Biomarker elemzés áttétes vastag- és végbélrákos (MCC) betegek számára

Ez egy rövid távú, prospektív megvalósíthatósági tanulmány annak meghatározására, hogy a vizsgálók milyen hatékonyan szerezhetnek biomarker-elemzést olyan mCRC-s betegeken, akiktől tájékozott beleegyezést és engedélyt kapnak. A tanulmány a Quintiles-szel együttműködve készül. A kutatók adatokat gyűjtenek az egyes populációkban kimutatható klinikailag hatásos biomarkerek számáról, valamint az ezekben a populációkban kimutatható, kísérletileg hatásos markerek számáról. Azok a betegek, akik visszatérő áttétes betegségben szenvednek (azaz a reszekciót, utolsó sugárkezelést vagy utolsó kemoterápiát követően adjuváns kezelésben az áttétes betegség első diagnosztizálása) elsődleges mintájukat elküldik biomarker elemzésre. A hatásos markerek vagy genomiális változások az FDA által jóváhagyott kísérő diagnosztikai markerek és markerek, amelyeket a metasztatikus vastag- és végbélrák vizsgálatához használnak. Az FDA által jóváhagyott kísérő diagnosztikai markerekkel és az mCRC-től eltérő indikációkban a vizsgálatba való beiratkozáshoz használt markerekkel kapcsolatos további információkat is gyűjtenek és jelentenek.

A metasztatikus vastag- és végbélrák korai kiújulásával (≤ 12 hónapos) és 25 olyan betegtől származó biomintákat kell megfelelően begyűjteni, feldolgozni, szállítani és tesztelni. A mutáció gyakorisága és helye hipotézisgeneráló lehet, hogy segítsen azonosítani azokat a betegeket, akiknél nagyobb a korai kiújulás kockázata, és segít a jövőbeni kezelési lehetőségek azonosításában és a jobb kezelési lehetőségek kiválasztásában ennek a rossz prognosztikai csoportnak.

REGISZTRÁCIÓS ELJÁRÁSOK A teljes, nem feltételes IRB-jóváhagyás írásos dokumentációját nyilvántartásba kell venni, mielőtt a pácienst regisztrálni lehetne. A regisztrációs folyamat akkor kezdődik, amikor a koordinátor aláírt beleegyező nyilatkozatot kapott. A betegek demográfiai adatai bekerülnek a Klinikai Vizsgálat Menedzsment Rendszerébe (CTMS); ez a webalapú intranetes rendszer a próbainformációk továbbítására az USOR-on keresztül. Ekkor egy egyedi páciensszám (UPN) lesz hozzárendelve a pácienshez. A páciens CTMS-be való felvétele nem jelenti azt, hogy a beteget regisztrálták a vizsgálatban.

Miután a páciens rendelkezik UPN-számmal, a koordinátor megnyithatja a betegjelentést, és kiválaszthatja a regisztrálni kívánt pácienst. A páciens UPN-jétől balra kék „Reg” betűk lesznek. A koordinátor rákattint a kék „Reg” gombra a páciens adatainak megnyitásához. Minden kitöltendő oldal sárga színű lesz. A webhely választ ad a Bevételek, Kizárások és az Előzetes értékelés oldalakon található kérdésekre. Amint az egyes oldalakon minden kérdésre megvan a válasz, az oldal zöldre vált. Az azonosító szám és a tanulmányi kar közvetlenül hozzá van rendelve.

MINTABESZERZÉSI ELJÁRÁSOK Az USOR vizsgálati helyszíneit az Egyesült Államok Onkológiai Vizsgálati Termékközpontján (IPC) keresztül daganatgyűjtő készletekkel látják el.

A biospecimensek kiszállítási dátuma 4 héten belül lesz attól az időponttól számítva, amikor a beteg aláírta a beleegyezését, hogy részt vegyen a vizsgálatban. A szövetet egy központi laboratóriumba küldik. A szállítás részleteit a Clinical Trials Information (CTI) tartalmazza, amelyet az USOR külön biztosít.

Referencialaboratóriumi kézikönyv a szövet-előkészítéshez és a szállítási utasításokhoz.

MINTAANALÍZIS ÉS BIZALMASSÁG Az USOR és a Quintiles szándéka, hogy a betegek bizalmas kezelését az eljárás során végig megőrizzék. Az USOR szigorú titoktartási szabványokat tart fenn a klinikai vizsgálatok során, mivel a mintákat páciens kezdőbetűivel, egyedi azonosítóval (UPN-szám/páciens/vizsgálati azonosítószám) és vizsgálati számmal kódolja. A páciens az ICF aláírásával és a CTMS-ben regisztrált szűrésen van. A páciens akkor tekinthető a vizsgálatba bevontnak, ha az ICF aláírását követő 4 héten belül rendelkezésre áll egy standard gondozási biominta a biomarker vizsgálathoz, a szállítási dátummal. Ha a standard ellátási biominta bármilyen okból nem áll rendelkezésre, 4 héten belül a beteg szűrési hibának minősül.

BIOSPECIMEN ÉRTÉKELÉS A Life Technologies Ion Torrent platformot vagy hasonló alternatívát használó nagy áteresztőképességű szekvenálást alkalmazzák. Ez a módszertan kiváló minőségű mély szekvenálási lefedettséget biztosít, amely ideálisan alkalmas SNP kimutatására és mutációs elemzésére. A pontmutáció-azonosítási elemzés magában foglalja a daganatszövet célzott teljes exome szekvenálását, amely több száz humán fehérjét kódoló exont fed le. A profilalkotás eredményeit a klinikai gyakorlat szempontjából való relevancia szerint állítják össze és rendezik el. Minden klinikailag hasznosítható eredményt visszaküldünk az orvosnak a fent hivatkozott azonosítók használatával.

A MINTAVIZSGÁLAT HIBAJAI Az elemzésre benyújtott minták archivált FFPE szövetből származnak. A rendelkezésre álló minta minősége és mennyisége miatt az AmpliSeq-teszt elvégzésének lehetősége korlátozott lehet. A tesztelés kudarcának oka lehet az, hogy nem tud elegendő minőségű és mennyiségű DNS-t kinyerni, nem tud szekvenáló könyvtárat létrehozni, vagy a minta nem képes szekvenálni. A vizsgálat sikertelensége esetén a laboratórium rögzíti a vizsgálati sikertelenség okát, és értesíti a klinikust. A páciensnek lehetősége lesz a vizsgálati orvosával megbeszélve, a vizsgálat helyétől és az Egyesült Államok Onkológiai Klinikai Projektmenedzsere jóváhagyásától függően, hogy ismételten benyújtson egy további mintát szekvenálásra. Ha a pácienstől származó minta 2 vizsgálati kísérlet után sikertelennek bizonyul, a páciens végleges vizsgálati kudarcnak minősül, és nem ajánlják fel neki a lehetőséget további minták benyújtására.