Odkrywanie roli rodziny białek KCTD w leczeniu klinicznym ostrych białaczek limfoblastycznych wieku dziecięcego
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Laura Pierri, MSC
- Numer telefonu: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
Lokalizacje studiów
-
-
-
Naples, Włochy, 80143
- Rekrutacyjny
- Irccs Synlab Sdn
-
Kontakt:
- Laura Pierri, MSC
- Numer telefonu: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci w wieku 1-18 lat obojga płci z rozpoznaniem B-ALL i T-ALL;
- Pacjenci, którzy podpiszą świadomą zgodę
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci, którzy odmówią udziału w badaniu;
- Pacjenci, którzy nie mieszczą się w podanym powyżej przedziale wiekowym
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pacjenci z ostrą białaczką limfoblastyczną u dzieci
dzieci w wieku 1-16 lat dotkniętych ostrą białaczką limfoblastyczną
|
analiza interesujących biomarkerów (DNA-RNA i białek) w MNC oczyszczonych z krwi badanych
|
|
zdrowe przedmioty
krwi pępowinowej od zdrowych dawców, której nie można wykorzystać do celów klinicznych
|
analiza interesujących biomarkerów (DNA-RNA i białek) w MNC oczyszczonych z krwi badanych
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Poziomy ekspresji KCTD, według podejścia RNAseq, w kohorcie pacjentów dotkniętych ALL komórkami B i T w porównaniu z kontrolami zdrowymi
Ramy czasowe: 1-12 miesięcy
|
W ramach tego projektu zapiszemy około 15-20 pacjentów z B-ALL i 3-6 pacjentów z T-ALL. Eksperymenty RNAseq do analizy transkryptomu zostaną przeprowadzone na kohorcie badawczej obejmującej co najmniej 8 pacjentów z B-ALL, 3-4 pacjentów z T-ALL i naiwne komórki B lub T oczyszczone z krwi pępowinowej jako odpowiednio kontrola dla B- i T-ALL.
Zostaną użyte surowe obliczenia i zastosowane zostanie empiryczne podejście Bayesa (DESeq2, pakiet R).
Wyniki będą obejmować, dla każdego genu, zmianę logarytmiczną (log2), średnią podstawową, wartość p i skorygowane wartości p (Benjamimi-Hochberg). Dane wyjściowe DEgenes zostaną wyeksportowane do formatu odpowiedniego dla oprogramowania IPA Ingenuity path Analysis Software (Qiagen), do adnotacji genów, analizy funkcjonalnej i przewidywania biomarkerów.
Białka KCTD, które zostaną rozregulowane w B-ALL i T-ALL, zostaną szczegółowo zbadane.
|
1-12 miesięcy
|
|
Walidacja RT-PCR zderegulowanych KCTD i identyfikacja możliwych interakcji KCTD w białaczce za pomocą funkcjonalnego podejścia proteomicznego
Ramy czasowe: 13-24 miesiące
|
Po interpretacji danych z transkryptomu przeprowadzimy specyficzne eksperymenty walidacyjne poprzez reat-time PCR, westernblotting, cytometrię przepływową i mikroskopię.
Pokrótce, całkowity RNA zostanie oczyszczony z około 5e6 całkowitych MNC i użyty do eksperymentów RT-PCR; Rozmaz BM zostanie pobrany do analizy immunofluorescencyjnej rozregulowanych KCTD; całkowity ekstrakt białkowy zostanie uzyskany z co najmniej 1 e 6 całkowitych MNC i będzie przechowywany w -80°C aż do analizy Western Blot; wreszcie, żywe komórki jednojądrzaste zostaną poddane obróbce pod kątem permeabilizacji i immunobarwienia cytoplazmatycznego KCTD będących przedmiotem zainteresowania.
Wszystkie eksperymenty zostaną przeprowadzone na ludzkich modelach B- i T-ALL in vitro, a następnie przeprowadzone na pacjentach i komórkach kontrolnych.
Ponadto, w celu identyfikacji możliwych interakcji białek KCTD, do analizy proteomiki funkcjonalnej wykorzystamy linie komórkowe B-ALL i T-ALL.
|
13-24 miesiące
|
|
Korelacja danych klinicznych pacjentów z B-ALL z poziomem ekspresji KCTD
Ramy czasowe: 25-36 miesięcy
|
Po pierwsze, ocenimy przydatność rozregulowanych białek KCTD jako nowych markerów białaczki do testowania za pomocą wieloparametrycznej klinicznej cytometrii przepływowej.
Specjalny protokół został już opracowany przez nasz zespół badawczy i umożliwia barwienie antygenów cytoplazmatycznych (takich jak białka KCTD) antygenami powierzchniowymi powszechnie używanymi do badania kompartmentów hematoogicznych za pomocą cytometrii przepływowej.
Takie podejście będzie przydatne zwłaszcza w monitorowaniu odpowiedzi pacjenta na leczenie, a także wykrywaniu minimalnej choroby resztkowej.
Ponadto, będąc w stanie wykryć cytoplazmatyczne KCTD w połączeniu z antygenami powierzchniowymi, planowaliśmy opisać poziomy ekspresji KCTD w populacji wielu komórek rezydujących w szpiku i krwi obwodowej. Po drugie, ogólne dane uzyskane w tym badaniu będą również interpretowane patrząc na pacjenta klinik, ze szczególnym uwzględnieniem odpowiedzi na terapię, ryzyka nawrotu choroby oraz, jeśli to możliwe, oporności na terapię.
|
25-36 miesięcy
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 5/19
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .