Análisis de biomarcadores para pacientes con cáncer colorrectal metastásico (MCC)

Este es un estudio de viabilidad prospectivo a corto plazo para determinar la eficacia con la que los investigadores pueden obtener análisis de biomarcadores en pacientes con mCRC de quienes se obtendrá el consentimiento informado y la autorización. El estudio se realizará en colaboración con Quintiles. Los investigadores recopilarán datos sobre la cantidad de biomarcadores procesables clínicamente que se pueden detectar en cada población y la cantidad de marcadores procesables de prueba que se pueden detectar en estas poblaciones. A los pacientes con enfermedad metastásica recurrente (es decir, primer diagnóstico de enfermedad metastásica después de la resección, última radiación o última quimioterapia en el entorno adyuvante) se les enviará su muestra principal para un análisis de biomarcadores. Los marcadores procesables o las alteraciones genómicas serán marcadores de diagnóstico complementarios aprobados por la FDA y marcadores utilizados para la inscripción en ensayos de cáncer colorrectal metastásico. También se recopilará e informará información adicional sobre los marcadores de diagnóstico complementarios aprobados por la FDA y los marcadores utilizados para la inscripción en ensayos en indicaciones distintas del mCRC.

Las muestras biológicas de 25 pacientes que han tenido recurrencia temprana (≤ 12 meses) y 25 pacientes que han tenido recurrencia tardía (> 12 meses) de su cáncer colorrectal metastásico se recolectarán, procesarán, enviarán y analizarán adecuadamente. La frecuencia y los sitios de mutación pueden generar hipótesis para ayudar a identificar a los pacientes con mayor riesgo de recurrencia temprana y ayudar a identificar futuras opciones de tratamiento y seleccionar mejores opciones de tratamiento para este grupo de mal pronóstico.

PROCEDIMIENTOS DE REGISTRO La documentación escrita de la aprobación completa y no contingente del IRB debe estar archivada antes de que se pueda registrar a un paciente. El proceso de registro comienza cuando el coordinador ha obtenido un consentimiento informado firmado. Los datos demográficos de los pacientes se incluirán en el Sistema de gestión de ensayos clínicos (CTMS); este es el sistema de intranet basado en la web para la entrega de información de prueba a través de USOR. Se le asignará un número de paciente único (UPN) al paciente en ese momento. Ingresar a un paciente en CTMS no significa que el paciente haya sido registrado en el estudio.

Una vez que el paciente tiene un número de UPN, el coordinador puede ir al Informe del paciente y seleccionar el paciente para registrar. A la izquierda del UPN del paciente estarán las letras "Reg" en azul. El coordinador hará clic en el "Reg" azul para abrir la información de ese paciente. Cada página que necesita ser completada estará en amarillo. El sitio responderá las preguntas en las páginas de Inclusiones, Exclusiones y Evaluación previa al estudio. Una vez que se respondan todas las preguntas de cada página, esa página se volverá verde. Se le asignará directamente un número de identificación y un brazo de estudio.

PROCEDIMIENTOS DE ADQUISICIÓN DE MUESTRA Los sitios de estudio de USOR recibirán kits de recolección de tumores a través del Centro de productos de investigación de oncología (IPC) de EE. UU.

Las muestras biológicas tendrán una fecha de envío dentro de las 4 semanas posteriores a la firma del consentimiento del paciente para poder inscribirse en el estudio. El tejido se enviará a un laboratorio central. Los detalles para el envío se proporcionarán en la Información de ensayos clínicos (CTI) proporcionada por separado por USOR.

Manual de laboratorio de referencia para la preparación de tejidos y las instrucciones de envío.

ANÁLISIS DE LA MUESTRA Y CONFIDENCIALIDAD La intención de USOR y Quintiles es mantener la confidencialidad del paciente durante todo el procedimiento. USOR mantiene rigurosos estándares de confidencialidad para los estudios clínicos al codificar las muestras con las iniciales del paciente y un identificador único (número UPN/número de identificación del paciente/estudio) y el número del estudio. Un paciente está en cribado al firmar el ICF y registrado en CTMS. Se considerará que un paciente está inscrito en el estudio si hay disponible una muestra biológica estándar de atención para la prueba de biomarcadores con una fecha de envío dentro de las 4 semanas posteriores a la firma de ICF. Si una muestra biológica estándar de atención no está disponible, por cualquier motivo, dentro de las 4 semanas se considera que el paciente falló en la detección.

EVALUACIÓN DE LAS MUESTRAS DEL BIOS Se utilizará la secuenciación de alto rendimiento utilizando la plataforma Life Technologies Ion Torrent o una alternativa similar. Esta metodología proporciona una cobertura de secuenciación profunda de alta calidad ideal para la detección de SNP y el análisis mutacional. El análisis de identificación de mutaciones puntuales incluirá la secuenciación específica del exoma completo del tejido tumoral que cubrirá varios cientos de exones codificadores de proteínas humanas. Los resultados de la elaboración de perfiles se recopilarán y organizarán según su relevancia para la práctica clínica. Todos los resultados procesables clínicamente se devolverán al médico utilizando los mismos identificadores mencionados anteriormente.

FALLAS EN LAS PRUEBAS DE MUESTRA Las muestras enviadas para análisis serán de tejido FFPE archivado. La capacidad para realizar la prueba AmpliSeq puede estar limitada según la calidad y la cantidad de la muestra disponible. Las razones de las fallas en las pruebas pueden deberse a la incapacidad de extraer suficiente calidad y cantidad de ADN, la incapacidad de crear una biblioteca de secuenciación o la incapacidad de secuenciar una muestra. Si ocurre una falla en la prueba, el laboratorio registrará el motivo de la falla y se lo informará al médico. Un paciente tendrá la oportunidad, en discusión con su médico del estudio, dependiendo del espacio en el estudio y la aprobación del Gerente de Proyecto Clínico de Oncología de EE. UU., de volver a enviar una muestra adicional para la secuenciación. Si una muestra de un paciente falla en la prueba después de 2 intentos de prueba, se considera que el paciente falla permanentemente en la prueba y no se le ofrecerá la oportunidad de enviar muestras adicionales.