Optrævling af KCTD-proteinfamiliens rolle i den kliniske behandling af akutte lymfoblastiske leukæmier i barndommen
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
Studiesteder
-
-
-
Naples, Italien, 80143
- Rekruttering
- Irccs Synlab Sdn
-
Kontakt:
- Laura Pierri, MSC
- Telefonnummer: 0812408470
- E-mail: direzionescientifica.irccssdn@synlab.it
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter i alderen 1-18 år af begge køn diagnosticeret med B-ALL og T-ALL;
- Patienter, der vil have underskrevet det informerede samtykke
Ekskluderingskriterier:
- Patienter, der nægter at deltage i undersøgelsen;
- Patienter, der ikke falder inden for aldersgruppen nævnt ovenfor
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Pædiatriske patienter med akut lymfatisk leukæmi
pædiatriske patienter i alderen 1-16 år ramt af akut lymfatisk leukæmi
|
analyse af biomarkører af interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC oprenset fra forsøgspersonernes blod
|
|
sunde forsøgspersoner
navlestrengsblod fra raske donorer, der ikke kan bruges til kliniske formål
|
analyse af biomarkører af interesse (DNA-RNA og proteiner) i MNC oprenset fra forsøgspersonernes blod
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
KCTD-ekspressionsniveauer, ved RNAseq-tilgang, i en kohorte af B- og T-celle-ALL påvirkede patienter sammenlignet med upåvirkede kontroller
Tidsramme: 1-12 måneder
|
Vi tilmelder i løbet af dette projekt omkring 15-20 B-ALL- og 3-6 T-ALL-patienter. RNAseq-eksperimenter til transkriptomanalyse vil blive udført på en studiekohorte på mindst 8 B-ALL-patienter, 3-4 T-ALL-patienter og naive B- eller T-celler oprenset fra navlestrengsblod som kontrol for B- og T-ALL tilsvarende.
Råtællinger vil blive brugt og en empirisk Bayes-tilgang anvendt (DESeq2, R-pakke).
Resultaterne vil for hvert gen inkludere log-fold ændring (log2), basismiddelværdi, p-værdi og justerede p-værdier (Benjamimi-Hochberg). DEgenes output vil blive eksporteret til et format, der er egnet til IPA Ingenuity pathway AnalysisSoftware (Qiagen), til genannoteringer, funktionel analyse og biomarkør forudsigelse.
KCTD-proteinerne, der vil blive dereguleret i B-ALL og T-ALL, vil blive undersøgt i detaljer.
|
1-12 måneder
|
|
RT-PCR validering af deregulerede KCTD'er og identifikation af mulige KCTD'er interaktorer i leukæmi ved funktionel proteomisk tilgang
Tidsramme: 13-24 måneder
|
Efter fortolkningen af transkriptomdata vil vi udføre specifikke valideringseksperimenter ved reat-time pcr, westernblotting, flowcytometri og mikroskopi.
Kort fortalt vil total RNA blive oprenset fra ca. 5e6 total MNC og anvendt til RT-PCR eksperimenter; BM-udstrygning vil blive indsamlet til immunfluorescensanalyse af deregulerede KCTD'er; protein totalekstrakt vil blive opnået fra mindst 1 e 6 total MNC og opbevaret ved -80°C indtil Western Blotting; endelig vil levende mononukleære celler blive behandlet for permeabilisering og cytoplasmatisk immunfarvning af KCTD'erne af interesse.
Alle eksperimenter vil blive afviklet på B- og T-ALL in vitro humane modelsystemer og derefter udført på patienter og kontrolceller.
For at identificere mulige interaktorer af KCTDs proteiner vil vi desuden bruge B-ALL og T-ALL cellelinjer til funktionel proteomisk analyse.
|
13-24 måneder
|
|
Korrelation af B-ALL patienters kliniske data med KCTDs ekspressionsniveau
Tidsramme: 25-36 måneder
|
For det første vil vi evaluere anvendeligheden af de deregulerede KCTD-proteiner som nye markører for leukæmi, der skal testes ved multiparametrisk klinisk flowcytometri.
En specifik protokol er allerede blevet sat op af vores forskerhold, og den er i stand til at farve cytoplasmiske antigener (såsom KCTD-proteiner) med overfladeantigener, der almindeligvis bruges til at studere hæmatoogiske rum ved flowcytometri.
Denne tilgang vil især være nyttig til overvågning af patientrespons på behandling samt påvisning af minimal resterende sygdom.
Da vi desuden var i stand til at påvise cytoplasmatiske KCTD'er i kombination med overfladeantigener, planlagde vi at beskrive KCTD's ekspressionsniveauer i multiple cellulære populationer, der bor i marv og perifert blod. For det andet vil de overordnede data opnået i denne undersøgelse også blive fortolket under hensyntagen til patienten klinikker med særlig henvisning til respons på terapi, risiko for tilbagefald og, når det er muligt, modstand mod terapi.
|
25-36 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 5/19
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .