Aufklärung der Rolle der KCTD-Proteinfamilie bei der klinischen Behandlung akuter lymphoblastischer Leukämien im Kindesalter
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-Mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
Studienorte
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Naples, Italien, 80143
- Rekrutierung
- Irccs Synlab Sdn
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Kontakt:
- Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-Mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten im Alter von 1-18 Jahren beiderlei Geschlechts mit diagnostizierter B-ALL und T-ALL;
- Patienten, die die Einverständniserklärung unterschrieben haben
Ausschlusskriterien:
- Patienten, die sich weigern, an der Studie teilzunehmen;
- Patienten, die nicht in die oben genannte Altersgruppe fallen
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
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Pädiatrische Patienten mit akuter lymphoblastischer Leukämie
pädiatrische Patienten im Alter von 1-16 Jahren mit akuter lymphoblastischer Leukämie
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Analyse von Biomarkern von Interesse (DNA-RNA und Proteine) in MNC, die aus dem Blut der Probanden gereinigt wurden
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gesunde Themen
Nabelschnurblut von gesunden Spendern, das nicht für klinische Zwecke verwendet werden kann
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Analyse von Biomarkern von Interesse (DNA-RNA und Proteine) in MNC, die aus dem Blut der Probanden gereinigt wurden
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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KCTD-Expressionsniveaus nach RNAseq-Ansatz in einer Kohorte von B- und T-Zell-ALL-betroffenen Patienten im Vergleich zu nicht betroffenen Kontrollen
Zeitfenster: 1-12 Monate
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Wir nehmen während dieses Projekts etwa 15–20 B-ALL- und 3–6 T-ALL-Patienten auf. RNAseq-Experimente zur Transkriptomanalyse werden an einer Studienkohorte von mindestens 8 B-ALL-Patienten und 3–4 T-ALL-Patienten durchgeführt und aus Nabelschnurblut gereinigte naive B- oder T-Zellen als Kontrolle für B- und T-ALL entsprechend.
Es werden Rohzählungen verwendet und ein empirischer Bayes-Ansatz angewendet (DESeq2, R-Paket).
Die Ergebnisse umfassen für jedes Gen die logarithmische Änderung (log2), den Basismittelwert, den p-Wert und die angepassten p-Werte (Benjamimi-Hochberg). Die DEgenes-Ausgabe wird in ein Format exportiert, das für die IPA Ingenuity Pathway AnalysisSoftware (Qiagen) für Genannotationen, Funktionsanalyse und Biomarkervorhersage geeignet ist.
Die KCTD-Proteine, die in B-ALL und T-ALL dereguliert werden, werden im Detail untersucht.
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1-12 Monate
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RT-PCR-Validierung von deregulierten KCTDs und Identifizierung möglicher KCTDs-Interaktoren bei Leukämie durch einen funktionellen proteomischen Ansatz
Zeitfenster: 13-24 Monate
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Nach der Interpretation der Transkriptomdaten führen wir spezifische Validierungsexperimente durch Echtzeit-PCR, Westernblot, Durchflusszytometrie und Mikroskopie durch.
Kurz gesagt, Gesamt-RNA wird aus etwa 5e6 Gesamt-MNC gereinigt und für RT-PCR-Experimente verwendet; BM-Abstrich wird für die Immunfluoreszenzanalyse von deregulierten KCTDs gesammelt; Protein-Gesamtextrakt wird aus mindestens 1 e 6 Gesamt-MNC erhalten und bis zum Western Blotting bei –80 °C gelagert; Schließlich werden lebende mononukleäre Zellen auf Permeabilisierung und zytoplasmatische Immunfärbung der interessierenden KCTDs untersucht.
Alle Experimente werden an B- und T-ALL-In-vitro-Menschmodellsystemen durchgeführt und dann an Patienten und Kontrollzellen durchgeführt.
Um mögliche Interaktoren von KCTDs-Proteinen zu identifizieren, werden wir außerdem B-ALL- und T-ALL-Zelllinien für funktionelle Proteomik-Analysen verwenden.
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13-24 Monate
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Korrelation der klinischen Daten von B-ALL-Patienten mit dem KCTD-Expressionsniveau
Zeitfenster: 25-36 Monate
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Zunächst werden wir die Nützlichkeit der deregulierten KCTD-Proteine als neuartige Marker für Leukämie evaluieren, die durch multiparametrische klinische Durchflusszytometrie getestet werden sollen.
Ein spezifisches Protokoll wurde bereits von unserem Forschungsteam erstellt und ist in der Lage, zytoplasmatische Antigene (wie KCTD-Proteine) mit Oberflächenantigenen zu färben, die üblicherweise zur Untersuchung hämatologischer Kompartimente durch Durchflusszytometrie verwendet werden.
Dieser Ansatz ist insbesondere bei der Überwachung des Ansprechens des Patienten auf die Behandlung sowie beim Nachweis einer minimalen Resterkrankung nützlich.
Da wir außerdem zytoplasmatische KCTDs in Kombination mit Oberflächenantigenen nachweisen konnten, planten wir, die KCTDs-Expressionsniveaus in mehreren Zellpopulationen zu beschreiben, die sich im Knochenmark und im peripheren Blut befinden. Zweitens werden die in dieser Studie erhaltenen Gesamtdaten auch mit Blick auf den Patienten interpretiert Kliniken unter besonderer Berücksichtigung des Ansprechens auf die Therapie, des Rückfallrisikos und, wenn möglich, der Therapieresistenz.
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25-36 Monate
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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