Biomarker-Analyse für Patienten mit metastasiertem Darmkrebs (MCC)

Dies ist eine kurzfristige, prospektive Machbarkeitsstudie, um festzustellen, wie effektiv Prüfer eine Biomarker-Analyse von Patienten mit mCRC erhalten können, von denen eine informierte Zustimmung und Genehmigung eingeholt werden. Die Studie wird in Partnerschaft mit Quintiles durchgeführt. Die Forscher werden Daten über die Anzahl der klinisch umsetzbaren Biomarker sammeln, die in jeder Population nachgewiesen werden können, sowie über die Anzahl der in Studien umsetzbaren Marker, die in diesen Populationen nachgewiesen werden können. Bei Patienten mit wiederkehrenden Metastasen (dh Erstdiagnose einer Metastasierung nach Resektion, letzter Bestrahlung oder letzter Chemotherapie im adjuvanten Setting) wird die Primärprobe zur Biomarkeranalyse eingeschickt. Umsetzbare Marker oder genomische Veränderungen sind von der FDA zugelassene begleitende diagnostische Marker und Marker, die für die Aufnahme in Studien bei metastasierendem Darmkrebs verwendet werden. Zusätzliche Informationen zu von der FDA zugelassenen begleitenden diagnostischen Markern und Markern, die für die Studienrekrutierung in anderen Indikationen als mCRC verwendet werden, werden ebenfalls gesammelt und gemeldet.

Bioproben von 25 Patienten mit frühem Wiederauftreten (≤ 12 Monate) und 25 Patienten mit spätem Wiederauftreten (> 12 Monate) ihres metastasierten kolorektalen Karzinoms werden entsprechend entnommen, verarbeitet, versandt und getestet. Die Häufigkeit und Stellen der Mutation können Hypothesen generieren, um bei der Identifizierung der Patienten mit einem höheren Risiko für ein frühes Rezidiv zu helfen und bei der Identifizierung zukünftiger Behandlungsoptionen und bei der Auswahl besserer Behandlungsoptionen für diese Gruppe mit schlechter Prognose zu helfen.

REGISTRIERUNGSVERFAHREN Eine schriftliche Dokumentation der vollständigen, nicht bedingten IRB-Genehmigung muss vorliegen, bevor ein Patient registriert werden kann. Der Registrierungsprozess beginnt, wenn der Koordinator eine unterschriebene Einverständniserklärung erhalten hat. Patientendaten werden in das Clinical Trial Management System (CTMS) aufgenommen; dies ist das webbasierte Intranetsystem für die Bereitstellung von Studieninformationen über USOR. Zu diesem Zeitpunkt wird dem Patienten eine eindeutige Patientennummer (UPN) zugewiesen. Die Aufnahme eines Patienten in CTMS bedeutet nicht, dass der Patient in der Studie registriert wurde.

Sobald der Patient eine UPN-Nummer hat, kann der Koordinator zum Patientenbericht gehen und den zu registrierenden Patienten auswählen. Links neben der UPN des Patienten befinden sich die blauen Buchstaben „Reg“. Der Koordinator klickt auf das blaue „Reg“, um die Patienteninformationen zu öffnen. Jede Seite, die ausgefüllt werden muss, ist gelb. Die Website beantwortet die Fragen auf den Seiten „Inclusions“, „Exclusions“ und „Prestudy Assessment“. Sobald alle Fragen auf jeder Seite beantwortet sind, wird diese Seite grün. Eine ID-Nummer und ein Studienarm werden direkt zugeordnet.

PROBENBESCHAFFUNGSVERFAHREN USOR-Studienzentren werden mit Tumorentnahmekits durch das US Oncology Investigational Product Center (IPC) beliefert.

Bioproben haben ein Versanddatum innerhalb von 4 Wochen nach Unterzeichnung der Einwilligung des Patienten, um in die Studie aufgenommen zu werden. Das Gewebe wird an ein Zentrallabor geschickt. Details zum Versand werden in den Clinical Trials Information (CTI) bereitgestellt, die separat von USOR bereitgestellt werden.

Referenzlaborhandbuch für Gewebevorbereitung und Versandanweisungen.

PROBENANALYSE UND VERTRAULICHKEIT Es ist die Absicht von USOR und Quintiles, dass die Vertraulichkeit der Patienten während des gesamten Verfahrens gewahrt bleibt. USOR hält strenge Vertraulichkeitsstandards für klinische Studien ein, indem Proben mit Patienteninitialen und einer eindeutigen Kennung (UPN-Nummer/Patienten-/Studien-ID-Nummer) und Studiennummer codiert werden. Ein Patient befindet sich nach Unterzeichnung des ICF im Screening und ist im CTMS registriert. Ein Patient gilt als in die Studie aufgenommen, wenn eine Standard-of-Care-Bioprobe für Biomarker-Tests mit einem Versanddatum innerhalb von 4 Wochen nach ICF-Unterzeichnung verfügbar ist. Wenn aus irgendeinem Grund innerhalb von 4 Wochen keine Standard-Bioprobe verfügbar ist, gilt der Patient als Bildschirmversagen.

BEURTEILUNG DER BIOPROBEN Es wird eine Sequenzierung mit hohem Durchsatz unter Verwendung der Ion Torrent-Plattform von Life Technologies oder einer ähnlichen Alternative verwendet. Diese Methodik bietet eine hochwertige Deep-Sequencing-Abdeckung, die sich ideal für die SNP-Erkennung und Mutationsanalyse eignet. Die Analyse zur Identifizierung von Punktmutationen umfasst die gezielte Sequenzierung des gesamten Exoms von Tumorgewebe, das mehrere hundert Exons umfasst, die für menschliche Proteine ​​kodieren. Ergebnisse aus dem Profiling werden zusammengestellt und nach Relevanz für die klinische Praxis geordnet. Alle klinisch verwertbaren Ergebnisse werden dem Arzt unter Verwendung der oben genannten Kennungen zurückgesendet.

FEHLER BEI PROBENTESTS Proben, die zur Analyse eingereicht werden, stammen von archiviertem FFPE-Gewebe. Die Fähigkeit zur Durchführung des AmpliSeq-Tests kann je nach Qualität und Quantität der verfügbaren Probe eingeschränkt sein. Gründe für fehlgeschlagene Tests können darauf zurückzuführen sein, dass DNA nicht in ausreichender Qualität und Menge extrahiert werden kann, keine Sequenzierungsbibliothek erstellt werden kann oder eine Probe nicht sequenziert werden kann. Sollte ein Test fehlschlagen, wird der Grund für den Testfehler vom Labor aufgezeichnet und dem Arzt gemeldet. Ein Patient hat die Möglichkeit, in Absprache mit seinem Studienarzt, je nach Platz in der Studie und Genehmigung durch den US Oncology Clinical Project Manager, eine weitere Probe zur Sequenzierung erneut einzureichen. Wenn eine Probe eines Patienten nach 2 Testversuchen ein Testfehler ist, gilt der Patient als dauerhafter Testfehler und erhält keine Möglichkeit, weitere Proben einzureichen.