Analýza biomarkerů pro pacienty s metastatickým kolorektálním karcinomem (MCC)

Toto je krátkodobá, prospektivní studie proveditelnosti, která má určit, jak efektivně mohou výzkumníci získat analýzu biomarkerů u pacientů s mCRC, od kterých bude získán informovaný souhlas a povolení. Studie bude provedena ve spolupráci s Quintiles. Výzkumníci budou shromažďovat údaje o počtu klinicky použitelných biomarkerů, které lze detekovat v každé populaci, a počtu markerů použitelných ve studii, které lze v těchto populacích detekovat. Pacientům s recidivujícím metastatickým onemocněním (tj. první diagnózou metastatického onemocnění po resekci, posledním ozařování nebo poslední chemoterapii v adjuvantní léčbě) bude primární vzorek odeslán na analýzu biomarkerů. Akční markery nebo genomové změny budou doprovodné diagnostické markery schválené FDA a markery používané pro zařazení do studie u metastatického kolorektálního karcinomu. Budou také shromažďovány a hlášeny další informace týkající se doprovodných diagnostických markerů schválených FDA a markerů používaných pro zařazení do studie v jiných indikacích než mCRC.

Biovzorky od 25 pacientů, kteří měli časnou recidivu (≤ 12 měsíců) a 25 pacientů, kteří měli pozdní recidivu (> 12 měsíců) svého metastatického kolorektálního karcinomu, budou náležitě odebrány, zpracovány, odeslány a testovány. Frekvence a místa mutace mohou generovat hypotézy, které pomohou identifikovat pacienty s vyšším rizikem časné recidivy a pomohou při identifikaci budoucích možností léčby a při výběru lepších možností léčby pro tuto skupinu se špatnou prognózou.

REGISTRAČNÍ POSTUPY Před registrací pacienta musí být uložena písemná dokumentace plného, ​​nezávazného schválení IRB. Proces registrace začíná, když koordinátor obdrží podepsaný informovaný souhlas. Demografie pacientů bude zařazena do systému řízení klinických studií (CTMS); toto je webový intranetový systém pro doručování zkušebních informací přes USOR. V tu chvíli bude pacientovi přiděleno jedinečné číslo pacienta (UPN). Zadání pacienta do CTMS neznamená, že byl pacient zaregistrován ve studii.

Jakmile má pacient číslo UPN, může koordinátor přejít do zprávy o pacientovi a vybrat pacienta, který má být zaregistrován. Nalevo od pacientova UPN budou modrá písmena „Reg“. Koordinátor klikne na modré „Reg“ a otevře informace o daném pacientovi. Každá stránka, kterou je třeba vyplnit, bude označena žlutou barvou. Stránka odpoví na otázky na stránkách Zařazení, Vyloučení a Posouzení před studiem. Jakmile budou zodpovězeny všechny otázky na každé stránce, stránka zezelená. Identifikační číslo a studijní rameno budou přiděleny přímo.

POSTUPY ODBĚRU VZORKU Místa studie USOR budou dodána se soupravami pro odběr nádorů prostřednictvím US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Biovzorky budou mít datum odeslání do 4 týdnů poté, co pacient podepíše souhlas, aby mohl být zařazen do studie. Tkáň bude odeslána do centrální laboratoře. Podrobnosti o přepravě budou uvedeny v Informacích o klinických zkouškách (CTI) poskytnutých samostatně společností USOR.

Referenční laboratorní příručka pro přípravu tkáně a pokyny pro přepravu.

ANALÝZA VZORKU A DŮVĚRNOST Záměrem společností USOR a Quintiles je zachovat důvěrnost pacienta během celého postupu. USOR dodržuje přísné standardy důvěrnosti pro klinické studie kódováním vzorků iniciálami pacienta a jedinečným identifikátorem (číslo UPN/číslo pacienta/ID studie) a číslem studie. Pacient je ve screeningu po podpisu ICF a registrován v CTMS. Pacient bude považován za zařazeného do studie, pokud bude k dispozici standardní biovzorek péče pro testování biomarkerů s datem odeslání do 4 týdnů od podpisu ICF. Pokud není standardní biovzorek z jakéhokoli důvodu k dispozici, do 4 týdnů je pacient považován za selhání screeningu.

HODNOCENÍ BIOSPECIMEN Bude použito vysoce propustné sekvenování využívající platformu Life Technologies Ion Torrent nebo podobnou alternativu. Tato metodologie poskytuje vysoce kvalitní pokrytí hlubokým sekvenováním, které je ideální pro detekci SNP a mutační analýzu. Analýza identifikace bodové mutace bude zahrnovat cílené sekvenování celého exomu nádorové tkáně, které pokryje několik stovek exonů kódujících lidský protein. Výsledky z profilování budou sestaveny a uspořádány podle relevance pro klinickou praxi. Všechny klinicky použitelné výsledky budou poskytnuty zpět lékaři pomocí stejných identifikátorů uvedených výše.

SELHÁNÍ TESTOVÁNÍ VZORKU Vzorky předložené k analýze budou z archivované tkáně FFPE. Schopnost provádět testování AmpliSeq může být omezena na základě kvality a množství dostupného vzorku. Důvodem selhání testování může být neschopnost extrahovat dostatečnou kvalitu a množství DNA, neschopnost vytvořit sekvenační knihovnu nebo neschopnost vzorku sekvenovat. Pokud dojde k selhání testování, laboratoř zaznamená důvod selhání testování a oznámí jej zpět lékaři. Pacient bude mít možnost, po diskusi se svým studijním lékařem, v závislosti na prostoru ve studii a schválení od manažera klinického projektu onkologie v USA, znovu odeslat jeden další vzorek k sekvenování. Pokud vzorek od pacienta selže po 2 pokusech o testování, je pacient považován za trvalé selhání testování a nebude mu nabídnuta možnost odeslat žádné další vzorky.