TECHNIKA KVANTIFIKACE DNA JAKO INTERPRETAČNÍ NÁSTROJ U MITOCHONDRIÁLNÍCH ONEMOCNĚNÍ
IMPLEMENTACE TECHNIKY KVANTIFIKACE DNA JEDNOHO SVALOVÉHO VLÁKNA JAKO INTERPRETAČNÍHO NÁSTROJE PRO VARIANTY NEZNÁMÉ SLUŽBY U MITOCHONDRIÁLNÍCH ONEMOCNĚNÍ
2622/5000 Mitochondriální onemocnění (MM) jsou nejčastější metabolická onemocnění. Protože tyto patologické stavy jsou z klinického hlediska velmi heterogenní, diagnózu potvrzuje pouze identifikace mutací v jaderných genech nebo mitochondriální DNA.
Úplná studie mtDNA pomocí vysoce výkonného sekvenování (NGS) je prvním krokem v diagnostickém přístupu. Nedávné zavedení této revoluční nové technologie výrazně zvýšilo účinnost identifikace mutací. Kromě známých patogenních mutací však NGS odhaluje četné varianty, jejichž význam je v současné době neznámý. Hlavním problémem pro získání spolehlivé diagnózy je proto interpretace klinického dopadu těchto nových vzácných variant, která se ukazuje jako velmi obtížná.
Kritéria patogenity umožňují klasifikaci variant od benigních po patogenní. Jedním z hlavních kritérií patogenity je dobrá korelace heteroplazmatické úrovně s tkáňovým nebo buněčným postižením. Mutace mtDNA jsou obecně heteroplazmatické, což odpovídá koexistenci normálních a mutovaných molekul ve stejné buňce nebo tkáni, přičemž nejvíce postižené tkáně mají vysokou míru mutací. Na svalové biopsii postiženého pacienta vlákna často vykazují deficit enzymu v cytochrom c oxidáze (COX-negativní), což lze prokázat imunohistochemicky. Studie jednoho vlákna umožňuje izolovat deficitní vlákna a kvantifikovat heteroplazmatickou rychlost varianty. Přítomnost vysoké hladiny heteroplazmy v COX-negativních vláknech, na rozdíl od vláken bez deficitu, je silným argumentem ve prospěch patogenity této varianty. V současné době se tato technika nepoužívá běžně v diagnostických laboratořích, ale pouze příležitostně ve výzkumném rámci v některých laboratořích. Jde o náročnou techniku, která sestává z první fáze laserové mikrodisekce různých svalových vláken, po níž následuje druhý krok kvantifikace varianty z každého vlákna. Tento druhý krok vyžaduje specifické zaměření pro každou identifikovanou variantu.
Cílem této pilotní studie je vyvinout novou techniku pro kvantifikaci jednovláknových heteroplazmik izolovaných NGS laserovou mikrodisekcí. To, nezávisle na typu varianty, zabrání zdlouhavým a nákladným úpravám požadovaným pro každou nově identifikovanou variantu, a usnadní tak její použití.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Fáze
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Cécile ROUZIER
- Telefonní číslo: 33 4 92 03 62 43
- E-mail: rouzier.c@chu-nice.fr
Studijní místa
-
-
-
Nice, Francie, 06200
- CHU de Nice
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Popis
Kritéria pro zařazení:
- obecná kritéria: větší nebo menší pacienti, sporadické nebo izolované případy
- Kritéria související s patologií:
- Podezření na mitochondriální patologii, která bude hodnocena podle následujících kritérií (odbornost lékaře referenčního centra MM):
Klinický obraz naznačující mitochondriální patologii ("nelegitimní spojení" symptomů, specifický syndrom typu MELAS, např. svalový deficit, ptóza...) A/NEBO
- Metabolické hodnocení svědčící pro postižení dýchacího traktu A/NEBO
- Identifikace nedostatku zahrnujícího jeden nebo více komplexů dýchacího řetězce ze svalového vzorku
- Přítomnost na histologické analýze svalové biopsie COX-negativních vláken
- podepsání informovaného souhlasu pro nezletilé pacienty podepsaného alespoň jedním z rodičů nebo zástupcem rodičovské autority
Kritéria vyloučení:
- Osoby zbavené svobody soudním nebo správním rozhodnutím;
- Osoby hospitalizované bez souhlasu;
- Osoby přijaté do zdravotnického nebo sociálního zařízení pro jiné účely než pro výzkum;
- Osoby zletilé, které jsou pod ochranou nebo které nejsou schopny vyjádřit svůj souhlas. Neschopnost spolupracovat.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Základní věda
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Počet zbraní
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / ArmSkupina účastníků / Arm |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Jiný: biologické vzorky
biologické vzorky na pacientech s MITOCHONDRIÁLNÍMI ONEMOCNĚNÍMI
|
Vzorky krve, ústní stěr a moč
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
počet zesílení technikou NGS
Časové okno: 36 měsíců
|
36 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
srovnání počtu amplifikace mezi technikou NGS a technikou PCR-RFLP
Časové okno: 36 měsíců
|
36 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 16-AOIP-04
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .