Odhalení role proteinové rodiny KCTD v klinické léčbě akutních lymfoblastických leukémií v dětství
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Laura Pierri, MSC
- Telefonní číslo: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
Studijní místa
-
-
-
Naples, Itálie, 80143
- Nábor
- Irccs Synlab Sdn
-
Kontakt:
- Laura Pierri, MSC
- Telefonní číslo: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti ve věku 1-18 let obou pohlaví s diagnózou B-ALL a T-ALL;
- Pacienti, kteří podepíší informovaný souhlas
Kritéria vyloučení:
- Pacienti, kteří se odmítnou zúčastnit studie;
- Pacienti, kteří nespadají do výše uvedeného věkového rozmezí
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Pediatričtí pacienti s akutní lymfoblastickou leukémií
pediatričtí pacienti ve věku 1-16 let postižení akutní lymfoblastickou leukémií
|
analýza biomarkerů zájmu (DNA-RNA a proteiny) v MNC purifikovaných z krve subjektů
|
|
zdravé subjekty
pupečníkovou krev od zdravých dárců, kterou nelze použít pro klinické účely
|
analýza biomarkerů zájmu (DNA-RNA a proteiny) v MNC purifikovaných z krve subjektů
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Hladiny exprese KCTD, přístupem RNAseq, u kohorty pacientů postižených ALL B a T buněk ve srovnání s nepostiženými kontrolami
Časové okno: 1-12 měsíců
|
Během tohoto projektu zařazujeme přibližně 15-20 pacientů s B-ALL a 3-6 pacientů s T-ALL. Experimenty RNAseq pro analýzu transkriptomu budou provedeny na studijní kohortě alespoň 8 pacientů s B-ALL, 3-4 pacientů s T-ALL a naivní B nebo T buňky purifikované z pupečníkové krve jako kontrola pro B- a T-ALL odpovídajícím způsobem.
Budou použity hrubé počty a aplikován empirický Bayesův přístup (DESeq2, R balíček).
Výsledky budou pro každý gen zahrnovat log-násobek změny (log2), základní průměr, p-hodnotu a upravené p-hodnoty (Benjamimi-Hochberg). Výstup DEgenes bude exportován do formátu vhodného pro IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), pro genové anotace, funkční analýzu a predikci biomarkerů.
Podrobně budou studovány KCTD proteiny, které budou deregulovány u B-ALL a T-ALL.
|
1-12 měsíců
|
|
RT-PCR validace deregulovaných KCTD a identifikace možných interaktorů KCTD u leukémie funkčním proteomickým přístupem
Časové okno: 13-24 měsíců
|
Po interpretaci transkriptomových dat provedeme specifické validační experimenty pomocí reat-time pcr, westernblottingu, průtokové cytometrie a mikroskopie.
Stručně, celková RNA bude purifikována z přibližně 5e6 celkových MNC a použita pro experimenty RT-PCR; BM nátěr bude odebrán pro imunofluorescenční analýzu deregulovaných KCTD; celkový proteinový extrakt bude získán z alespoň 1 e 6 celkových MNC a skladován při -80 °C až do Western blotting; nakonec budou živé mononukleární buňky ošetřeny pro permeabilizaci a cytoplazmatické imunobarvení zájmových KCTD.
Všechny experimenty budou založeny na B- a T-ALL in vitro lidských modelových systémech a poté provedeny na pacientech a kontrolních buňkách.
Navíc, abychom identifikovali možné interaktory KCTD proteinů, použijeme buněčné linie B-ALL a T-ALL pro funkční proteomickou analýzu.
|
13-24 měsíců
|
|
Korelace klinických dat pacientů s B-ALL s úrovní exprese KCTD
Časové okno: 25-36 měsíců
|
Nejprve vyhodnotíme užitečnost deregulovaných KCTD proteinů jako nových markerů leukémie, které budou testovány multiparametrickou klinickou průtokovou cytometrií.
Náš výzkumný tým již vytvořil specifický protokol, který je schopen barvit cytoplazmatické antigeny (jako jsou proteiny KCTD) povrchovými antigeny běžně používanými pro studium hematoologických kompartmentů pomocí průtokové cytometrie.
Tento přístup bude užitečný zejména při monitorování odpovědi pacienta na léčbu a také při detekci minimální reziduální choroby.
Kromě toho, protože jsme schopni detekovat cytoplazmatické KCTD v kombinaci s povrchovými antigeny, plánovali jsme popsat hladiny exprese KCTD ve vícenásobné buněčné populaci sídlící v kostní dřeni a periferní krvi. Za druhé, celková data získaná v této studii budou také interpretována s ohledem na pacienta kliniky se zvláštním ohledem na odpověď na léčbu, riziko relapsu a, je-li to možné, rezistenci na léčbu.
|
25-36 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 5/19
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .