Convalida di tecniche di laboratorio, strategie e tipi di campioni per il controllo epidemiologico nella pandemia di Covid-19
Convalida di tecniche di laboratorio, strategie e tipi di campioni per il controllo epidemiologico nella pandemia di Covid-19, Tarija-Bolivia
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Tarija, Bolivia, 00000
- Universidad Autónoma Juan Misael Saracho
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Sintomatici: Soggetti con segni e sintomi di infezione respiratoria inferiore o uguale a 3 giorni, preferibilmente con diagnosi clinica e molecolare compatibile con Covid-19.
- Asintomatici: Soggetti che hanno avuto contatti diretti con persone contagiate e che non hanno manifestato alcun sintomo riconducibile al Covid-19.
- Negativo: individui con test RT-PCR negativo per SARS-CoV-2 (test di riferimento) che non hanno manifestato alcun sintomo sette giorni prima del campionamento.
Criteri di esclusione:
- Adulti di età inferiore a 21 anni o superiore a 65 anni
- Soggetti con una storia clinica di malattie autoimmuni o trattamenti chemioterapici.
- Soggetti che hanno ricevuto trasfusioni o plasma convalescente nell'ultimo mese prima dell'arruolamento.
- Soggetti con precedente diagnosi di altre malattie infettive come, a titolo esemplificativo ma non esaustivo, AIDS, epatite B o C, tubercolosi o qualsiasi altra malattia in corso o irrisolta.
- Soggetti con malformazione o patologia oncologica del tratto respiratorio superiore che possono ostacolare la raccolta del campione, inclusi ma non limitati a setto deviato, rinite allergica.
- Soggetti che non hanno firmato o non possono firmare il modulo di consenso informato
- Soggetti che non sono in grado di fornire le proprie informazioni complete o di accedere alla propria storia clinica.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Partecipanti volontari
I campioni dei partecipanti volontari saranno raccolti dopo il consenso informato e classificati come sintomatici, asintomatici e negativi.
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RT-PCR (Gold standard): test PCR in tempo reale con trascrittasi inversa (RT-PCR).
Il test consiste in una reazione a catena della polimerasi che ha precedentemente avuto una fase di trascrizione inversa, RT.
Questo test consente di ottenere il cADN (DNA complementare) da una catena di RNA.
Questa tecnica consente il rilevamento e l'amplificazione di una sequenza da un filamento di RNA.
Altri nomi:
LAMP: La tecnica LAMP, come la PCR, ha la capacità di amplificare specifici frammenti di DNA (sequenza target), consentendo un rilevamento altamente sensibile dei patogeni.
A differenza di pcr, LAMP richiede da 4 a 6 alimentatori, alimentatori esterni F3 e B3, che si ibridano con le regioni esterne della sequenza target, mentre FIP e BIP interni hanno sequenze in entrambi i sensi che consentono la formazione di un loop.
La reazione LAMP è isoterma, cioè avviene ad una singola temperatura.
LAMP è stato utilizzato con successo per rilevare malattie virali e agenti patogeni virali come il virus del Nilo occidentale, TMR-1, Norovirus, influenza aviaria, afta epizootica, peste suina classica, tra gli altri.
Altri nomi:
POOL RT-PCR: Questo test ha lo scopo di mescolare in un unico campione le estrazioni ottenute da più persone.
Si valuta il campione congiunto e, se negativo, si intende che tutti sono esenti da COVID-19; se è positivo, viene utilizzato un sistema di array per rilevare la persona interessata.
Cioè, una singola PCR (reazione a catena della polimerasi), il test diagnostico utilizzato per rilevare il virus patogeno viene applicato a un gruppo e ripetuto individualmente se positivo.
Altri nomi:
POOL LAMP: Come il pool test RT-PCR.
Questo test consiste essenzialmente nel mescolare in un unico campione le estrazioni ottenute da più persone.
Questo campione congiunto viene testato e, se è negativo, resta inteso che tutti sono liberi da COVID-19; se è positivo, viene utilizzato un sistema di array per rilevare la persona interessata.
Ovvero: una singola LAMPADA vale per un gruppo
Altri nomi:
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Convalida
Lasso di tempo: 1 mese
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Convalida diversi test molecolari e strategie di campionamento e tipo di campione utilizzate nel controllo epidemiologico della diagnosi di COVID-19 a Tarija, in Bolivia.
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1 mese
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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RT- PCR (saliva)
Lasso di tempo: 1 settimana
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Convalidare l'uso di test molecolari basati sul metodo PCR utilizzando campioni di saliva
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1 settimana
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LAMPADA
Lasso di tempo: 1 settimana
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Convalidare l'uso del test molecolare basato sul metodo LAMP utilizzando campioni di saliva e nasofaringei
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1 settimana
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PISCINA PCR
Lasso di tempo: 1 settimana
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Convalidare l'uso di test molecolari con la strategia Pool PCR utilizzando campioni di saliva
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1 settimana
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LAMPADA DA PISCINA
Lasso di tempo: 1 settimana
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Convalidare l'uso di test molecolari con la strategia Pool LAMP utilizzando campioni di saliva
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1 settimana
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Kenji Shoji, PhD, Galapagos NV
- Cattedra di studio: Rodrigo Arce Cardozo, MD, MPH, City University of New York, School of Public Health
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, Chen WH, Yin X. Rapid Detection of COVID-19 Coronavirus Using a Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Diagnostic Platform. Clin Chem. 2020 Jul 1;66(7):975-977. doi: 10.1093/clinchem/hvaa102. No abstract available.
- Kashir J, Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020 Aug;141:109786. doi: 10.1016/j.mehy.2020.109786. Epub 2020 Apr 25.
- Esbin MN, Whitney ON, Chong S, Maurer A, Darzacq X, Tjian R. Overcoming the bottleneck to widespread testing: a rapid review of nucleic acid testing approaches for COVID-19 detection. RNA. 2020 Jul;26(7):771-783. doi: 10.1261/rna.076232.120. Epub 2020 May 1.
- Chow FW, Chan TT, Tam AR, Zhao S, Yao W, Fung J, Cheng FK, Lo GC, Chu S, Aw-Yong KL, Tang JY, Tsang CC, Luk HK, Wong AC, Li KS, Zhu L, He Z, Tam EWT, Chung TW, Wong SCY, Que TL, Fung KS, Lung DC, Wu AK, Hung IF, Woo PC, Lau SK. A Rapid, Simple, Inexpensive, and Mobile Colorimetric Assay COVID-19-LAMP for Mass On-Site Screening of COVID-19. Int J Mol Sci. 2020 Jul 29;21(15):5380. doi: 10.3390/ijms21155380.
- Augustine R, Hasan A, Das S, Ahmed R, Mori Y, Notomi T, Kevadiya BD, Thakor AS. Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP): A Rapid, Sensitive, Specific, and Cost-Effective Point-of-Care Test for Coronaviruses in the Context of COVID-19 Pandemic. Biology (Basel). 2020 Jul 22;9(8):182. doi: 10.3390/biology9080182.
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Completamento primario
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
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Primo Inserito
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Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- PROY - UAJMS001/2020
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