Validace laboratorních technik, strategií a typů vzorků pro epidemiologickou kontrolu v pandemii Covid-19
Validace laboratorních technik, strategií a typů vzorků pro epidemiologickou kontrolu v pandemii Covid-19, Tarija-Bolívie
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Tarija, Bolívie, 00000
- Universidad Autónoma Juan Misael Saracho
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Symptomatické: Subjekty se známkami a symptomy infekce dýchacích cest kratšími nebo rovnými 3 dnům, nejlépe s klinickou a molekulární diagnózou kompatibilní s Covid-19.
- Asymptomatici: Osoby, které byly v přímém kontaktu s nakaženými lidmi a nevykazovaly žádné příznaky související s Covid-19.
- Negativní: Jedinci s negativním RT-PCR testem na SARS-CoV-2 (referenční test), u kterých se sedm dní před odběrem neprojevily žádné příznaky.
Kritéria vyloučení:
- Dospělí mladší 21 let nebo starší 65 let
- Subjekty s klinickou anamnézou autoimunitního onemocnění nebo chemoterapie.
- Subjekty, které dostaly transfuze nebo rekonvalescentní plazmu v posledním měsíci před zařazením.
- Subjekty s předchozí diagnózou jiných infekčních onemocnění, jako je, ale bez omezení, AIDS, hepatitida B nebo C, tuberkulóza nebo jakákoli jiná probíhající nebo nevyřešená onemocnění.
- Subjekty s malformací nebo onkologickou patologií horních cest dýchacích, které mohou bránit odběru vzorků, včetně, ale bez omezení, odchylky septa, alergické rýmy.
- Subjekty, které nepodepsaly nebo nemohou podepsat formulář informovaného souhlasu
- Subjekty nejsou schopny poskytnout své úplné informace nebo přístup ke své klinické anamnéze.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Dobrovolní účastníci
Vzorky dobrovolných účastníků budou odebrány po informovaném souhlasu a budou klasifikovány jako symptomatické, asymptomatické a negativní.
|
RT-PCR (zlatý standard): Testování PCR v reálném čase s reverzní transkriptázou (RT-PCR).
Test sestává z polymerázové řetězové reakce, která dříve měla fázi reverzní transkripce, RT.
Tento test umožňuje získat cADN (komplementární DNA) z řetězce RNA.
Tato technika umožňuje detekci a amplifikaci sekvence z řetězce RNA.
Ostatní jména:
LAMP: Technika LAMP, stejně jako PCR, má schopnost amplifikovat specifické fragmenty DNA (cílovou sekvenci), což umožňuje vysoce citlivou detekci patogenů.
Na rozdíl od pcr vyžaduje LAMP 4 až 6 podavačů, externích podavačů F3 a B3, které hybridizují s vnějšími oblastmi cílové sekvence, zatímco vnitřní FIP a BIP mají sekvence oběma způsoby, které umožňují vytvoření smyčky.
Reakce LAMP je izotermická, tj. probíhá při jediné teplotě.
LAMP se úspěšně používá k detekci virových onemocnění a také virových patogenů, jako je mimo jiné West Nile virus, TMR-1, Norovirus, ptačí chřipka, slintavka a kulhavka, klasický mor prasat.
Ostatní jména:
POOL RT-PCR: Tento test má za cíl smíchat v jediném vzorku extrakty získané od několika lidí.
Společný vzorek je vyhodnocen, a pokud je negativní, má se za to, že všechny jsou bez COVID-19; pokud je pozitivní, použije se k detekci postižené osoby systém pole.
To znamená, že jedna PCR (polymerázová řetězová reakce), diagnostický test používaný k detekci virového patogenu se aplikuje na skupinu a v případě pozitivního výsledku se individuálně opakuje.
Ostatní jména:
BAZÉNOVÁ LAMPA: Jako test bazénu RT-PCR.
Tento test v podstatě zahrnuje smíchání extraktů získaných od několika lidí v jediném vzorku.
Tento společný vzorek je testován, a pokud je negativní, má se za to, že všichni jsou bez COVID-19; pokud je pozitivní, použije se k detekci postižené osoby systém pole.
To znamená: jedna LAMPA platí pro skupinu
Ostatní jména:
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Validace
Časové okno: 1 měsíc
|
Ověřte různé molekulární testy a strategie odběru vzorků a typů vzorků používané při epidemiologické kontrole diagnózy COVID-19 v Tarija v Bolívii.
|
1 měsíc
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
RT-PCR (sliny)
Časové okno: 1 týden
|
Ověřte použití molekulárního testování založeného na metodě PCR pomocí vzorků slin
|
1 týden
|
|
SVÍTILNA
Časové okno: 1 týden
|
Ověřte použití molekulárního testu založeného na metodě LAMP pomocí vzorků slin a nosohltanu
|
1 týden
|
|
POOL PCR
Časové okno: 1 týden
|
Ověřte použití molekulárních testů se strategií Pool PCR pomocí vzorků slin
|
1 týden
|
|
BAZÉNOVÁ LAMPA
Časové okno: 1 týden
|
Ověřte použití molekulárních testů se strategií Pool LAMP pomocí vzorků slin
|
1 týden
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Kenji Shoji, PhD, Galapagos NV
- Studijní židle: Rodrigo Arce Cardozo, MD, MPH, City University of New York, School of Public Health
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, Chen WH, Yin X. Rapid Detection of COVID-19 Coronavirus Using a Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Diagnostic Platform. Clin Chem. 2020 Jul 1;66(7):975-977. doi: 10.1093/clinchem/hvaa102. No abstract available.
- Kashir J, Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020 Aug;141:109786. doi: 10.1016/j.mehy.2020.109786. Epub 2020 Apr 25.
- Esbin MN, Whitney ON, Chong S, Maurer A, Darzacq X, Tjian R. Overcoming the bottleneck to widespread testing: a rapid review of nucleic acid testing approaches for COVID-19 detection. RNA. 2020 Jul;26(7):771-783. doi: 10.1261/rna.076232.120. Epub 2020 May 1.
- Chow FW, Chan TT, Tam AR, Zhao S, Yao W, Fung J, Cheng FK, Lo GC, Chu S, Aw-Yong KL, Tang JY, Tsang CC, Luk HK, Wong AC, Li KS, Zhu L, He Z, Tam EWT, Chung TW, Wong SCY, Que TL, Fung KS, Lung DC, Wu AK, Hung IF, Woo PC, Lau SK. A Rapid, Simple, Inexpensive, and Mobile Colorimetric Assay COVID-19-LAMP for Mass On-Site Screening of COVID-19. Int J Mol Sci. 2020 Jul 29;21(15):5380. doi: 10.3390/ijms21155380.
- Augustine R, Hasan A, Das S, Ahmed R, Mori Y, Notomi T, Kevadiya BD, Thakor AS. Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): A Rapid, Sensitive, Specific, and Cost-Effective Point-of-Care Test for Coronaviruses in the Context of COVID-19 Pandemic. Biology (Basel). 2020 Jul 22;9(8):182. doi: 10.3390/biology9080182.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- PROY - UAJMS001/2020
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Časový rámec sdílení IPD
Kritéria přístupu pro sdílení IPD
Typ podpůrných informací pro sdílení IPD
- PROTOKOL STUDY
- MÍZA
- ICF
- ANALYTIC_CODE
- CSR
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .