Analisi dei biomarcatori per pazienti con carcinoma colorettale metastatico (MCC)

Si tratta di uno studio di fattibilità prospettico a breve termine per determinare l'efficacia con cui i ricercatori possono ottenere l'analisi dei biomarcatori su pazienti con mCRC dai quali saranno ottenuti il ​​consenso informato e l'autorizzazione. Lo studio sarà svolto in collaborazione con Quintiles. Gli investigatori raccoglieranno dati sul numero di biomarcatori clinicamente utilizzabili che possono essere rilevati in ciascuna popolazione e sul numero di marcatori utilizzabili dalla sperimentazione che possono essere rilevati in queste popolazioni. I pazienti con malattia metastatica ricorrente (ovvero, prima diagnosi di malattia metastatica dopo resezione, ultima radioterapia o ultima chemioterapia nel contesto adiuvante) riceveranno il loro campione primario inviato per un'analisi del biomarcatore. I marcatori attuabili o le alterazioni genomiche saranno marcatori diagnostici di accompagnamento approvati dalla FDA e marcatori utilizzati per l'arruolamento della sperimentazione nel carcinoma colorettale metastatico. Verranno inoltre raccolte e riportate ulteriori informazioni sui marcatori diagnostici di accompagnamento approvati dalla FDA e sui marcatori utilizzati per l'arruolamento della sperimentazione in indicazioni diverse da mCRC.

I campioni biologici di 25 pazienti che hanno avuto una recidiva precoce (≤ 12 mesi) e 25 pazienti che hanno avuto una recidiva tardiva (> 12 mesi) del loro carcinoma colorettale metastatico saranno opportunamente raccolti, processati, spediti e testati. La frequenza e i siti di mutazione possono generare ipotesi per aiutare a identificare i pazienti a più alto rischio di recidiva precoce e aiutare a identificare le opzioni terapeutiche future e selezionare le migliori opzioni terapeutiche per questo gruppo con prognosi sfavorevole.

PROCEDURE DI REGISTRAZIONE La documentazione scritta dell'approvazione IRB completa e non contingente deve essere archiviata prima che un paziente possa essere registrato. Il processo di registrazione inizia quando il coordinatore ha ottenuto un consenso informato firmato. I dati demografici dei pazienti saranno inseriti nel Clinical Trial Management System (CTMS); questo è il sistema intranet basato sul Web per la consegna delle informazioni sulla sperimentazione attraverso USOR. Al paziente verrà assegnato in quel momento un numero di paziente univoco (UPN). L'inserimento di un paziente in CTMS non significa che il paziente sia stato registrato nello studio.

Una volta che il paziente ha un numero UPN, il coordinatore può andare al rapporto paziente e selezionare il paziente da registrare. A sinistra dell'UPN del paziente ci saranno le lettere "Reg" in blu. Il coordinatore farà clic sulla "Reg" blu per aprire le informazioni di quel paziente. Ogni pagina che deve essere completata sarà in giallo. Il sito risponderà alle domande sulle pagine Inclusioni, Esclusioni e Valutazione preliminare. Dopo aver risposto a tutte le domande su ogni pagina, quella pagina diventerà verde. Verranno assegnati direttamente un numero ID e un braccio di studio.

PROCEDURE DI APPROVVIGIONAMENTO DEI CAMPIONI I siti di studio USOR saranno forniti con kit di raccolta del tumore tramite l'US Oncology Investigational Product Center (IPC).

I campioni biologici avranno una data di spedizione entro 4 settimane dalla firma del consenso da parte del paziente per essere arruolati nello studio. Il tessuto verrà inviato a un laboratorio centrale. I dettagli per la spedizione saranno forniti nelle Informazioni sulle sperimentazioni cliniche (CTI) fornite separatamente da USOR.

Manuale di laboratorio di riferimento per la preparazione dei tessuti e le istruzioni per la spedizione.

ANALISI DEL CAMPIONE E RISERVATEZZA È intenzione di USOR e Quintiles mantenere la riservatezza del paziente durante tutta la procedura. USOR mantiene rigorosi standard di riservatezza per gli studi clinici codificando i campioni con le iniziali del paziente e un identificatore univoco (numero UPN/numero ID paziente/studio) e numero dello studio. Un paziente è in screening dopo aver firmato l'ICF e registrato in CTMS. Un paziente sarà considerato arruolato nello studio se un biocampione standard di cura è disponibile per il test dei biomarcatori con una data di spedizione entro 4 settimane dalla firma dell'ICF. Se un biocampione standard di cura non è disponibile, per qualsiasi motivo, entro 4 settimane il paziente viene considerato un fallimento dello screening.

VALUTAZIONE DEL BIOSPECIMEN Verrà utilizzato il sequenziamento ad alto rendimento che utilizza la piattaforma Life Technologies Ion Torrent o un'alternativa simile. Questa metodologia fornisce una copertura di sequenziamento profondo di alta qualità ideale per il rilevamento di SNP e l'analisi mutazionale. L'analisi dell'identificazione delle mutazioni puntiformi includerà il sequenziamento mirato dell'intero esoma del tessuto tumorale che coprirà diverse centinaia di esoni codificanti proteine ​​umane. I risultati della profilazione saranno compilati e organizzati in base alla rilevanza per la pratica clinica. Tutti i risultati clinicamente utilizzabili verranno restituiti al medico utilizzando gli stessi identificatori di cui sopra.

ERRORI DEL TEST DEI CAMPIONI I campioni inviati per l'analisi proverranno da tessuto FFPE archiviato. La capacità di eseguire il test AmpliSeq può essere limitata in base alla qualità e alla quantità del campione disponibile. Le ragioni dei fallimenti dei test possono essere dovute all'incapacità di estrarre qualità e quantità sufficienti di DNA, all'incapacità di creare una libreria di sequenziamento o all'impossibilità di sequenziare un campione. In caso di fallimento del test, il motivo del fallimento del test verrà registrato dal laboratorio e riportato al medico. Un paziente avrà l'opportunità, in discussione con il proprio medico dello studio, a seconda dello spazio nello studio e dell'approvazione da parte del responsabile del progetto clinico oncologico degli Stati Uniti, di inviare nuovamente un campione aggiuntivo per il sequenziamento. Se un campione di un paziente è un fallimento del test dopo 2 tentativi di test, il paziente è considerato un fallimento del test permanente e non verrà offerta l'opportunità di inviare ulteriori campioni.