Analiza biomarkerów u pacjentów z rakiem jelita grubego z przerzutami (MCC)

Jest to krótkoterminowe, prospektywne studium wykonalności mające na celu określenie, jak skutecznie badacze mogą uzyskać analizę biomarkerów u pacjentów z mCRC, od których uzyskana zostanie świadoma zgoda i autoryzacja. Badanie zostanie przeprowadzone we współpracy z firmą Quintiles. Badacze będą gromadzić dane na temat liczby biomarkerów dających się zastosować klinicznie, które można wykryć w każdej populacji, oraz liczby markerów dających się zastosować w próbach, które można wykryć w tych populacjach. U pacjentów z nawrotem choroby przerzutowej (tj. pierwszą diagnozą choroby przerzutowej po resekcji, ostatnią radioterapią lub ostatnią chemioterapią w ramach leczenia adiuwantowego) zostanie wysłana ich próbka pierwotna do analizy biomarkerów. Aktywne markery lub zmiany genomowe będą zatwierdzonymi przez FDA towarzyszącymi markerami diagnostycznymi i markerami używanymi do włączenia do badania w raku jelita grubego z przerzutami. Gromadzone i zgłaszane będą również dodatkowe informacje dotyczące zatwierdzonych przez FDA towarzyszących markerów diagnostycznych i markerów używanych do włączenia do badania we wskazaniach innych niż mCRC.

Próbki biologiczne od 25 pacjentów, u których wystąpił wczesny nawrót (≤ 12 miesięcy) i 25 pacjentów, u których wystąpił późny nawrót (> 12 miesięcy) raka jelita grubego z przerzutami, zostaną odpowiednio pobrane, przetworzone, wysłane i przetestowane. Częstotliwość i miejsca mutacji mogą generować hipotezy, które pomogą zidentyfikować pacjentów z wyższym ryzykiem wczesnego nawrotu i pomóc w identyfikacji przyszłych opcji leczenia oraz w wyborze lepszych opcji leczenia dla tej grupy o złym rokowaniu.

PROCEDURY REJESTRACJI Pisemna dokumentacja pełnej, niewarunkowej zgody IRB musi znajdować się w aktach, zanim pacjent będzie mógł zostać zarejestrowany. Proces rejestracji rozpoczyna się w momencie uzyskania przez koordynatora podpisanej świadomej zgody. Dane demograficzne pacjentów zostaną wprowadzone do systemu zarządzania badaniami klinicznymi (CTMS); jest to oparty na sieci Web system intranetowy służący do dostarczania informacji o próbach w ramach usługi USOR. W tym czasie pacjentowi zostanie przydzielony unikalny numer pacjenta (UPN). Wpisanie pacjenta do WZT nie oznacza, że ​​pacjent został zarejestrowany w badaniu.

Gdy pacjent ma numer UPN, koordynator może przejść do Raportu pacjenta i wybrać pacjenta do rejestracji. Po lewej stronie nazwy UPN pacjenta będą znajdować się niebieskie litery „Reg”. Koordynator kliknie niebieski „Reg”, aby otworzyć informacje o tym pacjencie. Każda strona, która musi zostać wypełniona, będzie zaznaczona na żółto. Witryna odpowie na pytania na stronach włączenia, wyłączenia i ocena przed badaniem. Po udzieleniu odpowiedzi na wszystkie pytania na każdej stronie ta strona zmieni kolor na zielony. Numer identyfikacyjny i grupa badawcza zostaną bezpośrednio przypisane.

PROCEDURY POBIERANIA PRÓBEK Ośrodkom badawczym USOR zostaną dostarczone zestawy do pobierania guzów za pośrednictwem US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Próbki biologiczne będą miały datę wysyłki w ciągu 4 tygodni od podpisania przez pacjenta zgody na włączenie do badania. Tkanka zostanie wysłana do centralnego laboratorium. Szczegóły dotyczące wysyłki zostaną podane w informacjach o badaniach klinicznych (CTI) dostarczonych oddzielnie przez USOR.

Referencyjny podręcznik laboratoryjny dotyczący przygotowania tkanek i instrukcji wysyłki.

ANALIZA PRÓBEK I POUFNOŚĆ Intencją firmy USOR i Quintiles jest zachowanie poufności pacjenta przez cały czas trwania procedury. USOR zachowuje rygorystyczne standardy poufności badań klinicznych, kodując próbki inicjałami pacjentów i unikalnym identyfikatorem (numer UPN/numer identyfikacyjny pacjenta/badania) oraz numer badania. Pacjent jest poddawany badaniu przesiewowemu po podpisaniu ICF i rejestracji w CTMS. Pacjent zostanie uznany za włączony do badania, jeśli dostępna jest standardowa próbka biologiczna do badania biomarkerów z datą wysyłki przypadającą w ciągu 4 tygodni od podpisania przez ICF. Jeśli z jakiegokolwiek powodu próbka biologiczna standardowej opieki jest niedostępna, w ciągu 4 tygodni pacjenta uznaje się za niepowodzenie badania przesiewowego.

OCENA PRÓBKI BIOS Zastosowane zostanie wysokowydajne sekwencjonowanie z wykorzystaniem platformy Life Technologies Ion Torrent lub podobnej alternatywy. Ta metodologia zapewnia wysokiej jakości pokrycie głębokiego sekwencjonowania, idealnie nadające się do wykrywania SNP i analizy mutacji. Analiza identyfikacji mutacji punktowych obejmie ukierunkowane sekwencjonowanie całego egzomu tkanki nowotworowej, które obejmie kilkaset eksonów kodujących ludzkie białka. Wyniki profilowania zostaną skompilowane i uporządkowane zgodnie z istotnością dla praktyki klinicznej. Wszystkie dające się zastosować klinicznie wyniki zostaną przekazane lekarzowi przy użyciu tych samych identyfikatorów, o których mowa powyżej.

NIEPOWODZENIA TESTOWANIA PRÓBEK Próbki przesłane do analizy będą pochodzić z zarchiwizowanej tkanki FFPE. Możliwość wykonania testu AmpliSeq może być ograniczona w zależności od jakości i ilości dostępnej próbki. Przyczyny niepowodzeń testów mogą wynikać z niemożności uzyskania wystarczającej jakości i ilości DNA, niemożności stworzenia biblioteki sekwencjonowania lub niemożności sekwencjonowania próbki. W przypadku niepowodzenia testu, przyczyna niepowodzenia testu zostanie odnotowana przez laboratorium i zgłoszona klinicyście. Pacjent będzie miał możliwość, po omówieniu z lekarzem prowadzącym badanie, w zależności od miejsca w badaniu i zatwierdzenia przez kierownika projektu klinicznego onkologii w USA, ponowne przesłanie jednej dodatkowej próbki do sekwencjonowania. Jeśli próbka pobrana od pacjenta okaże się niepowodzeniem w badaniu po 2 próbach, pacjent jest uznawany za osobę z trwałym niepowodzeniem i nie będzie miał możliwości przesłania żadnych dodatkowych próbek.