Nové genetické variace přispívající k náchylnosti k astmatu v Saúdské Arábii

Výzkumný problém Astma je jedním z nejběžnějších chronických onemocnění na světě, které postihuje přibližně 300 milionů jedinců na celém světě. Vyznačuje se zánětem dýchacích cest a bronchokonstrikcí vedoucí k obstrukci dýchacích cest, avšak spouštěcí faktory rozvoje astmatu je třeba ještě objasnit. Předpokládá se, že genetické rizikové faktory hrají ústřední roli ve vývoji astmatu. Studie dvojčat podpořily silnou genetickou složku astmatu, zejména dětského astmatu, přičemž odhady dědičnosti naznačují, že 48–70 % rizika astmatu je připisováno genetickým rizikovým faktorům. Geny sugestivní náchylnosti byly identifikovány v evropské a americké populaci, ale zatím ne na Blízkém východě včetně Saúdské Arábie. Identifikované geny, ať už se jedná o polymorfní varianty genů kódujících známé patofyziologické molekuly, nebo nové geny identifikované vazebnými nebo celogenomovými asociačními studiemi (GWAS), jsou v různých populacích nekonzistentní, což zvyšuje potřebu provádět genetické studie na různých etnických populacích a v různých zemích. . Zde výzkumníci předpokládají, že polymorfní variace nových genů náchylnosti tvoří hlavní rizikový faktor pro rozvoj astmatu, odpověď na léčbu a progresi v saúdské populaci se silnými diagnostickými, prognostickými a terapeutickými důsledky.

Význam výzkumu Vzhledem k tomu, že manifestace komplexních zánětlivých poruch se silnou dědičností je komplexní, zahrnující genetickou a environmentální interakci, musí být každá etnicky odlišná populace prozkoumána, aby se zjistilo, zda v této populaci existuje asociace gen-onemocnění. Cílem tohoto návrhu je objevit nové geny náchylnosti k astmatu v saúdské populaci. Lepší pochopení genetických mechanismů astmatu rozšíří naše znalosti o jeho patofyziologii. Astmatičtí pacienti s odlišnými genotypy reagují na léky proti astmatu odlišně. Zlepšení diagnostiky a farmakogenetiky proto mohou být prvním klinickým vývojem těchto rozsáhlých studií. To zahrnuje koncept subfenotypů astmatu a stratifikované medicíny, kde jsou intervence zaměřeny na ty jedince, kteří z nich budou mít nejlepší prospěch s minimálními vedlejšími účinky. Lékaři, kteří se starají o astmatické pacienty, budou moci poskytovat lepší lékařské služby šité na míru těmto pacientům a také identifikovat saúdské osoby s vysokým rizikem rozvoje astmatu, zejména závažnějších forem onemocnění.

Cíle výzkumu Hlavním cílem našeho návrhu je identifikovat známé a nové geny náchylnosti k astmatu v saúdské populaci a prozkoumat jejich interakci s klinickými, environmentálními a zánětlivými faktory přispívajícími k patofyziologii astmatu.

Metodika výzkumu V tomto návrhu budou výzkumníci zkoumat genetické faktory přispívající k náchylnosti k astmatu stanovením přítomnosti jednonukleotidových polymorfismů (SNP), které byly dříve hlášeny z vazby a GWAS v populaci Saúdské Arábie v jiných populacích. DNA celého genomu bude také skenována na nové SNP vybraných "genů pro astma" pomocí mikročipů. To nám umožní identifikovat nové SNP, které přispívají k riziku astmatu konkrétně u saúdské populace. Kromě toho budou výzkumníci křížově odkazovat na všechny genetické a imunologické parametry s odpovídajícími klinickými údaji, aby objasnili dopad určitých genů nebo jejich produktů (např. cytokiny), na klinické projevy astmatu.