Validering af laboratorieteknikker, strategier og typer af prøver til epidemiologisk kontrol i Covid-19-pandemien
Validering af laboratorieteknikker, strategier og typer af prøver til epidemiologisk kontrol i Covid-19-pandemien, Tarija-Bolivia
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Tarija, Bolivia, 00000
- Universidad Autónoma Juan Misael Saracho
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Symptomatisk: Personer med tegn og symptomer på luftvejsinfektion mindre end eller lig med 3 dage, fortrinsvis med klinisk og molekylær diagnose kompatibel med Covid-19.
- Asymptomatisk: Forsøgspersoner, der har haft direkte kontakt med personer, der er smittet, og som ikke har vist nogen symptomer relateret til Covid-19.
- Negativt: Personer med negativ RT-PCR-test for SARS-CoV-2 (referencetest), som ikke har vist nogen symptomer syv dage før prøvetagning.
Eksklusionskriterier:
- Voksne under 21 år eller over 65
- Personer med en klinisk historie med autoimmun sygdom eller kemoterapibehandlinger.
- Forsøgspersoner, der har modtaget transfusioner eller rekonvalescent plasma inden for den sidste måned før indskrivning.
- Personer med forudgående diagnose af andre infektionssygdomme såsom, men ikke begrænset til, AIDS, hepatitis B eller C, tuberkulose eller andre igangværende eller uløste sygdomme.
- Personer med misdannelser eller onkologisk patologi i de øvre luftveje, der kan hindre prøveindsamling, herunder, men ikke begrænset til, afviget septum, allergisk rhinitis.
- Forsøgspersoner, der ikke har underskrevet eller ikke kan underskrive den informerede samtykkeerklæring
- Forsøgspersoner er ikke i stand til at give deres fuldstændige oplysninger eller adgang til deres kliniske historie.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Frivillige deltagere
Prøver af frivillige deltagere vil blive indsamlet efter informeret samtykke og klassificeret som symptomatiske, asymptomatiske og negative.
|
RT-PCR (Gold standard): Real-time PCR-test med revers transkriptase (RT-PCR).
Testen består af en polymerasekædereaktion, der tidligere har haft en revers transkriptionsfase, RT.
Denne test gør det muligt at opnå cADN (komplementært DNA) fra en RNA-kæde.
Denne teknik tillader påvisning og amplifikation af en sekvens fra en RNA-streng.
Andre navne:
LAMP: LAMP-teknikken har ligesom PCR evnen til at amplificere specifikke DNA-fragmenter (målsekvens), hvilket muliggør meget følsom påvisning af patogener.
I modsætning til pcr kræver LAMP mellem 4 og 6 feedere, eksterne F3 og B3 feedere, som hybridter med de ydre regioner af målsekvensen, mens den interne FIP og BIP har sekvenser på begge måder, der tillader dannelsen af en loop.
LAMP-reaktionen er isotermisk, dvs. den foregår ved en enkelt temperatur.
LAMP er med succes blevet brugt til at påvise virussygdomme såvel som virale patogener såsom West Nile virus, TMR-1, Norovirus, fugleinfluenza, mund- og klovsyge, klassisk svinepest, blandt andre.
Andre navne:
POOL RT-PCR: Denne test har til formål at blande ekstraktioner opnået fra flere personer i en enkelt prøve.
Fællesprøven evalueres, og hvis den er negativ, er det underforstået, at alle er fri for COVID-19; hvis den er positiv, bruges et array-system til at opdage den berørte person.
Det vil sige, en enkelt PCR (polymerasekædereaktion), den diagnostiske test, der bruges til at påvise viruspatogenet, påføres en gruppe og gentages individuelt, hvis den er positiv.
Andre navne:
POOL LAMPE: Som RT-PCR pool testen.
Denne test involverer i det væsentlige at blande ekstraktioner opnået fra flere personer i en enkelt prøve.
Denne fællesprøve er testet, og hvis den er negativ, er det underforstået, at alle er fri for COVID-19; hvis den er positiv, bruges et array-system til at opdage den berørte person.
Det vil sige: en enkelt LAMPE gælder for en gruppe
Andre navne:
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Validering
Tidsramme: 1 måned
|
Validere forskellige molekylære tests og prøveudtagnings- og prøvetypestrategier brugt i epidemiologisk kontrol af COVID-19-diagnose i Tarija, Bolivia.
|
1 måned
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
RT-PCR (spyt)
Tidsramme: En uge
|
Valider brugen af molekylær testning baseret på PCR-metoden ved hjælp af spytprøver
|
En uge
|
|
LAMPE
Tidsramme: En uge
|
Valider brugen af den molekylære test baseret på LAMP-metoden ved hjælp af spyt- og nasopharyngeale prøver
|
En uge
|
|
POOL PCR
Tidsramme: En uge
|
Valider brugen af molekylære tests med Pool PCR-strategi ved hjælp af spytprøver
|
En uge
|
|
POOL LAMPE
Tidsramme: En uge
|
Valider brugen af molekylære tests med Pool LAMP-strategi ved hjælp af spytprøver
|
En uge
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Kenji Shoji, PhD, Galapagos NV
- Studiestol: Rodrigo Arce Cardozo, MD, MPH, City University of New York, School of Public Health
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, Chen WH, Yin X. Rapid Detection of COVID-19 Coronavirus Using a Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Diagnostic Platform. Clin Chem. 2020 Jul 1;66(7):975-977. doi: 10.1093/clinchem/hvaa102. No abstract available.
- Kashir J, Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020 Aug;141:109786. doi: 10.1016/j.mehy.2020.109786. Epub 2020 Apr 25.
- Esbin MN, Whitney ON, Chong S, Maurer A, Darzacq X, Tjian R. Overcoming the bottleneck to widespread testing: a rapid review of nucleic acid testing approaches for COVID-19 detection. RNA. 2020 Jul;26(7):771-783. doi: 10.1261/rna.076232.120. Epub 2020 May 1.
- Chow FW, Chan TT, Tam AR, Zhao S, Yao W, Fung J, Cheng FK, Lo GC, Chu S, Aw-Yong KL, Tang JY, Tsang CC, Luk HK, Wong AC, Li KS, Zhu L, He Z, Tam EWT, Chung TW, Wong SCY, Que TL, Fung KS, Lung DC, Wu AK, Hung IF, Woo PC, Lau SK. A Rapid, Simple, Inexpensive, and Mobile Colorimetric Assay COVID-19-LAMP for Mass On-Site Screening of COVID-19. Int J Mol Sci. 2020 Jul 29;21(15):5380. doi: 10.3390/ijms21155380.
- Augustine R, Hasan A, Das S, Ahmed R, Mori Y, Notomi T, Kevadiya BD, Thakor AS. Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): A Rapid, Sensitive, Specific, and Cost-Effective Point-of-Care Test for Coronaviruses in the Context of COVID-19 Pandemic. Biology (Basel). 2020 Jul 22;9(8):182. doi: 10.3390/biology9080182.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- PROY - UAJMS001/2020
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
IPD-delingstidsramme
IPD-delingsadgangskriterier
IPD-deling Understøttende informationstype
- STUDY_PROTOCOL
- SAP
- ICF
- ANALYTIC_CODE
- CSR
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .