия - БПВ < 12 месяцев (Нереспондер)
Пациенты с беспрогрессивной выживаемостью < 12 месяцев после химиотерапии первой линии. Сравнение с респондентами для выявления эпигенетических особенностей, связанных с резистентностью. |
Геномное профилирование метилирования и гидроксиметилирования cfDNA из плазмы до лечения для выявления молекулярных детерминант, связанных с эффективностью химиотерапии (ВБП ≥ 12 мес. против < 12 мес.).
|
|
Учебная когорта - ВБП ≥ 12 месяцев (Респондер)
Независимая когорта mCRC с длительной ВБП (≥12 мес.).
Таргетное секвенирование (анализ EpiCORE) для уточнения прогностических маркеров.
|
Целевая валидация маркеров cfDNA 5mC/5hmC из фазы открытия с использованием секвенирования и qPCR для построения и валидации прогностической модели ответа на терапию первой линии химиотерапии.
|
|
Обучающая когорта - БПВ < 12 месяцев (Нереспондер)
Независимая когорта с метастатическим колоректальным раком (мКРР) с короткой ВБП (<12 мес.).
Таргетное секвенирование для валидации маркеров, ассоциированных с резистентностью.
|
Целевая валидация маркеров cfDNA 5mC/5hmC из фазы открытия с использованием секвенирования и qPCR для построения и валидации прогностической модели ответа на терапию первой линии химиотерапии.
|
|
Валидационная когорта - ВБП ≥ 12 месяцев (Респондер)
Независимая валидационная когорта проанализирована с помощью qPCR-теста EpiCORE для подтверждения прогностической точности биомаркера.
|
Целевая валидация маркеров cfDNA 5mC/5hmC из фазы открытия с использованием секвенирования и qPCR для построения и валидации прогностической модели ответа на терапию первой линии химиотерапии.
|
|
Валидационная Когорта - БПЖ < 12 Месяцев (Неответик)
Независимая когорта валидации с плохой выживаемостью без прогрессирования (PFS) проанализирована для оценки специфичности и производительности модели.
|
Целевая валидация маркеров cfDNA 5mC/5hmC из фазы открытия с использованием секвенирования и qPCR для построения и валидации прогностической модели ответа на терапию первой линии химиотерапии.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Беспрогрессивная выживаемость (PFS)
Временное ограничение: До 36 месяцев с начала химиотерапии первой линии
|
Беспрогрессивная выживаемость (PFS) определяется как время от начала химиотерапии первой линии (FOLFOX или FOLFIRI) до даты документально подтвержденного прогрессирования заболевания или смерти от любой причины, в зависимости от того, что наступит раньше. Основная цель исследования EpiCORE — оценить, связаны ли профили биомаркеров на основе cfDNA 5mC/5hmC (панель EpiCORE) с различиями в PFS у пациентов с метастатическим колоректальным раком (mCRC). |
До 36 месяцев с начала химиотерапии первой линии
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общая выживаемость (ОВ):
Временное ограничение: До 60 месяцев с начала химиотерапии первой линии
|
Время от начала химиотерапии до смерти от любой причины
|
До 60 месяцев с начала химиотерапии первой линии
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Molenaar IQ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, Lopez-Yurda M, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Study Group. First-line systemic treatment strategies in patients with initially unresectable colorectal cancer liver metastases (CAIRO5): an open-label, multicentre, randomised, controlled, phase 3 study from the Dutch Colorectal Cancer Group. Lancet Oncol. 2023 Jul;24(7):757-771. doi: 10.1016/S1470-2045(23)00219-X. Epub 2023 Jun 14.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Nelson MA, Shetty S, Kulakodlu M, Harley C, Seal B. A comparison of mortality and costs associated with FOLFOX versus FOLFIRI in stage IV colorectal cancer. J Med Econ. 2011;14(2):179-86. doi: 10.3111/13696998.2011.556693. Epub 2011 Feb 14.
- Bond MJG, Bolhuis K, Loosveld OJL, de Groot JWB, Droogendijk H, Helgason HH, Hendriks MP, Klaase JM, Kazemier G, Liem MSL, Rijken AM, Verhoef C, de Wilt JHW, de Jong KP, Gerhards MF, van Amerongen MJ, Engelbrecht MRW, van Lienden KP, Hermans JJ, Molenaar IQ, Grunhagen DJ, de Valk B, Haberkorn BCM, Kerver ED, Erdkamp F, van Alphen RJ, Mathijssen-van Stein D, Komurcu A, May AM, Swijnenburg RJ, Punt CJA; Dutch Colorectal Cancer Group. First-Line Systemic Treatment for Initially Unresectable Colorectal Liver Metastases: Post Hoc Analysis of the CAIRO5 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2025 Jan 1;11(1):36-45. doi: 10.1001/jamaoncol.2024.5174.
- Neugut AI, Lin A, Raab GT, Hillyer GC, Keller D, O'Neil DS, Accordino MK, Kiran RP, Wright J, Hershman DL. FOLFOX and FOLFIRI Use in Stage IV Colon Cancer: Analysis of SEER-Medicare Data. Clin Colorectal Cancer. 2019 Jun;18(2):133-140. doi: 10.1016/j.clcc.2019.01.005. Epub 2019 Jan 31.
- Gibbons CE, Khan F. Dysphagia--a presenting symptom of forestier disease. J R Army Med Corps. 1996 Feb;142(1):32-3. doi: 10.1136/jramc-142-01-07.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
21 июня 2024 г.
Первичное завершение (Оцененный)
18 июня 2028 г.
Завершение исследования (Оцененный)
18 июня 2028 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
3 ноября 2025 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
3 ноября 2025 г.
Первый опубликованный (Действительный)
5 ноября 2025 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
7 июля 2026 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
6 июля 2026 г.
Последняя проверка
1 июля 2026 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Новообразования по локализации
- Новообразования
- Кишечные заболевания
- Желудочно-кишечные новообразования
- Новообразования пищеварительной системы
- Заболевания пищеварительной системы
- Желудочно-кишечные заболевания
- Новообразования кишечника
- Заболевания прямой кишки
- Заболевания толстой кишки
- Колоректальные новообразования
Другие идентификационные номера исследования
- 23228/EpiCORE
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Описание плана IPD
Собранные для исследования данные будут предоставлены другим лицам, включая обезличенные данные участников, после публикации, посредством подписанного соглашения о доступе к данным и по усмотрению исследователей, утверждающих предложенное использование таких данных.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .