Walidacja technik laboratoryjnych, strategii i rodzajów próbek do kontroli epidemiologicznej w pandemii Covid-19
Walidacja technik laboratoryjnych, strategii i typów próbek do kontroli epidemiologicznej podczas pandemii Covid-19, Tarija-Boliwia
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Tarija, Boliwia, 00000
- Universidad Autónoma Juan Misael Saracho
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Objawowe: osoby z objawami przedmiotowymi i podmiotowymi infekcji dróg oddechowych w okresie krótszym lub równym 3 dni, najlepiej z kliniczną i molekularną diagnozą zgodną z Covid-19.
- Osoby bezobjawowe: Osoby, które miały bezpośredni kontakt z osobami zakażonymi i które nie wykazały żadnych objawów związanych z Covid-19.
- Negatywny: osoby z ujemnym wynikiem testu RT-PCR na obecność SARS-CoV-2 (test referencyjny), które nie wykazały żadnych objawów na siedem dni przed pobraniem próbki.
Kryteria wyłączenia:
- Dorośli w wieku poniżej 21 lat lub powyżej 65 lat
- Pacjenci z kliniczną historią chorób autoimmunologicznych lub chemioterapii.
- Osoby, które otrzymały transfuzje lub osocze rekonwalescentów w ciągu ostatniego miesiąca przed włączeniem.
- Pacjenci z wcześniejszą diagnozą innych chorób zakaźnych, takich jak między innymi AIDS, wirusowe zapalenie wątroby typu B lub C, gruźlica lub inne trwające lub nierozwiązane choroby.
- Pacjenci z wadami rozwojowymi lub patologią onkologiczną górnych dróg oddechowych, która może utrudniać pobranie próbki, w tym między innymi skrzywioną przegrodą, alergicznym nieżytem nosa.
- Osoby, które nie podpisały lub nie mogą podpisać formularza świadomej zgody
- Pacjenci, którzy nie są w stanie podać pełnych informacji lub dostępu do swojej historii klinicznej.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Wolontariusze
Próbki uczestników ochotników zostaną pobrane po wyrażeniu świadomej zgody i sklasyfikowane jako objawowe, bezobjawowe i negatywne.
|
RT-PCR (złoty standard): Test PCR w czasie rzeczywistym z odwrotną transkryptazą (RT-PCR).
Test składa się z reakcji łańcuchowej polimerazy, która wcześniej miała fazę odwrotnej transkrypcji, RT.
Ten test umożliwia uzyskanie cADN (komplementarnego DNA) z łańcucha RNA.
Ta technika umożliwia wykrywanie i amplifikację sekwencji z nici RNA.
Inne nazwy:
LAMP: Technika LAMP, podobnie jak PCR, ma zdolność amplifikacji określonych fragmentów DNA (sekwencji docelowej), co pozwala na bardzo czułe wykrywanie patogenów.
W przeciwieństwie do pcr, LAMP wymaga od 4 do 6 podajników, zewnętrznych podajników F3 i B3, które hybrydyzują z zewnętrznymi regionami sekwencji docelowej, podczas gdy wewnętrzny FIP i BIP mają sekwencje w obie strony, które umożliwiają utworzenie pętli.
Reakcja LAMP jest izotermiczna, tzn. zachodzi w jednej temperaturze.
LAMP jest z powodzeniem stosowany do wykrywania chorób wirusowych, a także patogenów wirusowych, takich jak między innymi wirus Zachodniego Nilu, TMR-1, norowirus, ptasia grypa, pryszczyca, klasyczny pomór świń.
Inne nazwy:
POOL RT-PCR: Ten test ma na celu zmieszanie w jednej próbce ekstrakcji uzyskanych od kilku osób.
Wspólna próbka jest oceniana i jeśli jest ujemna, przyjmuje się, że wszyscy są wolni od COVID-19; jeśli jest dodatni, do wykrycia osoby dotkniętej chorobą używany jest system macierzowy.
Oznacza to, że pojedyncza reakcja PCR (reakcja łańcuchowa polimerazy), test diagnostyczny stosowany do wykrywania patogenu wirusa, jest stosowana w grupie i powtarzana indywidualnie, jeśli jest dodatnia.
Inne nazwy:
LAMPA BASENOWA: Podobnie jak test puli RT-PCR.
Ten test zasadniczo polega na zmieszaniu w jednej próbce ekstraktów uzyskanych od kilku osób.
Ta wspólna próbka jest testowana i jeśli jest ujemna, przyjmuje się, że wszyscy są wolni od COVID-19; jeśli jest dodatni, do wykrycia osoby dotkniętej chorobą używany jest system macierzowy.
To znaczy: pojedyncza LAMPA dotyczy grupy
Inne nazwy:
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Walidacja
Ramy czasowe: 1 miesiąc
|
Zweryfikuj różne testy molekularne oraz strategie pobierania próbek i rodzajów próbek stosowane w kontroli epidemiologicznej diagnozy COVID-19 w Tarija w Boliwii.
|
1 miesiąc
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
RT-PCR (ślina)
Ramy czasowe: 1 tydzień
|
Zweryfikuj zastosowanie testów molekularnych opartych na metodzie PCR przy użyciu próbek śliny
|
1 tydzień
|
|
LAMPA
Ramy czasowe: 1 tydzień
|
Zweryfikuj zastosowanie testu molekularnego opartego na metodzie LAMP z wykorzystaniem próbek śliny i nosogardzieli
|
1 tydzień
|
|
BASOWY PCR
Ramy czasowe: 1 tydzień
|
Zweryfikuj zastosowanie testów molekularnych ze strategią Pool PCR przy użyciu próbek śliny
|
1 tydzień
|
|
LAMPA BASENOWA
Ramy czasowe: 1 tydzień
|
Zweryfikuj zastosowanie testów molekularnych ze strategią Pool LAMP przy użyciu próbek śliny
|
1 tydzień
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Kenji Shoji, PhD, Galapagos NV
- Krzesło do nauki: Rodrigo Arce Cardozo, MD, MPH, City University of New York, School of Public Health
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, Chen WH, Yin X. Rapid Detection of COVID-19 Coronavirus Using a Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Diagnostic Platform. Clin Chem. 2020 Jul 1;66(7):975-977. doi: 10.1093/clinchem/hvaa102. No abstract available.
- Kashir J, Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020 Aug;141:109786. doi: 10.1016/j.mehy.2020.109786. Epub 2020 Apr 25.
- Esbin MN, Whitney ON, Chong S, Maurer A, Darzacq X, Tjian R. Overcoming the bottleneck to widespread testing: a rapid review of nucleic acid testing approaches for COVID-19 detection. RNA. 2020 Jul;26(7):771-783. doi: 10.1261/rna.076232.120. Epub 2020 May 1.
- Chow FW, Chan TT, Tam AR, Zhao S, Yao W, Fung J, Cheng FK, Lo GC, Chu S, Aw-Yong KL, Tang JY, Tsang CC, Luk HK, Wong AC, Li KS, Zhu L, He Z, Tam EWT, Chung TW, Wong SCY, Que TL, Fung KS, Lung DC, Wu AK, Hung IF, Woo PC, Lau SK. A Rapid, Simple, Inexpensive, and Mobile Colorimetric Assay COVID-19-LAMP for Mass On-Site Screening of COVID-19. Int J Mol Sci. 2020 Jul 29;21(15):5380. doi: 10.3390/ijms21155380.
- Augustine R, Hasan A, Das S, Ahmed R, Mori Y, Notomi T, Kevadiya BD, Thakor AS. Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): A Rapid, Sensitive, Specific, and Cost-Effective Point-of-Care Test for Coronaviruses in the Context of COVID-19 Pandemic. Biology (Basel). 2020 Jul 22;9(8):182. doi: 10.3390/biology9080182.
Przydatne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- PROY - UAJMS001/2020
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- SOK ROŚLINNY
- ICF
- ANALITYCZNY_KOD
- CSR
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .